TIAM2 (TIAM Rac1 associated GEF 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TIAM2
locus group:
protein-coding gene
location:
6q25.2-q25.3
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing|Rho guanine nucleotide exchange factors
alias symbol:
STEF
alias name:
Sif and Tiam1-like exchange factor
entrez id:
26230
ensembl gene id:
ENSG00000146426
ucsc gene id:
uc003qqb.3
refseq accession:
NM_012454
hgnc_id:
HGNC:11806
approved reserved:
1999-12-02

基因染色体位置

基因染色体位置

6q25.2-q25.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TIAM2（T细胞淋巴瘤侵袭转移蛋白2）是一种鸟苷酸交换因子（GEF），属于TIAM基因家族（包括TIAM1和TIAM2），该家族成员通过激活Rho家族小G蛋白（如Rac1和Cdc42）调控细胞骨架重组、细胞迁移和粘附等过程。TIAM2主要在大脑、睾丸和某些癌细胞中高表达，其表达产物通过Rac1信号通路促进细胞极性形成、神经突生长和突触可塑性，在神经发育和肿瘤转移中起关键作用。TIAM2的功能位点包括DH结构域（负责GEF活性）和PDZ结构域（介导蛋白相互作用）。突变可能导致其GEF活性丧失，影响下游信号传导，例如错义突变与智力障碍和神经发育异常相关，而过度激活突变可能促进肿瘤侵袭。TIAM2过表达会增强细胞迁移能力，与胶质瘤、乳腺癌等恶性肿瘤的转移相关，同时可能通过异常激活Rac1导致神经元过度生长；表达降低则可能损害神经突触形成和学习记忆功能。该基因家族共性为含有保守的DH-PH结构域模块（催化RhoGTPase的GDP/GTP交换）和调控细胞运动的功能。目前研究还发现TIAM2与阿尔茨海默病存在关联，其表达下调可能加剧β-淀粉样蛋白毒性。需要注意的是，"鸟苷酸交换因子"英文为guanine nucleotide exchange factor（GEF），"突触可塑性"英文synaptic plasticity。

This gene encodes a guanine nucleotide exchange factor. A highly similar mouse protein specifically activates ras-related C3 botulinum substrate 1, converting this Rho-like guanosine triphosphatase (GTPase) from a guanosine diphosphate-bound inactive state to a guanosine triphosphate-bound active state. The encoded protein may play a role in neural cell development. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码一个鸟嘌呤核苷酸交换因子。一个高度类似鼠标蛋白特异性激活Ras相关C3肉毒杆菌衬底1，从二磷酸鸟苷结合不活动状态转换的Rho这种类似鸟苷三磷酸（GTP酶）到三磷酸鸟苷结合的活动状态。所编码的蛋白质可能在神经细胞的发育中起作用。编码不同同种型的可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TIAM2基因的介绍     Wikipedia数据库中对TIAM2基因的介绍

基因序列

基因序列

TIAM2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TIAM2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3940       rs9702       rs1041474       rs1048584       rs1048587       rs1108371       rs1331212       rs1331213       rs1571766       rs1571767       rs1967872       rs1984028       rs2274823       rs2274824       rs2274825       rs2989457       rs2989458      

基因表达

基因表达

TIAM2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAATACAGCCAATGAGTGCT
58
GAGGATCCTGATTCTCCCG
59
TTCCTAAGTGCTGATGGCA
59
GGACGTGTGACATCTTATCC
58
AAAGGAAACTCCAGGAGCC
60
TGCACATCTGTATTCAGTCCA
60
AAAGGAGTCAGACAGATGGC
60
GCACCGAAATAGAATGCCTG
60
AAAGGAAACTCCAGGAGCC
60
TGCACATCTGTATTCAGTCCA
60
ACTTAGATGTGATCCGTTCTCC
60
TCTGCTCAGCACTATGCTG
60
AGACCTTCTATAACTCAGGTCG
59
TTTCCCATGCATTGTCTCG
59
GATGGATGTACTAGATCCCAGG
59
ATCGAAAGTTCTGTTACCAGTG
59
GTCCTACGTGAAGGATTTGAG
58
CTCATCTTGGGTAAGAAAGGTC
58
GAACCAGTGGTAGAAAGCA
57
ATCATCTTGCCTACTGAGTG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TIAM2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TIAM2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005057
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005089
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0035023
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
E9PKT1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005057
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005089
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035023
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
E9PMZ8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005089
H7C5V6 (UniProtKB)
IEA
GO:0035023
H7C5V6 (UniProtKB)
IEA
GO:0043547
H7C5V6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005057
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005085
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005089
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005089
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005096
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030027
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030175
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030426
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0035023
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0043065
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0043547
Q8IVF5 (UniProtKB)
IEA
GO:0051056
Q8IVF5 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q8IVF5 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TIAM2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Substance-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of liver 0.000271442 1 0 BeFree
Liver and Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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