SYNGR2 (synaptogyrin 2)

symbol:
SYNGR2
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
cellugyrin
entrez id:
9144
ensembl gene id:
ENSG00000108639
ucsc gene id:
uc002juu.2
refseq accession:
NM_001320523
hgnc_id:
HGNC:11499
approved reserved:
1999-03-19
17q25.3
基因染色体位置图

SYNGR2(英文全称Synaptogyrin 2)属于突触小泡蛋白家族,主要参与神经突触的信号传递过程。该基因编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,位于突触小泡膜上,负责调控神经递质的释放和突触可塑性(即神经元之间连接强度的动态调整能力)。其生物学功能包括维持突触小泡的稳定性、促进小泡与细胞膜的融合以及参与神经递质(如多巴胺、谷氨酸等)的释放过程。主要作用位点为中枢神经系统(如大脑皮层、海马体)及外周神经的突触前膜。SYNGR2若发生突变可能导致突触传递异常,与神经系统疾病相关,例如精神分裂症、自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病等。研究发现,该基因的某些突变会干扰突触小泡循环,降低神经递质释放效率,从而影响认知功能和情绪调节。SYNGR2过表达可能引起突触小泡过度积累,导致神经递质释放紊乱,与癫痫发作或运动障碍有关;而表达降低则可能损害突触形成,引发学习记忆缺陷。该基因属于Synaptogyrin基因家族,该家族成员(如SYNGR1、SYNGR3)均含有保守的四次跨膜结构域,共同参与突触小泡的运输和神经信号传导。家族蛋白的共性是调节突触小泡动力学(指小泡在神经元内的移动和融合过程)并影响突触效能。目前中文术语“突触小泡蛋白”为直接翻译(英文synaptic vesicle protein),尚无更优化的译名。

This gene encodes an integral membrane protein containing four transmembrane regions and a C-terminal cytoplasmic tail that is tyrosine phosphorylated. The exact function of this protein is unclear, but studies of a similar rat protein suggest that it may play a role in regulating membrane traffic in non-neuronal cells. The gene belongs to the synaptogyrin gene family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码含有四个跨膜区和C末端胞质尾区即酪氨酸磷酸化整合膜蛋白。这种蛋白的确切功能尚不清楚,但类似的大鼠蛋白质的研究表明,它可在调节在非神经元细胞的膜流量的作用。该基因属于synaptogyrin基因家族。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SYNGR2基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
SYNGR2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs62079091       rs77748600       rs78180043       rs116828679       rs141046882       rs142990725       rs144892250       rs144968923       rs147087676       rs147952765       rs149048148       rs186050254       rs186511382       rs189375418       rs190825079       rs377147802       rs533667864      

SYNGR2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGGTTTCTGCTTCCTCAC
58
TTCTGGATGAAGTCGTCCAC
60
GGTGACCTGCTCTTCTCAG
60
TTCTGGATGAAGTCGTCCA
58
GTGACCTGCTCTTCTCAGG
60
TTCTGGATGAAGTCGTCCA
58
CCTGCTCTTCTCAGCTCTC
60
AAAGAAGCTGAAGGTGATGG
58
CCTGCTCTTCTCAGCTCTC
60
TTCTGGATGAAGTCGTCCAC
60
CCTGCTCTTCTCAGCTCTC
60
TTCTGGATGAAGTCGTCCAC
60
CCTGCTCTTCTCAGCTCTC
60
TTCTGGATGAAGTCGTCCAC
60
CCCTGGACTTTCCCATGAG
60
GGATGGAACAGGTGAAAGAG
58
TTCTCCTGCATCTATGGTGAG
59
TCTGGATGAAGTCGTCCAC
59
TGTTCTCCTGCATCTATGGT
59
CAGTACATCTGCTTAGACTCG
58
      尚未收录相关数据

SYNGR2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYNGR2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
K7EJ35 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
K7ELS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O43760 (UniProtKB)
IPI
GO:0016021
O43760 (UniProtKB)
NAS
GO:0030672
O43760 (UniProtKB)
IBA
GO:0031594
O43760 (UniProtKB)
IBA
GO:0070062
O43760 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43760 (UniProtKB)
IDA

可能调控 SYNGR2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。