TDRD6 (tudor domain containing 6)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TDRD6
locus group:
protein-coding gene
location:
6p12.3
gene_family:
Tudor domain containing
alias symbol:
NY-CO-45|bA446F17.4|CT41.2|SPATA36
alias name:
cancer/testis antigen 41.2|spermat…
entrez id:
221400
ensembl gene id:
ENSG00000180113
ucsc gene id:
uc010jze.3
refseq accession:
NM_001010870
hgnc_id:
HGNC:21339
approved reserved:
2003-11-27

基因染色体位置

基因染色体位置

6p12.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TDRD6（Tudor domain-containing protein 6）是一种含有Tudor结构域的蛋白质，属于TDRD基因家族。TDRD家族成员通常含有Tudor结构域，这是一种能够识别甲基化组蛋白或RNA结合蛋白的结构域，在生殖细胞发育、RNA代谢和表观遗传调控中发挥重要作用。TDRD6主要在睾丸中高表达，特别是在精母细胞和精子细胞中，参与精子发生过程中的piRNA通路调控。piRNA是一类小非编码RNA，在沉默转座子和维持基因组稳定性中起关键作用。TDRD6通过与PIWI蛋白（如MILI和MIWI2）相互作用，参与piRNA生物发生和功能调控，从而影响转座子沉默和精子发生。TDRD6突变或功能缺失可能导致男性不育，因为其功能异常会破坏piRNA通路，导致转座子激活、DNA损伤和精子发生障碍。研究表明，TDRD6缺失的小鼠表现为精子发生停滞和生育力下降。TDRD6的过表达可能干扰正常的piRNA通路平衡，影响其他TDRD家族成员（如TDRD1或TDRD9）的功能，导致生殖细胞发育异常。TDRD6的表达水平变化还可能影响其他与精子发生相关的基因，如DAZL和SYCP3。TDRD6与某些男性不育症相关，但其在人类疾病中的具体作用仍需进一步研究。TDRD基因家族的共性在于它们大多参与生殖细胞发育和表观遗传调控，尤其是通过Tudor结构域与甲基化蛋白或RNA结合，调控染色质结构和基因表达。TDRD6作为该家族的重要成员，其功能研究有助于理解男性不育的分子机制和piRNA通路的生物学意义。

None

无

OMIM数据库中对TDRD6基因的介绍     Wikipedia数据库中对TDRD6基因的介绍

基因序列

基因序列

TDRD6基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TDRD6基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3799277       rs7750596       rs7750818       rs7751263       rs7754945       rs9369630       rs9472819       rs10948299       rs11961117       rs13196132       rs35028991       rs41273658       rs41273660       rs45610733       rs60607361       rs70996385       rs73471190      

基因表达

基因表达

TDRD6基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
59
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
59
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
58
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
58
GTTCTCTGAGGAAGAAAGCAG
59
GTGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
59
GGAGGAGATAGTGAACCCT
58
CTTTGGGATACAGCCTCAG
58
TGGAGGAGATAGTGAACCCT
59
TTTGGGATACAGCCTCAGG
59
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
58
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
58
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
59
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
59
TGCCTTTGTTCTCTGAGGA
59
GTAGTTGAGCTGAGATATGATCTG
59
TGTTCTCTGAGGAAGAAAGC
57
TGTTCTGTAGTTGAGCTGAG
57
AGGAGATAGTGAACCCTGAG
58
CTCTTTGGGATACAGCCTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TDRD6基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TDRD6基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
O60522 (UniProtKB)
ISS
GO:0007275
O60522 (UniProtKB)
IEA
GO:0007283
O60522 (UniProtKB)
ISS
GO:0030154
O60522 (UniProtKB)
IEA
GO:0033391
O60522 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TDRD6基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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