STAB1 (stabilin 1)

symbol:
STAB1
locus group:
protein-coding gene
location:
3p21.1
gene_family:
alias symbol:
KIAA0246|STAB-1|FEEL-1|CLEVER-1|FELE-1|FEX1|SCARH2
alias name:
MS-1 antigen|fasciclin egf-like, l…
entrez id:
23166
ensembl gene id:
ENSG00000010327
ucsc gene id:
uc003dej.4
refseq accession:
NM_015136
hgnc_id:
HGNC:18628
approved reserved:
2002-09-11
3p21.1
基因染色体位置图

STAB1(Stabilin-1)是一种大型跨膜清道夫受体,属于Stabilin基因家族(包括STAB1和STAB2),主要表达于肝脏窦状内皮细胞、淋巴结内皮细胞和巨噬细胞等。该基因编码的蛋白质具有多种生物学功能,包括参与细胞粘附、内吞作用、免疫调节以及清除凋亡细胞和细胞外基质的降解产物(如透明质酸和乙酰化低密度脂蛋白)。STAB1通过其多个功能域(如Fasciclin、EGF-like和Link结构域)介导配体识别和内化,在维持组织稳态和免疫耐受中起关键作用。STAB1的突变或表达异常可能导致功能紊乱,例如影响其清除凋亡细胞的能力,从而与慢性炎症性疾病、肝纤维化、动脉粥样硬化和某些癌症(如肝细胞癌)的发生发展相关。STAB1过表达可能增强对凋亡细胞的清除能力,但过度激活可能导致免疫抑制或促进肿瘤微环境的形成;而降低表达则可能削弱内吞功能,导致炎症反应加剧或组织修复障碍。STAB1与STAB2在功能上有部分重叠,均参与内吞和免疫调节,但STAB1在透明质酸清除中作用更突出。Stabilin家族成员的共性是具有清道夫受体特性,通过识别多种配体参与体内稳态调控,并在血管生物学和免疫系统中发挥重要作用。

This gene encodes a large, transmembrane receptor protein which may function in angiogenesis, lymphocyte homing, cell adhesion, or receptor scavenging. The protein contains 7 fasciclin, 16 epidermal growth factor (EGF)-like, and 2 laminin-type EGF-like domains as well as a C-type lectin-like hyaluronan-binding Link module. The protein is primarily expressed on sinusoidal endothelial cells of liver, spleen, and lymph node. The receptor has been shown to endocytose ligands such as low density lipoprotein, Gram-positive and Gram-negative bacteria, and advanced glycosylation end products. Supporting its possible role as a scavenger receptor, the protein rapidly cycles between the plasma membrane and early endosomes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码的大,跨膜受体蛋白,其可在血管生成,淋巴细胞归巢,细胞粘附,或受体清除功能。该蛋白含有7 fasciclin,16表皮生长因子(EGF)样,和2层粘连蛋白型EGF样结构域,以及一个C型凝集素样透明质酸结合Link模块。该蛋白质是在肝,脾和淋巴结的窦内皮细胞主要表达。受体已显示内吞的配体,如低密度脂蛋白,革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌,以及高级糖基化终产物。支持其可能角色作为清除剂受体,蛋白质质膜和早期内涵体之间快速循环。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

STAB1基因的碱基序列:[NCBI]
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STAB1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2335930       rs74502329       rs147031278       rs188319151       rs537632542       rs568510050       rs577386972       rs13303       rs13621       rs34005367       rs35800052       rs71297401       rs112096597       rs112837086       rs113523017       rs114309168       rs115820212      

STAB1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCATCAAGAAGCAGACGTG
59
TGGGTTATCTGATCCGGGA
60
TCTATGGGATGCTATTGGGC
60
ACGTGAGCTCATCATCCAG
60
TGATGACGACTTCTCACCG
60
CAGTGAGTCATCGAAGGGT
59
GAAATCCTTACCACAGCGG
59
CAAGGGATGCATTCATGGTC
59
AACCATCATGGAACAAGGC
58
ATTGCCTTTGCCATAGCAG
59
TCTATGGGATGCTATTGGGC
60
ACGTGAGCTCATCATCCAG
60
TAATGAGCAACCTGTCGCA
60
GAGGTATATGCTGCCCTCC
59
TCTACATCCATGACCCAACG
60
AGCCTTGTTCCATGATGGT
59
TCTATGGGATGCTATTGGGC
60
ACGTGAGCTCATCATCCAG
60
CCTTCGATGACTCACTGCT
60
TGCATGCTTCTGCTTTCAG
59
      尚未收录相关数据

STAB1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

STAB1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H7C4W7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005041
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005044
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
Q9NY15 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NY15 (UniProtKB)
IPI
GO:0005540
Q9NY15 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9NY15 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q9NY15 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0006898
Q9NY15 (UniProtKB)
TAS
GO:0006898
Q9NY15 (UniProtKB)
TAS
GO:0006954
Q9NY15 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q9NY15 (UniProtKB)
NAS
GO:0007267
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0015035
Q9NY15 (UniProtKB)
NAS
GO:0016525
Q9NY15 (UniProtKB)
IMP
GO:0030169
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0030666
Q9NY15 (UniProtKB)
TAS
GO:0042742
Q9NY15 (UniProtKB)
IDA
GO:0055114
Q9NY15 (UniProtKB)
IEA

可能调控 STAB1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Juvenile arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Melanoma, B16 0.000271442 1 0 BeFree
Manic 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Kidney Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Bipolar Disorder 0.000271442 1 0 BeFree
tumor vasculature 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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E-mail: product@genelibs.com

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