SRGN (serglycin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SRGN
locus group:
protein-coding gene
location:
10q22.1
gene_family:
Proteoglycans - ungrouped
alias symbol:
PPG
alias name:
serglycin proteoglycan
entrez id:
5552
ensembl gene id:
ENSG00000122862
ucsc gene id:
uc001joz.4
refseq accession:
NM_002727
hgnc_id:
HGNC:9361
approved reserved:
1988-07-22

基因染色体位置

基因染色体位置

10q22.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SRGN（serglycin）是一种蛋白聚糖基因，属于蛋白聚糖基因家族，主要编码一种富含丝氨酸和甘氨酸的蛋白聚糖核心蛋白。SRGN广泛表达于造血细胞（如肥大细胞、中性粒细胞、血小板）以及某些肿瘤细胞中，其核心蛋白通过共价连接糖胺聚糖（如硫酸软骨素或肝素）形成蛋白聚糖，在细胞内颗粒的组装、储存和分泌过程中起关键作用。SRGN的主要生物学功能包括参与炎症反应、免疫调节和细胞间通讯，它通过与多种蛋白质（如蛋白酶、细胞因子和趋化因子）结合，调节它们的活性和稳定性。SRGN在肥大细胞中尤为重要，它帮助储存和释放组胺、类胰蛋白酶等介质，影响过敏反应和炎症过程。SRGN的突变或表达异常可能导致免疫功能紊乱，例如影响中性粒细胞的脱颗粒过程，从而削弱机体对病原体的防御能力。研究表明，SRGN在多种癌症（如乳腺癌、肺癌、结直肠癌）中过表达，可能通过促进肿瘤细胞迁移、侵袭和血管生成来推动癌症进展。SRGN过表达还与肿瘤微环境的免疫抑制相关，可能通过调节巨噬细胞极化或细胞外基质重塑来支持肿瘤生长。相反，降低SRGN表达可能抑制肿瘤转移并增强化疗敏感性。SRGN属于蛋白聚糖基因家族，该家族成员均含有核心蛋白和糖胺聚糖链，参与细胞外基质构建、细胞信号传导和分子运输等过程。SRGN的独特之处在于其小分子量和高度糖基化特性，使其在细胞内颗粒的包装和分泌中具有特殊作用。此外，SRGN的表达受炎症因子（如TNF-α和IL-1β）调控，在感染或损伤时表达上调，进一步凸显其在免疫和炎症反应中的重要性。

This gene encodes a protein best known as a hematopoietic cell granule proteoglycan. Proteoglycans stored in the secretory granules of many hematopoietic cells also contain a protease-resistant peptide core, which may be important for neutralizing hydrolytic enzymes. This encoded protein was found to be associated with the macromolecular complex of granzymes and perforin, which may serve as a mediator of granule-mediated apoptosis. Two transcript variants, only one of them protein-coding, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

该基因编码最有名的造血细胞颗粒蛋白聚糖的蛋白质。存储在许多造血细胞的分泌颗粒蛋白聚糖还含有蛋白酶抗性肽芯，其可以是中和的水解酶重要。这个编码的蛋白质被发现与颗粒酶和穿孔的大分子复合物，其可作为颗粒介导的凋亡的介导有关。两个转录物变体，只蛋白编码其中之一，已经发现了这种基因。 [由RefSeq的，2010年7月提供]

OMIM数据库中对SRGN基因的介绍     Wikipedia数据库中对SRGN基因的介绍

基因序列

基因序列

SRGN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SRGN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4892       rs7377       rs11182       rs12301       rs12437       rs15330       rs2008541       rs2008553       rs2008753       rs2229498       rs2491024       rs2805906       rs2805907       rs2805908       rs2805909       rs2805911       rs2805912      

基因表达

基因表达

SRGN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAATCCTCAGTTCAAGAAAGAC
57
AGCCTGATCCAGAGTAGTC
58
AGCTACTCAAATGCAGTCG
58
GCGTAGGATAACCTTGAACTG
59
AAGCTACTCAAATGCAGTCG
59
CGTAGGATAACCTTGAACTGAG
58
AGAAGCTACTCAAATGCAGTC
59
CTCGTCTTTCTTGAACTGAGG
59
AGAAGCTACTCAAATGCAGTC
59
TAGGATAACCTTGAACTGAGGA
58
GGAATCCTCAGTTCAAGAAAGAC
60
GCCTGATCCAGAGTAGTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SRGN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SRGN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
P10124 (UniProtKB)
IEA
GO:0002576
P10124 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P10124 (UniProtKB)
IPI
GO:0005518
P10124 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
P10124 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P10124 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
P10124 (UniProtKB)
IDA
GO:0008626
P10124 (UniProtKB)
IDA
GO:0016485
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0030502
P10124 (UniProtKB)
IDA
GO:0031093
P10124 (UniProtKB)
TAS
GO:0031214
P10124 (UniProtKB)
IEA
GO:0033364
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0033368
P10124 (UniProtKB)
IBA
GO:0033371
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0033373
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0033382
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0042588
P10124 (UniProtKB)
IEA
GO:0042629
P10124 (UniProtKB)
ISS
GO:0050710
P10124 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SRGN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Multiple Myeloma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Breast Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000814326 3 0 BeFree
Acute Erythroblastic Leukemia 0.000814326 3 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000542884 2 0 BeFree
Nasopharyngeal carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Acute Promyelocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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