TCF19 (transcription factor 19)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TCF19
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
gene_family:
PHD finger proteins
alias symbol:
SC1
alias name:
None
entrez id:
6941
ensembl gene id:
ENSG00000137310
ucsc gene id:
uc063mzg.1
refseq accession:
NM_007109
hgnc_id:
HGNC:11629
approved reserved:
1995-08-14

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TCF19（转录因子19，Transcription Factor 19）是一种参与细胞周期调控和免疫反应的转录因子，属于TATA框结合蛋白相关因子（TBP-associated factors，TAFs）基因家族。该家族成员通常与RNA聚合酶II转录复合物相互作用，调控基因表达。TCF19在多种组织中表达，尤其在免疫系统和增殖活跃的细胞（如干细胞或癌细胞）中表达较高。其生物学功能包括调控细胞周期进程（如G1/S期转换）和维持基因组稳定性。TCF19通过结合特定DNA序列或与其他蛋白（如E2F家族转录因子）相互作用，影响下游靶基因（如细胞周期蛋白依赖性激酶CDK2/4）的表达，从而控制细胞增殖。突变或异常表达可能导致功能紊乱：例如，TCF19单核苷酸多态性（SNPs）与1型糖尿病、类风湿性关节炎等自身免疫疾病风险相关，可能通过改变免疫细胞活性或炎症因子分泌；而在癌症（如肝癌、胶质瘤）中，TCF19常过表达，促进肿瘤细胞无限增殖。过表达时可能加速细胞周期并抑制凋亡，导致组织过度生长或肿瘤发生；反之，低表达可能引发细胞周期阻滞或衰老。TCF19与同家族成员（如TAF1、TAF7）共享核心功能，即参与转录起始复合物的组装，但各成员具有组织特异性或靶基因偏好性。目前研究仍在探索其精确机制及作为疾病标志物或治疗靶点的潜力。专业术语解释：转录因子（调控基因开关的蛋白质）、单核苷酸多态性（DNA序列微小变异）、细胞周期（细胞生长分裂的循环过程）。英文注释：SNPs（Single Nucleotide Polymorphisms）、CDK（Cyclin-Dependent Kinase）。

This gene encodes a protein that belongs to the Plant Homeo Domain finger family of transcription factors. The encoded protein is thought to function during the G1/S transition in the cell cycle. Alternate splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2013]

这个基因编码属于植物Homeo域手指家族的转录因子的蛋白质。所编码的蛋白质被认为是在细胞周期的G1 / S期过渡过程中发挥作用。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年9月提供]

OMIM数据库中对TCF19基因的介绍     Wikipedia数据库中对TCF19基因的介绍

基因序列

基因序列

TCF19基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TCF19基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs720465       rs720465       rs720465       rs720465       rs720465       rs720465       rs720466       rs720466       rs720466       rs720466       rs720466       rs720466       rs720467       rs720467       rs720467       rs720467       rs720467      

基因表达

基因表达

TCF19基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCATCTCTGGGATCCACG
59
GACCAAAGTACCTTGGCTG
59
ACATCCAAGGGATGCAGAG
60
TTAGGATGCCTCTTCATAACCT
59
TGACTCCCACTGGAAATCG
59
ATGGAACCAGACGTCACAG
60
CTCATCTCTGGGATCCACG
59
GACCAAAGTACCTTGGCTG
59
CATGTTCCAACAACCTCAGC
60
AGATTTCCTCCGATTGCGT
60
GACTCCCACTGGAAATCGA
59
ATGGAACCAGACGTCACAG
60
ACATCCAAGGGATGCAGAG
60
TAGGATGCCTCTTCATAACCTG
60
TGTTCCAACAACCTCAGCA
60
CAGATTTCCTCCGATTGCG
59
CAGCCAAGGTACTTTGGTC
59
CCAAAGGTCAGGAGGTCTC
59
CAGCCAAGGTACTTTGGTC
59
CCAAAGGTCAGGAGGTCTC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
TCF19
CCNE1
Repression
15051733

基因本体信息

TCF19基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TCF19基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A0A0G2JIJ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
D2IYK5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
D2IYK5 (UniProtKB)
IPI
GO:0008270
D2IYK5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q9Y242 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q9Y242 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q9Y242 (UniProtKB)
IEA
GO:0006357
Q9Y242 (UniProtKB)
TAS
GO:0008270
Q9Y242 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q9Y242 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TCF19基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hepatitis B, Chronic 0.120271442 3 1 BeFree_GWASCAT
Idiopathic Membranous Glomerulonephritis 0.12 1 1 GWASCAT
Colonic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Lupus Erythematosus, Systemic 0.007101096 2 1 GAD
Spontaneous abortion 0.002367032 1 0 GAD
Multiple Sclerosis 0.002367032 1 1 GAD
Behcet Syndrome 0.002367032 1 1 GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.000271442 1 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree
insulinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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