SMAP1 (small ArfGAP 1)

symbol:
SMAP1
locus group:
protein-coding gene
location:
6q13
gene_family:
ArfGAPs
alias symbol:
FLJ13159|SMAP-1
alias name:
None
entrez id:
60682
ensembl gene id:
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ucsc gene id:
uc003pfs.5
refseq accession:
NM_001044305
hgnc_id:
HGNC:19651
approved reserved:
2003-05-22
6q13
基因染色体位置图

SMAP1(Stromal membrane-associated protein 1)是一种编码GTP酶激活蛋白(GAP)的基因,主要参与调控小G蛋白Arf家族的活性,特别是Arf6。SMAP1通过加速Arf6的GTP水解,使其从活性状态(GTP结合)转为非活性状态(GDP结合),从而调控细胞内膜运输、内吞作用和细胞骨架重组等过程。SMAP1在多种组织中表达,尤其在造血系统和免疫细胞中发挥重要作用。SMAP1的突变或功能异常可能导致其GAP活性丧失,进而引起Arf6信号通路失调,影响细胞迁移、囊泡运输和免疫应答。研究发现,SMAP1的缺失或表达降低可能与某些血液系统疾病(如骨髓增生异常综合征)和免疫缺陷相关,而过度表达可能干扰正常的Arf6依赖的细胞功能,如细胞极性建立和受体回收。SMAP1属于TBC(Tre-2/Bub2/Cdc16)结构域蛋白家族,该家族成员通常具有GAP活性,调控Ras超家族小G蛋白(如Rab、Arf等)的活性,参与细胞内运输和信号转导。SMAP1与家族其他成员的共性在于通过TBC结构域促进GTP水解,但其底物特异性不同,SMAP1主要针对Arf6。此外,SMAP1还含有独特的N端结构域,可能参与蛋白质相互作用或亚细胞定位。研究表明,SMAP1在小鼠模型中影响B细胞发育和T细胞功能,提示其在免疫调节中的关键作用。SMAP1的表达水平变化可能影响其他Arf6下游效应分子(如AMAP1/ASAP1)的功能,进而改变细胞迁移或肿瘤转移等过程。总体而言,SMAP1通过精确调控Arf6活性,在细胞动态平衡和疾病发生中扮演重要角色。

The protein encoded by this gene is similar to the mouse stromal membrane-associated protein-1. This similarity suggests that this human gene product is also a type II membrane glycoprotein involved in the erythropoietic stimulatory activity of stromal cells. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是类似于小鼠基质膜相关蛋白-1。这个相似性表明,这种人类基因产物是也参与了基质细胞的促红细胞生成刺激活性II型膜糖蛋白。在多个备选的转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SMAP1基因的碱基序列:[NCBI]
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SMAP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9680       rs510737       rs17707714       rs57035119       rs74705658       rs76029627       rs77015897       rs78069982       rs112217103       rs116050787       rs139424625       rs139514119       rs141688465       rs141775687       rs144134047       rs144234233       rs146238276      

SMAP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGGAAGTGTACATATCACTG
57
AAGAGGAGCATCAGAGGAG
58
AAAGATCAGCAACTGGAGC
58
CAATCTTTCTCCAAACAAGTCC
57
CTCTCACAGATAATGCAGAAGG
59
TTAACCACCTTGTCATTGGC
59
GAATGGTGGGACAAATGGG
59
CTGATTCATCTGTGAGAGGCT
60
TTTAGGACTTGATGGCCCT
58
ATGTCCAGATCATCGTTCAG
57
GAATGGTGGGACAAATGGG
59
CTGATTCATCTGTGAGAGGCT
60
GAATGGTGGGACAAATGGG
59
CTGATTCATCTGTGAGAGGCT
60
AAGAAAGATCAGCAACTGGAG
58
CAATCTTTCTCCAAACAAGTCC
58
GAATGGTGGGACAAATGGG
59
CTGATTCATCTGTGAGAGGC
58
CAAATATTTCCTCCTCTGATGCTC
60
AGCTTGCAGAGAAGGAGAG
59
      尚未收录相关数据

SMAP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SMAP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005096
A0A087X1X9 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
A0A087X1X9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005096
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030276
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0045648
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA
GO:2000369
Q8IYB5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SMAP1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

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