TF (transferrin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TF
locus group:
protein-coding gene
location:
3q22.1
gene_family:
Transferrins
alias symbol:
PRO1557|PRO2086
alias name:
serotransferrin
entrez id:
7018
ensembl gene id:
ENSG00000091513
ucsc gene id:
uc003epv.2
refseq accession:
NM_001063
hgnc_id:
HGNC:11740
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

3q22.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TF（转录因子，Transcription Factor）是一类能够结合特定DNA序列以调控基因表达的蛋白质，属于基因表达调控的核心分子。转录因子通常包含DNA结合结构域（识别特定序列如启动子或增强子）和转录调控结构域（激活或抑制靶基因转录）。根据结构特征，TF可分为多个家族，如锌指蛋白（ZFP）、碱性亮氨酸拉链（bZIP）、同源框（Homeobox）和核受体（NR）家族等。这些家族成员共享类似的结构模体（如锌指或螺旋-环-螺旋），但调控的靶基因和生物学功能各异。 TF的生物学功能广泛，涉及细胞增殖、分化、凋亡、代谢及免疫应答等。例如，p53（肿瘤抑制因子）调控DNA修复相关基因，而NF-κB（核因子κB）参与炎症反应。若TF发生突变，可能导致功能丧失（如p53突变引发癌症）或功能获得（如RUNX1突变导致白血病）。某些疾病与TF异常直接相关，如FOXP2突变与语言障碍，PAX6突变与小眼症。 过表达TF可能扰乱正常基因网络，如c-Myc过表达促进细胞癌变；而表达降低可能导致发育缺陷（如SOX9低表达引致性别发育异常）。TF还通过调控其他基因形成级联反应，例如HIF-1（缺氧诱导因子）在低氧时激活血管生成基因VEGF。此外，TF间存在相互作用，如AP-1与NF-κB协同调控炎症因子。 基因家族共性方面，同一家族TF通常具有保守的结构域和相似的DNA结合特性，但功能可能分化。例如，同源框家族（Homeobox）成员调控胚胎发育，但不同成员负责特定体节的形成。术语解释：启动子（Promoter，基因转录起始区域）、增强子（Enhancer，远程调控序列）、结构域（Domain，蛋白质功能单元）。若中文术语不明确，可标注英文（如“转录因子”对应Transcription Factor）。

This gene encodes a glycoprotein with an approximate molecular weight of 76.5 kDa. It is thought to have been created as a result of an ancient gene duplication event that led to generation of homologous C and N-terminal domains each of which binds one ion of ferric iron. The function of this protein is to transport iron from the intestine, reticuloendothelial system, and liver parenchymal cells to all proliferating cells in the body. This protein may also have a physiologic role as granulocyte/pollen-binding protein (GPBP) involved in the removal of certain organic matter and allergens from serum. [provided by RefSeq, Sep 2009]

该基因编码与76.5千道尔顿的近似分子量的糖蛋白。它被认为是已经被作为一个古老基因复制事件，导致生成同源C和每一个结合三价铁的一种离子的N-末端结构域的结果而创建。该蛋白的功能是从肠，网状内皮系统，以及肝实质细胞运输铁在体内所有增殖细胞。这种蛋白也可以具有作为粒细胞/花粉结合蛋白（GPBP）参与除去某些有机物和从血清过敏原的生理作用。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对TF基因的介绍     Wikipedia数据库中对TF基因的介绍

基因序列

基因序列

TF基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TF基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7845       rs8649       rs11877       rs12469       rs12595       rs12769       rs1005933       rs1006097       rs1006098       rs1049296       rs1115219       rs1130459       rs1130465       rs1130537       rs1358021       rs1358022       rs1358023      

基因表达

基因表达

TF基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCCTCCTACCTTGATTGC
60
ATCCAGTGTCACAGCATCC
60
AACAGCAGCACCTATTTGG
59
CAGAAGGTCCTTGGTTTCC
58
TTGCTGTGGTGAAGAAGGA
59
AAATTGGCCACTGCTTTCTC
60
AACTGTGAGATGGTGTGCA
60
GTATGAGAAGGGACCATCGG
60
TGTAAGCTGTGTATGGGCTC
60
CAACCAGACACCTGAAAGC
59
TTGGTGTATGATGCTTACCTG
58
CATAGAACTCTGCCACCAC
58
TGTATGATGCTTACCTGGC
57
AATAGAAAGTCTGTGGATCCTC
57
GTATGATGCTTACCTGGCTC
58
AATAGAAAGTCTGTGGATCCTC
57
GTTGCTGTGGTGAAGAAGG
59
AATTGGCCACTGCTTTCTC
59
TAAGCTGTGTATGGGCTCAG
60
CAACCAGACACCTGAAAGC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
DDIT3
TF
Unknown
12939601
NFKB1
TF
Activation
12744731
NFKB1
TF
Unknown
22119392
RELA
TF
Activation
12744731
RELA
TF
Unknown
22119392
SP1
TF
Unknown
8548503
TFCP2
TF
Activation
20796026
YY1
TF
Unknown
8548503

基因本体信息

TF基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TF基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005576
C9JVG0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
H7C5E8 (UniProtKB)
IEA
GO:0001895
P02787 (UniProtKB)
IEP
GO:0002576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005615
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005769
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005770
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0005905
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0006879
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0008198
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0008199
P02787 (UniProtKB)
IEA
GO:0009925
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0010008
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0015091
P02787 (UniProtKB)
IEA
GO:0016023
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0016324
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0030139
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0030139
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0031232
P02787 (UniProtKB)
IGI
GO:0031647
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0031982
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0033572
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0034774
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:0045178
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0048260
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0048260
P02787 (UniProtKB)
IGI
GO:0048471
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0048471
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0055037
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0055072
P02787 (UniProtKB)
IC
GO:0070062
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0071281
P02787 (UniProtKB)
IGI
GO:0072562
P02787 (UniProtKB)
IDA
GO:0097460
P02787 (UniProtKB)
IGI
GO:1990459
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:1990459
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:1990459
P02787 (UniProtKB)
TAS
GO:1990459
P02787 (UniProtKB)
IPI
GO:1990712
P02787 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TF基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Congenital atransferrinemia 0.440271442 4 0 BeFree_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Hepatitis 0.2 2 0 CTD_human_RGD
Obesity 0.2 2 0 CTD_human_RGD
Liver Cirrhosis, Experimental 0.16 2 0 CTD_mouse_RGD
Alzheimer's Disease 0.158587148 15 0 CTD_human_GAD_LHGDN
Inflammation 0.122367032 1 1 CTD_human_GAD
Nephrotic Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.12 2 0 CTD_human
Paratuberculosis 0.12 1 0 CTD_human
Autistic Disorder 0.12 1 0 CTD_human

基因相关服务

基因相关服务

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