TAF1L (TATA-box binding protein associated factor 1 like)

symbol:
TAF1L
locus group:
protein-coding gene
location:
9p21.1
gene_family:
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None
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None
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138474
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uc003zrg.1
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NM_153809
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HGNC:18056
approved reserved:
2002-11-13
9p21.1
基因染色体位置图

TAF1L(TATA-box binding protein associated factor 1 like)属于TAF基因家族,该家族成员是转录因子IID(TFIID)复合体的组成部分,在RNA聚合酶II介导的转录起始中起关键作用。TAF1L是TAF1的旁系同源基因,主要在睾丸中表达,可能与精子发生过程相关。TAF1L编码的蛋白质含有多个功能域,包括组蛋白乙酰转移酶(HAT)结构域和双溴结构域,这些结构域参与染色质重塑和转录调控。TAF1L通过与TATA结合蛋白(TBP)和其他TAF蛋白相互作用,帮助招募转录机器到基因启动子区域。TAF1L突变可能导致男性不育,因为其功能异常会影响精子发生相关基因的表达。研究表明TAF1L过表达可能干扰正常TAF1的功能,破坏TFIID复合体的平衡,进而影响广泛的基因转录程序;而TAF1L表达降低则可能导致精子发生障碍。TAF基因家族的共性在于它们都参与形成TFIID复合体,通过与TBP结合协助转录起始,并在组织特异性基因表达调控中发挥作用。TAF1L与TAF1具有相似结构但表现出组织特异性表达模式,这种差异可能反映了基因复制后的功能分化。目前对TAF1L的研究相对有限,但它在男性生殖系统中的特殊表达模式提示其可能成为男性不育研究的潜在靶点。

This locus is intronless, and apparently arose in the primate lineage from retrotransposition of the transcript from the multi-exon TAF1 locus on the X chromosome. The gene is expressed in male germ cells, and the product has been shown to function interchangeably with the TAF1 product. [provided by RefSeq, Aug 2009]

此轨迹是无内含子,并在灵长类动物谱系显然出现从X染色体上的多外显子TAF1轨迹的转录物的反转录。该基因在雄性生殖细胞中表达,并且该产品已被证明与TAF1产物互换功能。 [由RefSeq的,2009年08月提供]

TAF1L基因的碱基序列:[NCBI]
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TAF1L基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs589388       rs10758145       rs10813844       rs10971046       rs10971047       rs16918393       rs16918395       rs17219559       rs34241003       rs34500740       rs34787787       rs35137939       rs35905429       rs45559233       rs55667076       rs55782058       rs55827525      

TAF1L基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTATGATATGCTGGGTGTCTC
58
TCTCAGTTTGAAGCCATAGTC
58
CACTGTCTCAAGATTTATCGCA
59
CACAGCGAACATACTCTTTCC
59
ATTCAAACTGGTGGGTGCT
60
GCTCTGATCTCTTCTTCCGT
59
      尚未收录相关数据

TAF1L基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TAF1L基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q8IZX4 (UniProtKB)
IEA
GO:0004402
Q8IZX4 (UniProtKB)
ISS
GO:0004674
Q8IZX4 (UniProtKB)
ISS
GO:0005575
Q8IZX4 (UniProtKB)
ND
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005669
Q8IZX4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q8IZX4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0006367
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0006367
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0006368
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0006468
Q8IZX4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007140
Q8IZX4 (UniProtKB)
IEP
GO:0016573
Q8IZX4 (UniProtKB)
IEA
GO:0017025
Q8IZX4 (UniProtKB)
IPI
GO:0045893
Q8IZX4 (UniProtKB)
IDA
GO:0070577
Q8IZX4 (UniProtKB)
IDA
GO:1901796
Q8IZX4 (UniProtKB)
TAS

可能调控 TAF1L基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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