SMPX (small muscle protein X-linked)

symbol:
SMPX
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp22.12
gene_family:
alias symbol:
DFNX4|Chisel|Csl
alias name:
None
entrez id:
23676
ensembl gene id:
ENSG00000091482
ucsc gene id:
uc004daa.4
refseq accession:
NM_014332
hgnc_id:
HGNC:11122
approved reserved:
1999-03-18
Xp22.12
基因染色体位置图

SMPX(small muscle protein, X-linked)基因位于X染色体上,编码一种小型肌肉特异性蛋白,主要在骨骼肌和心肌中表达。其表达产物SMPX蛋白参与维持肌纤维的结构完整性,并可能通过与其他肌节蛋白(如α-肌动蛋白)相互作用调节肌肉收缩功能。该蛋白的特点是分子量较小(约10kDa),含有保守的LIM结构域(一种蛋白质相互作用模块),可能参与细胞骨架组装和机械信号传导。主要作用位点为肌原纤维的Z盘(肌节中横向连接细肌丝的结构)和细胞膜附近。SMPX基因突变与X连锁耳聋-肌病综合征(DFNX4)相关,表现为听力损失和进行性肌无力,其机制可能与肌纤维结构破坏或机械传导异常有关。该基因属于LIM-only(LMOL)基因家族,该家族成员均含有LIM结构域但缺乏其他功能域,主要参与细胞骨架组织和信号转导。当SMPX过表达时,可能干扰肌节蛋白的正常组装,导致肌纤维排列紊乱;而表达降低则可能减弱肌细胞对机械刺激的响应能力,影响肌肉再生。研究发现SMPX与EYA1(听觉发育关键调控因子)存在功能关联,其表达异常可能间接影响内耳毛细胞功能。目前"SMPX"的中文译名尚有争议,部分文献保留英文缩写或译为"X连锁小肌肉蛋白"(原英文:small muscle protein, X-linked)。

This gene encodes a small protein that has no known functional domains. Mutations in this gene are a cause of X-linked deafness-4, and the encoded protein may play a role in the maintenance of inner ear cells subjected to mechanical stress. Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

该基因编码已经没有任何已知的功能结构域的小蛋白质。在这个基因的突变是X连锁耳聋-4的原因,并且所编码的蛋白质可在维持经受机械应力内耳细胞的作用。可变剪接转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的,2011年12月提供]

SMPX基因的碱基序列:[NCBI]
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SMPX基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs869063306       rs781764575       rs781679413       rs781647470       rs781643219       rs781610433       rs781328541       rs781268548       rs781244891       rs781215413       rs781193625       rs781102899       rs780913329       rs780817418       rs780801237       rs780787562       rs780559486      

SMPX基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTGTATTCTTGCATCTGGC
58
TTCATGCAGTCTTATCCCTG
57
GTATTCTTGCATCTGGCTGC
60
GATATTTGCCTGGATGGCTC
59
GAGCTTTGTATTCTTGCATCTG
58
ATGCAGTCTTATCCCTGCT
59
TATTCTTGCATCTGGCTGC
58
GATATTTGCCTGGATGGCTC
59
TATTCTTGCATCTGGCTGC
58
GATATTTGCCTGGATGGCT
58
TTGTATTCTTGCATCTGGCT
58
TATTCATGCAGTCTTATCCCTG
58
      尚未收录相关数据

SMPX基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SMPX基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
Q9UHP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005927
Q9UHP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0006941
Q9UHP9 (UniProtKB)
TAS
GO:0031430
Q9UHP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0043034
Q9UHP9 (UniProtKB)
IBA

可能调控 SMPX基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
DEAFNESS, X-LINKED 4 (disorder) 0.12 0 5 CLINVAR
Hearing Loss, Mixed Conductive-Sensorineural 0.000814326 3 0 BeFree

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