SOX15 (SRY-box transcription factor 15)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SOX15
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.1
gene_family:
SRY (sex determining region Y)-boxes
alias symbol:
SOX27|SOX26
alias name:
None
entrez id:
6665
ensembl gene id:
ENSG00000129194
ucsc gene id:
uc002ghz.2
refseq accession:
NM_006942
hgnc_id:
HGNC:11196
approved reserved:
1995-09-15

基因染色体位置

基因染色体位置

17p13.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SOX15（SRY-box transcription factor 15）属于SOX基因家族，该家族以含有SRY（性别决定区Y）同源盒（HMG box）为特征，是一类调控胚胎发育、细胞命运决定和组织分化的转录因子。SOX家族成员通过HMG结构域结合DNA，调控靶基因表达，其功能高度依赖细胞类型和发育阶段。SOX15在多种组织中低水平表达，主要参与肌肉分化、神经发育和生殖细胞调控。其表达产物通过激活或抑制下游基因（如肌源性分化因子MyoD）影响细胞分化进程。突变可能导致SOX15功能丧失，与肌肉发育异常或生育障碍相关，但具体机制尚不明确。目前研究发现，SOX15过表达可促进成肌细胞分化，而表达降低可能抑制肌肉再生，并与某些肌营养不良症有关。SOX家族共性包括：依赖HMG盒结合DNA的AT-rich序列（如CAA/TTGT），参与干细胞多能性维持（如SOX2）、性别决定（SOX9）和神经发育（SOX1-3）。SOX15与疾病关联的研究较少，但SOX家族其他成员（如SOX9突变导致 campomelic dysplasia）的致病性提示其潜在临床意义。若需进一步探讨其分子机制或疾病关联，建议结合具体研究模型。

This gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of the cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional regulator after forming a protein complex with other proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的萨班斯法案的成员（SRY相关HMG盒）家族参与胚胎发育的调节，并在细胞命运的决心转录因子。所编码的蛋白质也可以在形成与其他蛋白质的蛋白复合物后充当转录调节。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对SOX15基因的介绍     Wikipedia数据库中对SOX15基因的介绍

基因序列

基因序列

SOX15基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SOX15基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1048119       rs1048131       rs17637714       rs57400259       rs67420620       rs71387972       rs71831098       rs75619393       rs78125130       rs113959665       rs140417945       rs147007422       rs182730506       rs183985449       rs186059820       rs187014451       rs190521854      

基因表达

基因表达

SOX15基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTACTCGACAGCCTACCTG
59
CTAGGGTCACTCTGAGGGA
59
TGCACAACTCCGAGATCTC
60
GAGGCCGGTACTTGTAGTC
60
CACAACTCCGAGATCTCCA
59
GAGGCCGGTACTTGTAGTC
60
CTACTCGACAGCCTACCTG
59
TAGGGTCACTCTGAGGGAG
59
AGAGGCTTTGGGTACAGAC
59
CAGTTTGCAGTGGGAAGAG
59
AACTCCGAGATCTCCAAGC
59
GAGGCCGGTACTTGTAGTC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SOX15基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SOX15基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0000981
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
O60248 (UniProtKB)
NAS
GO:0003682
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
O60248 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
O60248 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O60248 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O60248 (UniProtKB)
NAS
GO:0005737
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0006325
O60248 (UniProtKB)
NAS
GO:0006355
O60248 (UniProtKB)
NAS
GO:0006357
O60248 (UniProtKB)
TAS
GO:0008584
O60248 (UniProtKB)
TAS
GO:0014718
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0030154
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0043403
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0044798
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0045843
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0045944
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0046982
O60248 (UniProtKB)
IEA
GO:0048627
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:0070318
O60248 (UniProtKB)
ISS
GO:2000288
O60248 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SOX15基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Malignant lymphoma, lymphocytic, intermediate differentiation, diffuse 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Developmental delay (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital Abnormality 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic Neoplasm 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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