SOCS6 (suppressor of cytokine signaling 6)

symbol:
SOCS6
locus group:
protein-coding gene
location:
18q22.2
gene_family:
SH2 domain containing|Suppressors of cytokine signaling
alias symbol:
CIS4|SSI4|HSPC060|STATI4|STAI4|Cish4
alias name:
None
entrez id:
9306
ensembl gene id:
ENSG00000170677
ucsc gene id:
uc002lkr.2
refseq accession:
NM_004232
hgnc_id:
HGNC:16833
approved reserved:
2002-11-13
18q22.2
基因染色体位置图

SOCS6(Suppressor of Cytokine Signaling 6,细胞因子信号抑制因子6)属于SOCS基因家族,该家族共有8个成员(SOCS1-7和CIS),主要功能是通过负反馈调节细胞因子信号通路(如JAK-STAT通路)来控制免疫反应、细胞增殖和分化。SOCS6通过其SH2结构域结合磷酸化酪氨酸残基,并利用SOCS-box结构域招募泛素连接酶复合物,促进信号蛋白(如胰岛素受体底物IRS)的降解,从而抑制胰岛素/IGF-1信号通路。其表达受细胞因子(如IL-2、IL-4)和生长因子诱导。SOCS6在肝脏、肌肉和脂肪组织中高表达,主要作用于代谢调控节点。突变可能导致其抑制功能丧失,与肥胖、胰岛素抵抗和2型糖尿病相关,动物模型中SOCS6缺失会加剧高脂饮食诱导的代谢紊乱。过表达SOCS6会过度抑制胰岛素信号传导,导致葡萄糖摄取障碍;而低表达则可能引发信号通路过度激活,促进肿瘤发生(如肺癌中SOCS6常因甲基化沉默而表达下调)。SOCS家族共性包括:均含有中央SH2结构域和C端SOCS-box,通过竞争性结合磷酸化受体或靶向降解信号蛋白来负调控细胞因子、激素信号;多数成员具有快速诱导特性以形成反馈抑制环路。目前研究发现SOCS6还可能通过调控mTOR通路影响自噬过程,但其在癌症中的具体作用机制仍存在争议。

The protein encoded by this gene contains a SH2 domain and a CIS homolog domain. The protein thus belongs to the cytokine-induced STAT inhibitor (CIS), also known as suppressor of cytokine signaling (SOCS) or STAT-induced STAT inhibitor (SSI), protein family. CIS family members are known to be cytokine-inducible negative regulators of cytokine signaling. The expression of this gene can be induced by GM-CSF and EPO in hematopoietic cells. A high expression level of this gene was found in factor-independent chronic myelogenous leukemia (CML) and erythroleukemia (HEL) cell lines. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质中含有SH2结构域和一个CIS同源域。因此该蛋白属于细胞因子诱导的STAT抑制剂(CIS),也称为细胞因子信号(SOCS)或STAT诱导的STAT抑制剂(SSI),蛋白质家族的抑制剂。独联体家族成员是已知的细胞因子信号传导的细胞因子诱导型负调节。该基因的表达可以通过GM-CSF和EPO的造血细胞被诱导。这种基因的高表达水平的独立危险因素,慢性粒细胞白血病(CML)和红白血病(HEL)细胞系被发现。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SOCS6基因的碱基序列:[NCBI]
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SOCS6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs176088       rs282900       rs713129       rs713130       rs713131       rs723279       rs900939       rs967607       rs1020161       rs1020162       rs1047654       rs1047657       rs1047668       rs1116263       rs1615400       rs1660106       rs1660107      

SOCS6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCCTCAGGACTACATTCAG
59
CCTTCCAAAGGATACATCCC
58
TGCCTCAGGACTACATTCAG
59
CCTTCCAAAGGATACATCCC
58
ACTGTTAAGTCACATGCCG
58
CGATGGTTGTTGTACTACCA
58
AGACCTGCATCTTCACCTG
59
GTCCTGAGGCATAAGTCCA
59
AGACCTGCATCTTCACCTG
59
GTCCTGAGGCATAAGTCCA
59
CTGTTAAGTCACATGCCGC
60
GCGATGGTTGTTGTACTACC
59
CTCTCACCATTGCTACCTC
57
TGAGTCCACTGAAGTTCCT
58
CTCTCACCATTGCTACCTC
57
TGAGTCCACTGAAGTTCCT
58
CTGTTAAGTCACATGCCGC
60
CGATGGTTGTTGTACTACCA
58
      尚未收录相关数据

SOCS6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SOCS6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001772
O14544 (UniProtKB)
IDA
GO:0004860
O14544 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
O14544 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14544 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14544 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14544 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14544 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
O14544 (UniProtKB)
TAS
GO:0006469
O14544 (UniProtKB)
IBA
GO:0006952
O14544 (UniProtKB)
TAS
GO:0007259
O14544 (UniProtKB)
TAS
GO:0010498
O14544 (UniProtKB)
IMP
GO:0016567
O14544 (UniProtKB)
IEA
GO:0019221
O14544 (UniProtKB)
IBA
GO:0040008
O14544 (UniProtKB)
IEA
GO:0046426
O14544 (UniProtKB)
IBA
GO:0050868
O14544 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SOCS6基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of stomach 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000814326 3 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree
Cancer Cell Growth 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma in situ of uterine cervix 0.000271442 1 0 BeFree

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