SENCR (smooth muscle and endothelial cell enriched migration/differentiation-associated lncRNA)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SENCR
locus group:
non-coding RNA
location:
11q24.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
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None
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100507392
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HGNC:44177
approved reserved:
2012-06-30

基因染色体位置

基因染色体位置

11q24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SENCR（Smooth Muscle and Endothelial Cell-Enriched Long Noncoding RNA）是一种在平滑肌细胞和内皮细胞中高度富集的长链非编码RNA（lncRNA）。它属于长链非编码RNA家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但通过调控基因表达在多种生物学过程中发挥重要作用。SENCR的主要功能包括参与血管平滑肌细胞（VSMC）的分化、增殖和迁移，并在维持血管稳态中起关键作用。研究表明，SENCR通过调控细胞周期相关基因（如CDKN1A和CCND1）的表达来影响VSMC的表型转换，从而在动脉粥样硬化、血管再狭窄等心血管疾病中扮演重要角色。SENCR的突变或异常表达可能导致VSMC功能紊乱，进而促进血管病变的发生发展。例如，SENCR表达降低会增强VSMC的增殖和迁移能力，加剧血管损伤后的病理性重塑；而过表达SENCR则可能抑制这些过程，对血管起到保护作用。此外，SENCR还与其他基因（如MYOCD和SRF）相互作用，共同调节平滑肌细胞的分化和收缩功能。在疾病方面，SENCR的表达水平与冠心病、高血压和糖尿病血管并发症等密切相关，可能成为这些疾病的潜在生物标志物或治疗靶点。SENCR所在的lncRNA家族成员通常具有组织特异性表达模式，并通过染色质修饰、转录调控或作为竞争性内源RNA（ceRNA）等方式影响基因表达网络。尽管SENCR的具体分子机制尚未完全阐明，但其在血管生物学和疾病中的重要性日益受到关注。

None

无

OMIM数据库中对SENCR基因的介绍     Wikipedia数据库中对SENCR基因的介绍

基因序列

基因序列

SENCR基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SENCR基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs555172       rs695113       rs4526784       rs7930515       rs7945814       rs7946747       rs7947081       rs10893909       rs11221436       rs11221437       rs11221439       rs11297250       rs11297251       rs11297252       rs11297253       rs11297254       rs12420823      

基因表达

基因表达

SENCR基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAGAAGAGGCCTTCAGAG
58
CAGAATCCGCTTCGATGAG
58
GGAGATCCAAGTCAATTGGA
57
GTTTGAAGGTCGGTAGAGC
58
ATCAGAAGAGGCCTTCAGAG
58
GAATCCGCTTCGATGAGTG
58
AGGAGATCCAAGTCAATTGGA
59
TTTGAAGGTCGGTAGAGCC
59
GATCAGAAGAGGCCTTCAG
57
GAATCCGCTTCGATGAGTG
59
TCAGAAGAGGCCTTCAGAG
58
GAATCCGCTTCGATGAGTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SENCR基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SENCR基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SENCR基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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