TIPARP (TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TIPARP
locus group:
protein-coding gene
location:
3q25.31
gene_family:
Poly (ADP-ribose) polymerases
alias symbol:
DKFZP434J214|DKFZp686N0351|DDF1|PARP7|PARP-7|PARP-1|pART14|RM1|ARTD14
alias name:
None
entrez id:
25976
ensembl gene id:
ENSG00000163659
ucsc gene id:
uc003fav.4
refseq accession:
NM_015508
hgnc_id:
HGNC:23696
approved reserved:
2003-12-02

基因染色体位置

基因染色体位置

3q25.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TIPARP（TCDD-inducible poly(ADP-ribose) polymerase），也称为PARP7或ARTD14，属于ADP-核糖基转移酶（ART）或聚ADP-核糖聚合酶（PARP）基因家族。该家族成员通过催化ADP-核糖基化修饰蛋白质，参与DNA损伤修复、转录调控和细胞应激反应等过程。TIPARP主要在肝脏、肺和免疫系统中表达，其功能与芳香烃受体（AhR）信号通路密切相关，能够调节AhR介导的基因表达，从而影响外源性物质（如二噁英）的代谢和毒性反应。TIPARP通过ADP-核糖基化修饰AhR，抑制其转录活性，负反馈调节AhR信号通路，防止过度激活导致的细胞损伤。 TIPARP的突变或表达异常可能影响AhR信号通路的平衡，导致代谢紊乱或增加对环境污染物的敏感性。研究表明，TIPARP缺失的小鼠对二噁英的毒性更敏感，而TIPARP过表达则可能抑制AhR的活性，影响细胞对外界刺激的响应。此外，TIPARP在癌症中的作用也受到关注，某些肿瘤中TIPARP表达异常可能影响DNA修复能力或细胞增殖。 TIPARP属于PARP家族，该家族共有17个成员（如PARP1、PARP2等），其共性是具有保守的PARP催化结构域，能够催化ADP-核糖基化反应，参与DNA修复、染色质重塑和细胞死亡调控。不同PARP成员功能各异，TIPARP的独特之处在于其特异性调控AhR信号通路，而非直接参与DNA损伤修复。 若TIPARP表达降低，可能导致AhR信号通路过度激活，增加炎症或毒性反应风险；而过表达可能抑制AhR依赖性基因表达，影响代谢和免疫调节。TIPARP还与病毒感染（如丙型肝炎病毒）的宿主防御有关，其表达水平可能影响病毒复制。总体而言，TIPARP在代谢调控、毒物应答和疾病发展中具有重要作用，但其具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a member of the poly(ADP-ribose) polymerase superfamily. Studies of the mouse ortholog have shown that the encoded protein catalyzes histone poly(ADP-ribosyl)ation and may be involved in T-cell function. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2010]

该基因编码的聚（ADP-核糖）聚合酶家族的一个成员。已经在小鼠直向同源物的研究表明，所编码的蛋白质催化组蛋白的聚（ADP-核糖基）化，并且可以参与T细胞的功能。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2010年5月提供]

OMIM数据库中对TIPARP基因的介绍     Wikipedia数据库中对TIPARP基因的介绍

基因序列

基因序列

TIPARP基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TIPARP基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs345986       rs345987       rs1510269       rs1510270       rs5853762       rs6441095       rs35928253       rs56245561       rs60032002       rs62276618       rs66538320       rs73013985       rs74492204       rs75378624       rs77317949       rs78096543       rs78979395      

基因表达

基因表达

TIPARP基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
ATATTTACAGACACTTGGTGGG
58
CATCTGGGCAGATAATTTGTG
57
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
ATATTTACAGACACTTGGTGGG
58
CATCTGGGCAGATAATTTGTG
57
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
GAATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
59
ACAGCCTTCGTAGTTGGTC
60
ATGAGAATGAAGTATGGAGGAC
58
CTTCGTAGTTGGTCAAATTCAG
58
TATTTACAGACACTTGGTGGG
58
CATCTGGGCAGATAATTTGTG
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TIPARP基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TIPARP基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003950
C9JXM5 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
C9JXM5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003950
G5E9W1 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
G5E9W1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003950
H7C5K7 (UniProtKB)
IEA
GO:0001570
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0001822
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003950
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IDA
GO:0006471
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008209
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008210
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0008585
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0009791
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0010629
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IMP
GO:0030097
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0035326
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IDA
GO:0044236
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0045732
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IMP
GO:0046872
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048008
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048705
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0048745
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060021
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0060325
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IEA
GO:0071407
Q7Z3E1 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TIPARP基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of ovary 0.122909916 3 2 BeFree_GAD_GWASCAT
ovarian neoplasm 0.122367032 1 1 CTD_human_GAD
Epithelial ovarian cancer 0.12 1 1 GWASCAT
Carcinogenesis 0.002442977 9 1 BeFree
Celiac Disease 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.002171535 8 1 BeFree
Breast Carcinoma 0.001900093 7 1 BeFree
Prostate carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Glioma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000814326 3 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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