SCYL3 (SCY1 like pseudokinase 3)

symbol:
SCYL3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q24.2
gene_family:
alias symbol:
PACE-1|PACE1
alias name:
ezrin-binding partner PACE-1
entrez id:
57147
ensembl gene id:
ENSG00000000457
ucsc gene id:
uc001ggs.5
refseq accession:
NM_181093
hgnc_id:
HGNC:19285
approved reserved:
2005-03-01
1q24.2
基因染色体位置图

SCYL3(SCY1样蛋白3)属于SCYL基因家族,该家族成员在细胞周期调控、蛋白质运输和信号转导中发挥重要作用。SCYL3编码一种激酶样蛋白,虽然缺乏激酶活性,但通过与其他蛋白质相互作用参与多种生物学过程。SCYL3在细胞内主要定位于高尔基体和内质网,参与囊泡运输和蛋白质分选,对维持细胞内膜系统的完整性至关重要。SCYL3在神经系统中高表达,可能参与神经元发育和突触可塑性调控。研究表明,SCYL3与COPII囊泡的形成有关,影响蛋白质从内质网到高尔基体的运输。SCYL3突变可能导致蛋白质运输障碍,影响细胞功能,但具体致病机制尚不完全清楚。SCYL3表达异常与某些神经系统疾病和癌症有关,过表达可能促进肿瘤细胞增殖和转移,而表达降低则可能影响神经元功能。SCYL基因家族成员(包括SCYL1、SCYL2和SCYL3)都具有保守的N端激酶样结构域,但缺乏催化活性,主要通过蛋白质相互作用发挥功能。家族成员在细胞周期调控和膜运输中具有相似作用,但组织分布和具体功能存在差异。SCYL3与家族其他成员相比,在神经系统中的功能更为突出。目前对SCYL3的研究仍在深入,其在疾病发生发展中的确切作用需要进一步阐明。

This gene encodes a protein with a kinase domain and four HEAT repeats. The encoded protein interacts with the C-terminal domain of ezrin, an ERM protein, and may play a role in cell adhesion and migration. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding multiple isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2012]

该基因编码具有激酶结构域和四个HEAT重复的蛋白质。所编码的蛋白质与埃兹蛋白,一种ERM蛋白的C-末端结构域相互作用,并且可能在细胞粘附和迁移的作用。在多个转录剪接变异体导致编码多种亚型。 [由RefSeq的,2012年6月提供]

SCYL3基因的碱基序列:[NCBI]
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SCYL3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1046058       rs41308405       rs112674836       rs114478179       rs116050318       rs140372793       rs144322041       rs147807072       rs150803153       rs182755716       rs187008028       rs191037390       rs199793803       rs200810095       rs201330447       rs367920603       rs368906832      

SCYL3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCCTTCATGACAGAGGAC
57
TTCCAGTGTCCATCTTCAC
57
AGATGGCAAATTTGCTTCAG
57
GTCTTCAAATGCTTGGCAG
57
TCTTCCTTCATGACAGAGGAC
59
TCCAGTGTCCATCTTCACTC
59
      尚未收录相关数据

SCYL3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCYL3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q8IZE3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IZE3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IZE3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IZE3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8IZE3 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q8IZE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q8IZE3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q8IZE3 (UniProtKB)
IDA
GO:0006468
Q8IZE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016477
Q8IZE3 (UniProtKB)
NAS
GO:0030027
Q8IZE3 (UniProtKB)
IDA
GO:0016301
Q8IZE3 (UniProtKB)
IDA
GO:0004672
X6RHX1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
X6RHX1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
X6RHX1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SCYL3基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Osteoporosis 0.002367032 1 0 GAD

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