SSPN (sarcospan)

symbol:
SSPN
locus group:
protein-coding gene
location:
12p12.1
gene_family:
alias symbol:
SPN1|SPN2
alias name:
None
entrez id:
8082
ensembl gene id:
ENSG00000123096
ucsc gene id:
uc001rhe.4
refseq accession:
NM_005086
hgnc_id:
HGNC:11322
approved reserved:
1999-03-08
12p12.1
基因染色体位置图

SSPN(Sarcospan)是一种跨膜蛋白,属于四跨膜蛋白家族(Tetraspanin family)的成员,该家族的特征是含有四个跨膜结构域,参与细胞膜上的蛋白质相互作用网络,调控细胞黏附、信号传导和膜稳定性。SSPN主要表达于骨骼肌和心肌细胞膜上,与肌营养不良蛋白糖蛋白复合物(Dystrophin-Glycoprotein Complex, DGC)紧密结合,维持肌肉细胞膜的完整性和机械稳定性。其生物学功能包括稳定肌肉细胞膜、防止运动损伤导致的膜破裂,并参与细胞外基质与细胞骨架的连接。若SSPN发生突变或表达异常,可能导致DGC功能受损,引发肌肉萎缩或肌营养不良症(如杜氏肌营养不良症或贝克型肌营养不良症)。SSPN过表达可能增强肌肉细胞膜的稳定性,潜在缓解某些肌营养不良症状,但过度表达也可能干扰其他四跨膜蛋白的功能平衡。反之,SSPN表达降低会削弱DGC的稳定性,加剧肌肉退行性病变。四跨膜蛋白家族的共性是通过形成多蛋白复合物(如“四跨膜蛋白网络”)调控细胞迁移、融合和信号转导。SSPN作为该家族成员,与其他蛋白(如肌营养不良蛋白和肌聚糖)协同作用,但其特异性在于主要集中于肌肉组织的保护功能。目前针对SSPN的研究可能为肌营养不良症的治疗提供新靶点。

This gene encodes a member of the dystrophin-glycoprotein complex (DGC). The DGC spans the sarcolemma and is comprised of dystrophin, syntrophin, alpha- and beta-dystroglycans and sarcoglycans. The DGC provides a structural link between the subsarcolemmal cytoskeleton and the extracellular matrix of muscle cells. Two alternatively spliced transcript variants that encode different protein isoforms have been described. [provided by RefSeq, Oct 2008]

该基因编码的抗肌萎缩蛋白糖蛋白复合物(DGC)的成员。该DGC跨越肌膜和由抗肌萎缩蛋白,syntrophin,α-和β-dystroglycans和sarcoglycans的。的DGC提供肌膜骨架和肌肉细胞的细胞外基质之间的结构连接。两个编码不同蛋白同种型的可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的,2008年10月提供]

SSPN基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SSPN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1048155       rs1057206       rs1383116       rs1480037       rs1871557       rs3809139       rs3809140       rs4963955       rs4963956       rs7972225       rs11048413       rs61754129       rs74074409       rs74586458       rs74767697       rs76060407       rs76117681      

SSPN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAGGGATCTTCCTGAGCAG
59
AGAAGTCATGACAATGGATCTG
58
ATATCAGGTTGACGAACGGA
59
CACTCAGCAGAAAGTATAACAG
57
ATATCAGGTTGACGAACGGA
59
CACTCAGCAGAAAGTATAACAG
57
TGTACCAGGATTGATGTGCT
59
ACTAAGCAGACCAAGGCTG
60
GGGATCATTGTCTGCTTAGTG
59
TGAATACATGTCCGTTCGTC
58
GGGATCATTGTCTGCTTAGTG
59
TGAATACATGTCCGTTCGTC
58
CTCAGAATCAAGCCATTTGG
57
TAATTATAGCTTGGGAAGGACG
58
TGTACCAGGATTGATGTGC
58
CAAACCGTATCCAAGGCTG
59
ATATCAGGTTGACGAACGG
57
CACTCAGCAGAAAGTATAACAG
57
GGATCATTGTCTGCTTAGTGG
59
TTGAATACATGTCCGTTCGTC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
BTF3
SSPN
Repression

SSPN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SSPN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005887
F5H0K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016010
F5H0K2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
F5H381 (UniProtKB)
IEA
GO:0016010
F5H381 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q14714 (UniProtKB)
IEA
GO:0006936
Q14714 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q14714 (UniProtKB)
TAS
GO:0016010
Q14714 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
Q14714 (UniProtKB)
IEA
GO:0030133
Q14714 (UniProtKB)
IDA
GO:0042383
Q14714 (UniProtKB)
IEA
GO:0045211
Q14714 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SSPN基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of lung 0.004734064 2 0 GAD
Muscular Dystrophy 0.004353001 6 0 BeFree_LHGDN
Fibrosis 0.00272435 1 0 LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Gastritis 0.002367032 1 0 GAD
Renal Cell Carcinoma 0.002367032 1 1 GAD
Muscular Dystrophies, Limb-Girdle 0.000542884 2 0 BeFree
Cardiomyopathies 0.000271442 1 0 BeFree
Mycoses 0.000271442 1 0 BeFree
Severe autosomal recessive muscular dystrophy of childhood - North African type (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。