SLC6A11 (solute carrier family 6 member 11)

symbol:
SLC6A11
locus group:
protein-coding gene
location:
3p25.3
gene_family:
Solute carriers
alias symbol:
GAT3
alias name:
GABA transporter 3
entrez id:
6538
ensembl gene id:
ENSG00000132164
ucsc gene id:
uc003bvz.4
refseq accession:
NM_014229
hgnc_id:
HGNC:11044
approved reserved:
1997-12-05
3p25.3
基因染色体位置图

SLC6A11(溶质载体家族6成员11,英文全称Solute Carrier Family 6 Member 11)属于SLC6基因家族,该家族主要编码神经递质转运蛋白,负责通过钠离子和氯离子依赖的方式将神经递质从突触间隙转运回神经元或胶质细胞中。SLC6A11也被称为GAT-3(γ-氨基丁酸转运蛋白3),其主要功能是在中枢神经系统中转运抑制性神经递质γ-氨基丁酸(GABA),从而调节GABA能神经传递。GABA是大脑中主要的抑制性神经递质,参与调控神经元兴奋性,因此SLC6A11通过清除突触间隙的GABA来维持神经信号的平衡。SLC6A11主要表达于大脑的星形胶质细胞中,其作用位点集中在突触周围区域,通过调控GABA的再摄取影响神经元的抑制性信号传导。SLC6A11基因突变可能导致其转运功能异常,进而影响GABA的清除效率,可能引发癫痫、焦虑或其他神经系统疾病。研究表明,SLC6A11的突变或表达异常与某些形式的癫痫和精神障碍相关,因为GABA信号系统的紊乱会直接导致神经元过度兴奋或抑制不足。如果SLC6A11过表达,可能导致突触间隙中GABA被过度清除,从而减少GABA对神经元的抑制作用,可能引发焦虑、失眠或癫痫发作;而如果SLC6A11表达降低,则可能导致GABA在突触间隙积累,增强抑制性信号,可能引起镇静或运动协调障碍。SLC6A11所在的SLC6基因家族成员大多具有类似的跨膜转运蛋白结构,依赖钠离子和氯离子进行底物转运,并且多数参与神经递质(如5-羟色胺、多巴胺、GABA等)的再摄取过程。该家族基因的突变或表达异常通常与神经系统疾病、精神障碍或代谢性疾病相关。

Gamma-aminobutyric acid (GABA) is a major inhibitory neurotransmitter. GABAergic neurotransmission is terminated by the uptake of GABA into the presynaptic terminal and the surrounding astroglial cells by sodium-dependent transporters, such as SLC6A11 (Borden et al., 1994 [PubMed 7874447]).[supplied by OMIM, Nov 2010]

γ-氨基丁酸(GABA)是一个主要的抑制性神经递质。 GABA能神经传递是由GABA的摄取到前突触端和周边星形胶质细胞的钠依赖性转运,如SLC6A11终止(波登等人,1994年[搜索PubMed 7874447])。[由OMIM,2010年11月供给]

SLC6A11基因的碱基序列:[NCBI]
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SLC6A11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs746278       rs901031       rs901032       rs901033       rs1843278       rs1881354       rs1881364       rs1881365       rs2272394       rs2272395       rs2272396       rs2272398       rs2581207       rs2581208       rs2581212       rs2581215       rs2629135      

SLC6A11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTGCTGGATGATCATGAC
58
GTTGTTGTACTTGAGTGGCT
59
CAACAACTGCTACAGGGAC
59
TGAGAAGATGGCAAACCCA
59
TATTTGAAGGCATTGGCTATGC
60
TCAGTAGTGAAGCAGTTGCT
59
TATTTGAAGGCATTGGCTATGC
60
TCAGTAGTGAAGCAGTTGCT
59
GTGCTGGATGATCATGACC
58
GTTGTTGTACTTGAGTGGCT
59
ACAACTGCTACAGGGACTG
59
CTGAGAAGATGGCAAACCC
59
TATTTGAAGGCATTGGCTATGC
60
CAGTAGTGAAGCAGTTGCTC
59
TATTTGAAGGCATTGGCTATGC
60
CAGTAGTGAAGCAGTTGCTC
59
TGCTGGATGATCATGACCC
60
GTTGTTGTACTTGAGTGGCT
59
CAACAACTGCTACAGGGAC
59
GAGAAGATGGCAAACCCAG
59
      尚未收录相关数据

SLC6A11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SLC6A11基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005328
P48066 (UniProtKB)
IEA
GO:0005332
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0005332
P48066 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
P48066 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
P48066 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0006836
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0007268
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0007420
P48066 (UniProtKB)
IEA
GO:0015812
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
P48066 (UniProtKB)
TAS
GO:0042165
P48066 (UniProtKB)
IEA
GO:0042493
P48066 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
P48066 (UniProtKB)
IBA
GO:0055085
P48066 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SLC6A11基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Reperfusion Injury 0.08 1 0 RGD
Seizures 0.08 1 0 RGD
Hyperparathyroidism, Secondary 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Dyskinesia, Drug-Induced 0.002367032 1 0 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.002367032 1 1 GAD
Epilepsy 0.000271442 1 0 BeFree
Intellectual Disability 0.000271442 1 0 BeFree
Schizophrenia 0.000271442 1 6 BeFree

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