SYP (synaptophysin)

symbol:
SYP
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp11.23
gene_family:
X-linked mental retardation
alias symbol:
MRX96
alias name:
None
entrez id:
6855
ensembl gene id:
ENSG00000102003
ucsc gene id:
uc004dmz.2
refseq accession:
NM_003179
hgnc_id:
HGNC:11506
approved reserved:
1990-01-15
Xp11.23
基因染色体位置图

SYP(突触体蛋白,Synaptophysin)是一种位于突触小泡膜上的重要蛋白质,属于突触小泡蛋白家族(Synaptic Vesicle Protein Family)。该家族成员普遍参与神经递质的储存和释放过程,共性包括与突触小泡形成、运输及胞吐作用密切相关。SYP作为突触小泡的标志性蛋白,其生物学功能主要体现在维持突触小泡的结构完整性、调控神经递质释放以及参与突触可塑性(指突触强度随神经活动变化的特性)。它通过与其他蛋白质(如突触结合蛋白Synaptobrevin)相互作用,介导小泡与细胞膜的融合,从而完成神经信号传递。SYP的主要作用位点为中枢及外周神经系统的突触前终末,尤其在神经元密集区域(如大脑皮层、海马)高表达。若SYP发生突变,可能导致突触小泡循环异常、神经递质释放障碍,进而引发癫痫、精神分裂症或神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)。临床中SYP常作为神经内分泌肿瘤(如神经母细胞瘤)的诊断标记物,因其在肿瘤细胞中异常高表达。过表达SYP可能增强突触传递效率,但过度活跃会扰乱神经环路平衡,与自闭症谱系障碍相关;而表达降低则损害突触功能,导致认知障碍或运动失调。此外,SYP表达水平变化可能影响其他突触蛋白(如SNAP-25)的稳定性,进一步干扰突触可塑性。研究还发现SYP与帕金森病中α-突触核蛋白(α-synuclein)的异常聚集存在关联,提示其在神经退行性病变中的潜在作用。

This gene encodes an integral membrane protein of small synaptic vesicles in brain and endocrine cells. The protein also binds cholesterol and is thought to direct targeting of vesicle-associated membrane protein 2 (synaptobrevin) to intracellular compartments. Mutations in this gene are associated with X-linked mental retardation (XLMR). [provided by RefSeq, Aug 2011]

该基因编码的中脑和内分泌细胞小突触小泡的整合膜蛋白。该蛋白质也结合胆固醇和被认为是直接囊泡相关膜蛋白2(小突触)于细胞内区室的定位。在这种基因突变与X连锁精神发育迟滞(XLMR)相关联。 [由RefSeq的,2011年8月提供]

SYP基因的碱基序列:[NCBI]
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SYP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782795226       rs782744072       rs782730663       rs782491513       rs782481686       rs782429855       rs782239118       rs782190288       rs782048394       rs781914486       rs781882625       rs781871318       rs781824505       rs781793044       rs189084190       rs185821821       rs185664352      

SYP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATAACAAAGGGCCCATGCT
60
GCTAACTAGCCACATGAAGG
59
CATGGACGTGGTGAATCAG
59
TGACGTCACAGCTCATCTG
60
CATGGACGTGGTGAATCAG
59
GGTCTTGTTGGCACAATCC
60
GACTCTAGGACTATGTGGCTG
60
AACTAAGAAGACCTTGGTGGT
59
AGCCTGACTATGGTCAACC
59
TTCACTGACCAGACTACATCTG
60
CATGGACGTGGTGAATCAG
59
GGTCTTGTTGGCACAATCC
60
AGCCTGACTATGGTCAACC
59
TTCACTGACCAGACTACATCTG
60
GCTGCAATGGGACTTTCTG
60
ATCTTCACATCTGACAGCCC
60
CATGGACGTGGTGAATCAG
59
GTCTTGTTGGCACAATCCA
59
GCCTGACTATGGTCAACCA
59
TTCACTGACCAGACTACATCTG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
PKNOX1
SYP
Activation
SP1
SYP
Unknown

SYP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SYP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
F2Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
F2Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008021
F2Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
F2Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048168
F2Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
G5E9A2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
G5E9A2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008021
G5E9A2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
G5E9A2 (UniProtKB)
IEA
GO:0048168
G5E9A2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
H7C4W3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
H7C4W3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008021
H7C4W3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C4W3 (UniProtKB)
IEA
GO:0048168
H7C4W3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0006897
P08247 (UniProtKB)
ISS
GO:0008021
P08247 (UniProtKB)
ISS
GO:0015485
P08247 (UniProtKB)
IDA
GO:0016188
P08247 (UniProtKB)
NAS
GO:0030054
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0030285
P08247 (UniProtKB)
IBA
GO:0030285
P08247 (UniProtKB)
NAS
GO:0030672
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0042169
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0042734
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0042802
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
P08247 (UniProtKB)
ISS
GO:0043195
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0043621
P08247 (UniProtKB)
TAS
GO:0048168
P08247 (UniProtKB)
IBA
GO:0048169
P08247 (UniProtKB)
ISS
GO:0048172
P08247 (UniProtKB)
ISS
GO:0048499
P08247 (UniProtKB)
NAS
GO:0048786
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0060076
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:0071310
P08247 (UniProtKB)
IEA
GO:2000474
P08247 (UniProtKB)
ISS

可能调控 SYP基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
MENTAL RETARDATION, X-LINKED 96 0.24 1 0 CTD_human_UNIPROT
Schizophrenia 0.12408156 7 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Mental Retardation, X-Linked 0.12 1 0 CTD_human
CEROID LIPOFUSCINOSIS, NEURONAL, 6 0.12 1 0 CTD_human
Ceroid lipofuscinosis, neuronal 1, infantile 0.12 1 0 CTD_human
Learning Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Memory Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Attention deficit hyperactivity disorder 0.005276948 4 0 BeFree_GAD
Adenocarcinoma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN

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