TM4SF4 (transmembrane 4 L six family member 4)

symbol:
TM4SF4
locus group:
protein-coding gene
location:
3q25.1
gene_family:
alias symbol:
il-TMP
alias name:
None
entrez id:
7104
ensembl gene id:
ENSG00000169903
ucsc gene id:
uc003exd.3
refseq accession:
NM_004617
hgnc_id:
HGNC:11856
approved reserved:
1997-10-16
3q25.1
基因染色体位置图

TM4SF4(跨膜4超家族成员4,Transmembrane 4 superfamily member 4)是一种属于跨膜4超家族(TM4SF)的基因,该家族也称为四次跨膜蛋白家族(tetraspanin family)。TM4SF家族的共性是其编码的蛋白质均含有四个跨膜结构域,形成细胞膜上的蛋白复合物,参与细胞间黏附、信号传导、细胞迁移和免疫调节等过程。TM4SF4蛋白在多种组织中表达,尤其在肝脏、肺和免疫系统中较为显著,其生物学功能主要与细胞膜的组织和动态调节相关,可能通过与其他膜蛋白(如整合素和生长因子受体)相互作用,影响细胞增殖、分化和肿瘤微环境的调控。TM4SF4的表达产物通过参与细胞外基质相互作用和细胞信号通路(如PI3K/AKT和MAPK通路)发挥功能,这些通路调控细胞的存活、运动和代谢。TM4SF4的突变或表达异常可能导致其功能紊乱,例如在某些癌症中(如肝癌和肺癌),TM4SF4的过表达与肿瘤进展、转移和不良预后相关,可能通过增强肿瘤细胞的侵袭能力或逃避免疫监视。相反,降低TM4SF4表达可能抑制肿瘤生长,但也可能影响正常组织的稳态,例如肝脏再生或免疫细胞功能。TM4SF家族的其他成员(如CD81、CD9)在免疫应答和病毒感染中也有重要作用,而TM4SF4的特定功能仍在进一步研究中。目前的研究表明,TM4SF4可能作为潜在的生物标志物或治疗靶点,特别是在肿瘤和纤维化疾病中,但其具体机制和临床应用仍需更多实验验证。专业术语解释:跨膜结构域(transmembrane domain)是蛋白质中穿过细胞膜的部分;四次跨膜蛋白(tetraspanin)是一类含有四个跨膜区的膜蛋白;PI3K/AKT和MAPK通路是细胞内调控生长和存活的重要信号传导路径。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein that can regulate cell proliferation.[provided by RefSeq, Mar 2011]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员,也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育,活化,生长和运动的调节作用的信号转导事件。这个编码的蛋白是一种细胞表面糖蛋白,可以调节细胞增殖。[通过的RefSeq,2011年3月提供]

TM4SF4基因的碱基序列:[NCBI]
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TM4SF4基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9793       rs1317213       rs1802837       rs3890113       rs4131174       rs4234367       rs4234368       rs4234369       rs4234370       rs4234371       rs4314111       rs4320033       rs4321472       rs4321473       rs4369977       rs4441598       rs4470441      

TM4SF4基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATAGATGACAACGACCACCT
58
GGAGGTGAACATCAAGACAC
58
AGCGATTTGCGATGTTCAC
59
AATGGCTGAGATGATAAACGAG
58
GATTTGCGATGTTCACCTC
57
GAAATGGCTGAGATGATAAACG
58
GTGATAGATGACAACGACCAC
58
GGTGAACATCAAGACACCG
58
TAGATGACAACGACCACCT
58
TGGAGGTGAACATCAAGAC
57
CGATTTGCGATGTTCACCT
58
AATGGCTGAGATGATAAACGAG
58
      尚未收录相关数据

TM4SF4基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TM4SF4基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
C9JVD2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P48230 (UniProtKB)
IPI
GO:0016021
P48230 (UniProtKB)
IBA
GO:0042246
P48230 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TM4SF4基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver diseases 0.12 1 0 CTD_human
Polycystic Ovary Syndrome 0.00272435 1 0 LHGDN
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of liver 0.000542884 2 0 BeFree
Liver and Intrahepatic Biliary Tract Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree
Ovarian Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree

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