TCN2 (transcobalamin 2)

symbol:
TCN2
locus group:
protein-coding gene
location:
22q12.2
gene_family:
alias symbol:
D22S676|D22S750|TC2
alias name:
macrocytic anemia
entrez id:
6948
ensembl gene id:
ENSG00000185339
ucsc gene id:
uc003aip.3
refseq accession:
NM_000355
hgnc_id:
HGNC:11653
approved reserved:
2001-06-22
22q12.2
基因染色体位置图

TCN2(Transcobalamin 2,转钴胺素2)是一种编码维生素B12(钴胺素)转运蛋白的基因,属于维生素B12结合蛋白家族。其主要功能是将维生素B12从肠道吸收后运输至全身各组织,尤其是快速分裂的细胞(如骨髓中的造血细胞)。TCN2的表达产物是一种血浆蛋白,与维生素B12结合形成复合物(holo-TC),通过受体介导的内吞作用被细胞摄取。该基因的作用位点包括肝脏、肠道和血液系统。TCN2突变可能导致维生素B12转运障碍,引发巨幼细胞性贫血(megaloblastic anemia)、神经系统损伤(如脊髓亚急性联合变性)或发育迟缓,因为维生素B12是DNA合成和髓鞘形成的关键辅因子。与TCN2相关的疾病包括遗传性转钴胺素缺乏症(OMIM 275350)和某些同型半胱氨酸血症病例。若TCN2过表达,可能增加维生素B12的利用率,但过量可能干扰其他微量营养素的平衡;若表达降低则会导致功能性维生素B12缺乏,即使血液中B12水平正常。TCN2属于维生素B12结合蛋白家族,该家族成员(如TCN1、TCN2)均能结合B12,但TCN2是唯一具有细胞递送功能的蛋白。家族共性包括含有特定的B12结合结构域和参与B12代谢调控。研究还发现TCN2多态性(如776C>G)可能影响B12代谢效率,与心血管疾病和神经退行性疾病风险相关。

This gene encodes a member of the vitamin B12-binding protein family. This family of proteins, alternatively referred to as R binders, is expressed in various tissues and secretions. This plasma protein binds cobalamin and mediates the transport of cobalamin into cells. This protein and other mammalian cobalamin-binding proteins, such as transcobalamin I and gastric intrisic factor, may have evolved by duplication of a common ancestral gene. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, May 2010]

None

TCN2基因的碱基序列:[NCBI]
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TCN2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2240433       rs5749131       rs5753228       rs5753229       rs5753230       rs5753231       rs5997702       rs7289549       rs9609017       rs9609018       rs9621047       rs13058138       rs16988823       rs16988828       rs28704032       rs34471369       rs56014090      

TCN2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATGATTTCCCAGCTGCTG
59
GTTCCAACATGACTCGTGG
59
GTCATGTTGGAACCAGCTG
59
CCTGTGTTTCATATGTGAATCCTC
60
TCAAGCTTGGTTACCAGCA
60
CTTGTGATCATGCCAGTTGG
60
GATTCTTGCTCACTGCTCAC
59
GTCCATCTCTGGTATTTCACAC
59
CCAACTGTGAGTTTGTCAGG
59
TTGTGATCATGCCCAATGG
59
GACAGTCCATCTCTGTTCTG
58
GTGTTTCATATGTGAATCCTCC
57
CATGATTTCCCAGCTGCTG
59
GTTCCAACATGACTCGTGG
59
CCAACTGTGAGTTTGTCAGG
59
TTGTGATCATGCCCAATGG
59
CCAACTGTGAGTTTGTCAGG
59
TTGTGATCATGCCCAATGG
59
AGTCCATCTCTGTTCTGGC
59
CTGTGTTTCATATGTGAATCCTCC
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SP1
TCN2
Unknown
SP3
TCN2
Unknown
USF1
TCN2
Unknown
USF2
TCN2
Unknown

TCN2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TCN2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015889
B5MBX2 (UniProtKB)
IEA
GO:0031419
B5MBX2 (UniProtKB)
IEA
GO:0015889
F8WE86 (UniProtKB)
IEA
GO:0031419
F8WE86 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P20062 (UniProtKB)
IEA
GO:0005768
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005768
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0005768
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0006824
P20062 (UniProtKB)
IEA
GO:0009235
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0015889
P20062 (UniProtKB)
IEA
GO:0031419
P20062 (UniProtKB)
IDA
GO:0043202
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0043202
P20062 (UniProtKB)
TAS
GO:0046872
P20062 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P20062 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TCN2基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Transcobalamin II deficiency 0.360271442 1 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET
Cleft Lip 0.127458414 3 0 CTD_human_GAD_LHGDN
Anemia, Megaloblastic 0.123538676 4 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Autistic Disorder 0.12 1 0 CTD_human
Adverse reaction to drug 0.12 1 0 CTD_human
Adenoma 0.12 1 0 CTD_human
Leukoencephalopathies 0.12 1 0 CTD_human
Nephroblastoma 0.12 1 1 GWASCAT
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human

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