SKAP1 (src kinase associated phosphoprotein 1)

symbol:
SKAP1
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.32
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
SKAP55
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None
entrez id:
8631
ensembl gene id:
ENSG00000141293
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uc002ini.2
refseq accession:
NM_003726
hgnc_id:
HGNC:15605
approved reserved:
2001-06-21
17q21.32
基因染色体位置图

SKAP1(Src激酶相关磷蛋白1,英文全称Src Kinase-Associated Phosphoprotein 1)属于衔接蛋白家族(adaptor protein family),主要参与调控免疫细胞的信号转导,尤其在T细胞和B细胞的激活、黏附及迁移中发挥关键作用。其表达产物是一种支架蛋白,通过与其他信号分子(如SLP-76、Lck、Fyn等)结合,形成复合物来传递T细胞受体(TCR)和整合素介导的信号通路,从而影响免疫细胞的增殖、分化和功能。SKAP1的生物学功能集中在免疫突触(immune synapse)的形成和稳定上,这是T细胞与抗原呈递细胞接触时的重要结构。若SKAP1发生突变(如缺失或功能异常),可能导致T细胞活化障碍,表现为免疫缺陷或自身免疫性疾病风险增加。例如,SKAP1缺失的小鼠模型显示T细胞迁移能力下降,而过度表达可能增强免疫反应,甚至与类风湿性关节炎等炎症性疾病相关。SKAP1属于SKAP基因家族,该家族成员(如SKAP2)均含有同源结构域(如PH域和SH3域),共性是通过蛋白间相互作用调节细胞骨架重组和信号传导。SKAP1表达异常(过高或过低)可能破坏免疫稳态,过表达可能过度激活T细胞引发炎症,而低表达则可能导致免疫应答不足。此外,SKAP1还通过调控整合素活性影响肿瘤微环境,与某些癌症的转移潜力相关。专业术语解释:衔接蛋白(adaptor protein)指连接不同信号分子的桥梁蛋白;免疫突触是免疫细胞间传递信号的接触界面;PH域和SH3域是蛋白中负责结合其他分子的功能模块。目前中文术语“衔接蛋白”和“免疫突触”翻译准确,无需额外标注英文。

This gene encodes a T cell adaptor protein, a class of intracellular molecules with modular domains capable of recruiting additional proteins but that exhibit no intrinsic enzymatic activity. The encoded protein contains a unique N-terminal region followed by a PH domain and C-terminal SH3 domain. Along with the adhesion and degranulation-promoting adaptor protein, the encoded protein plays a critical role in inside-out signaling by coupling T-cell antigen receptor stimulation to the activation of integrins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码T细胞衔接蛋白,一类能够招募更多的蛋白质的模块化域,但表现出没有内在酶活性的细胞内分子。所编码的蛋白质包含一个独特的N末端区域,随后通过一个PH结构域和C-末端SH3结构域。随着粘附和脱粒促进衔接蛋白,编码的蛋白质中由内向外起着至关重要的作用通过T细胞抗原受体刺激耦合到整联的激活信号。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SKAP1基因的碱基序列:[NCBI]
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SKAP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3803858       rs4128439       rs4274478       rs4312351       rs4324172       rs4794603       rs5820693       rs6504158       rs6504160       rs7215143       rs7215843       rs7215877       rs7217664       rs7217741       rs7219985       rs7221510       rs8080544      

SKAP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTGAACTGACCTCCCAG
57
GGTTAAGGAGCTCAGATCCT
58
CTATGGGATTGCCATGGTG
58
ACATGTTATACTCCTTGCTCAG
58
GATAATCACAGCGGGACTC
58
CTTCCATTCCCTCATCCTG
57
ATCAGGATGAGGGAATGGA
57
TCTTCTCCAAGTATCCTTGC
57
ATCAGGATGAGGGAATGGA
57
TCTTCTCCAAGTATCCTTGC
57
AGATTATCAGGATGAGGTAGAGAC
59
GAGATCGAGACCATCCTGG
59
AATCAAAGCCAGGTACTATTGG
59
CCCGCTGTGATTATCATCAG
59
TAACATGTATGGCTGGTGGG
60
TTGGCCTTGAGGTAACCTG
60
AGCTATGAGTTTACAGCTACTAGTC
60
TGGAATGGTTAAGGAGCTCAG
60
TATCAGGATGAGGGAATGGA
57
CTTCTCCAAGTATCCTTGCT
57
      尚未收录相关数据

SKAP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SKAP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002250
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005070
Q86WV1 (UniProtKB)
IBA
GO:0005070
Q86WV1 (UniProtKB)
IC
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005911
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0009967
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0017124
Q86WV1 (UniProtKB)
TAS
GO:0019901
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0019903
Q86WV1 (UniProtKB)
IPI
GO:0032403
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0042101
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0042169
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0045785
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA
GO:0045893
Q86WV1 (UniProtKB)
IMP
GO:0045944
Q86WV1 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
Q86WV1 (UniProtKB)
IMP
GO:0050852
Q86WV1 (UniProtKB)
IMP
GO:0072659
Q86WV1 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SKAP1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of ovary 0.122638474 2 1 BeFree_GAD_GWASCAT
ovarian neoplasm 0.122367032 1 2 CTD_human_GAD
Epithelial ovarian cancer 0.12 1 1 GWASCAT
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Angioimmunoblastic Lymphadenopathy 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Peripheral T-Cell Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Classical Hodgkin's Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Ki-1+ Anaplastic Large Cell Lymphoma 0.000271442 1 0 BeFree
Hairy Cell Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

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