SCRN1 (secernin 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCRN1
locus group:
protein-coding gene
location:
7p14.3
gene_family:
alias symbol:
KIAA0193
alias name:
None
entrez id:
9805
ensembl gene id:
ENSG00000136193
ucsc gene id:
uc011jzz.3
refseq accession:
NM_014766
hgnc_id:
HGNC:22192
approved reserved:
2004-02-16

基因染色体位置

基因染色体位置

7p14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCRN1（Secernin-1）是一个在细胞分泌过程中起关键作用的基因，属于Secernin基因家族。该家族成员主要参与调控分泌途径，特别是与囊泡运输和胞吐作用相关。SCRN1编码的蛋白质通过与细胞骨架和膜运输蛋白相互作用，促进分泌颗粒的成熟和释放。其主要作用位点包括神经元和内分泌细胞，这些细胞依赖高效的分泌机制传递信号分子（如神经递质和激素）。SCRN1的功能突变可能影响分泌效率，导致神经传递或激素释放异常。例如，在某些神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）中，SCRN1表达异常可能与突触功能障碍有关。此外，SCRN1的过表达可能增强分泌活性，但过度激活可能导致细胞资源耗竭或信号传导紊乱；而降低表达则可能抑制分泌，影响细胞间通讯或机体稳态。Secernin基因家族的共性在于它们均含有保守的Secernin结构域，该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用，参与调控分泌途径的多个环节。研究表明，SCRN1还与某些癌症（如乳腺癌和前列腺癌）的进展相关，可能通过影响肿瘤细胞的分泌表型促进侵袭或转移。总体而言，SCRN1是一个在分泌调控中具有广泛影响的基因，其功能异常可能与多种疾病的发生发展密切相关。

This gene likely encodes a member of the secernin family of proteins. A similar protein in rat functions in regulation of exocytosis in mast cells. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Mar 2009]

该基因可能编码蛋白质的secernin家族的一个成员。类似的蛋白在大鼠功能在肥大细胞胞吐调控。可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的，2009年03月提供]

OMIM数据库中对SCRN1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCRN1基因的介绍

基因序列

基因序列

SCRN1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCRN1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs5883230       rs11975724       rs11981085       rs17158566       rs62446662       rs62446663       rs71528592       rs73305143       rs73686277       rs77861316       rs113553121       rs114293647       rs115833245       rs116271708       rs116399453       rs116750347       rs117774388      

基因表达

基因表达

SCRN1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATGAAGCCATCAACACCA
58
TTCTAAACCAAGCCTGACC
57
CAGTGGAGTGTCTGTCCTG
60
AATATGGACCTGGAAGGATCAG
60
AATGAAGCCATCAACACCA
58
TTCTAAACCAAGCCTGACC
57
GAGTCAACAAGGATGGCTG
59
CAAATACCACCAGACCATCC
58
CTACTCGACGGATGGTCTG
59
AGCCGAGAAATACACAACCT
60
AAAGTCACAGAGGGAGTGAG
59
CGTAACTCCTGAGTTCCGG
60
AGAGATGAAGTGCAAGAGGT
59
TGAAATGTAAGTGCACTCAACC
60
CAGTGGAGTGTCTGTCCTG
60
AATATGGACCTGGAAGGATCAG
60
CAGTGGAGTGTCTGTCCTG
60
AATATGGACCTGGAAGGATCAG
60
AGAGATGAAGTGCAAGAGGT
59
TGAAATGTAAGTGCACTCAACC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCRN1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCRN1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006508
C9K052 (UniProtKB)
IEA
GO:0016805
C9K052 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
Q12765 (UniProtKB)
ND
GO:0005515
Q12765 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q12765 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q12765 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q12765 (UniProtKB)
IEA
GO:0006887
Q12765 (UniProtKB)
ISS
GO:0006887
Q12765 (UniProtKB)
IBA
GO:0016805
Q12765 (UniProtKB)
IEA
GO:0031965
Q12765 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCRN1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Degenerative polyarthritis 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Stomach Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000814326 3 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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