SMAGP (small cell adhesion glycoprotein)

symbol:
SMAGP
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.13
gene_family:
alias symbol:
MGC149453|MGC149454|hSMAGP
alias name:
small trans-membrane and glycosyla…
entrez id:
57228
ensembl gene id:
ENSG00000170545
ucsc gene id:
uc001rye.2
refseq accession:
NM_020467
hgnc_id:
HGNC:26918
approved reserved:
2009-09-21
12q13.13
基因染色体位置图

SMAGP(Small Cell Adhesion Glycoprotein)是一种编码细胞表面糖蛋白的基因,其表达产物主要参与细胞间黏附及信号传导过程。该基因在多种上皮组织中表达,尤其在皮肤、肠道和泌尿系统等屏障组织中发挥重要作用。SMAGP通过与其他跨膜蛋白(如整合素或钙黏蛋白)相互作用,帮助维持细胞结构的完整性和组织稳态。其生物学特点包括富含半胱氨酸的结构域,这使其能够形成二硫键稳定蛋白结构,并参与细胞外基质的相互作用。SMAGP基因突变可能导致蛋白功能异常,影响细胞黏附能力,与某些上皮性肿瘤(如膀胱癌和结肠癌)的转移潜能增加相关。此外,SMAGP表达异常还与炎症性肠病(IBD)等屏障功能障碍疾病有关。当SMAGP过表达时,可能增强细胞间黏附,抑制肿瘤细胞的迁移和侵袭,但过度表达也可能干扰正常细胞更新。反之,SMAGP表达降低会削弱细胞连接,增加组织通透性,促进肿瘤转移或慢性炎症的发展。SMAGP属于细胞黏附分子(CAM)基因家族,该家族成员普遍具有介导细胞-细胞或细胞-基质相互作用的功能,参与发育、免疫应答和组织修复等过程。这一家族的共性包括拥有胞外结构域介导识别、跨膜区锚定细胞膜,以及胞内段与细胞骨架或信号分子偶联。目前针对SMAGP的研究仍在深入,其在癌症早期诊断和靶向治疗中的潜在价值受到关注。

None

SMAGP基因的碱基序列:[NCBI]
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SMAGP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1061804       rs2137074       rs2292894       rs11169777       rs13377877       rs13377878       rs59561227       rs60782430       rs76380618       rs114378235       rs116552853       rs117590909       rs140161252       rs140436594       rs142466036       rs143196530       rs146608377      

SMAGP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATTGCAGTTGTTATCACCG
58
TGCCTTTGTTCTTGTACAGG
59
CATTGCAGTTGTTATCACCG
58
TGCCTTTGTTCTTGTACAGG
59
CTCCAAGAGAAGAACTGATGAC
59
TTACCTGCAATGAGTGCTG
58
CTCCAAGAGAAGAACTGATGAC
59
TTACCTGCAATGAGTGCTG
58
CCTGACTACTCCTTCTCCA
57
GTGATAACAACTGCAATGAGTG
58
CATTGCAGTTGTTATCACCG
58
TGCCTTTGTTCTTGTACAGG
59
TTCTCCAAGAGGGTCTCAC
58
CAGTGAGCTGTGATTGTGC
60
CATTGCAGTTGTTATCACCG
58
TGCCTTTGTTCTTGTACAGG
59
CTCCAAGAGGGTCTCACTC
59
GCAGTGAGCTGTGATTGTG
60
TCATTGCAGTTGTTATCACCG
59
GCCTTTGTTCTTGTACAGGT
59
      尚未收录相关数据

SMAGP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SMAGP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004872
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005102
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005913
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0007156
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0007157
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0008037
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0030054
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IDA
GO:0030659
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IEA
GO:0042803
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0050839
Q0VAQ4 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
S4R3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
S4R466 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
S4R466 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
S4R466 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
S4R466 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SMAGP基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree

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