TMC1 (transmembrane channel like 1)

symbol:
TMC1
locus group:
protein-coding gene
location:
9q21.13
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
117531
ensembl gene id:
ENSG00000165091
ucsc gene id:
uc004aiz.1
refseq accession:
NM_138691
hgnc_id:
HGNC:16513
approved reserved:
2001-10-08
9q21.13
基因染色体位置图

TMC1(跨膜通道样蛋白1,Transmembrane Channel-Like 1)是一种编码跨膜蛋白的基因,属于TMC基因家族(TMC gene family),该家族共有8个成员(TMC1-TMC8),其共同特点是编码具有跨膜结构域的蛋白质,推测与离子通道或转运功能相关。TMC1主要在耳蜗内毛细胞中表达,其编码的蛋白质被认为参与机械电转导(将声音振动转化为电信号的过程),是听觉功能的关键分子。TMC1蛋白可能形成或调控机械敏感性离子通道,直接影响内毛细胞对声波的响应。TMC1基因突变可导致常染色体显性或隐性非综合征性耳聋(DFNA36和DFNB7/DFNB11),突变类型包括错义突变、无义突变和移码突变,这些突变可能破坏蛋白质结构或导致功能丧失,从而引发听力障碍。研究表明,TMC1基因的过表达可能通过增强机械电转导效率而改善听力敏感性,而降低表达或功能缺失则导致听力减退或耳聋。TMC1还与年龄相关性听力损失(presbycusis)有关,其表达水平随年龄增长而下降可能加速听觉功能退化。TMC基因家族的成员在结构和功能上具有相似性,但组织分布和具体功能各异,例如TMC2也在听觉系统中表达但与TMC1功能部分冗余,而其他成员如TMC6和TMC8则与皮肤疾病相关。TMC1的研究为理解听觉机制和开发耳聋治疗方法提供了重要靶点,例如基因治疗或药物调控其表达可能成为潜在干预策略。

This gene is considered a member of a gene family predicted to encode transmembrane proteins. The specific function of this gene is unknown; however, it is known to be required for normal function of cochlear hair cells. Mutations in this gene have been associated with progressive postlingual hearing loss and profound prelingual deafness. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因被认为是一个基因家族的成员预测其编码跨膜蛋白。该基因的具体功能未知;然而,已知的是需要为耳蜗毛细胞的正常功能。该基因突变与渐进postlingual听力损失和深远的语前聋有关。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

TMC1基因的碱基序列:[NCBI]
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TMC1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4458930       rs6560283       rs7022441       rs7044245       rs7848477       rs7851040       rs7854092       rs7871472       rs10869183       rs11143314       rs11143315       rs11143316       rs11281487       rs12004241       rs12004828       rs12339075       rs12339961      

TMC1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

TMC1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMC1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005245
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0009897
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0032426
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0050910
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0060005
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0060117
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0070588
Q8TDI8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 TMC1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Deafness, Autosomal Dominant 36 0.44 1 2 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Deafness, Autosomal Recessive 7 0.44 1 9 CLINVAR_CTD_human_MGD_UNIPROT
Hearing Loss, Mixed Conductive-Sensorineural 0.004614512 17 2 BeFree
Sensorineural Hearing Loss (disorder) 0.004353001 6 0 BeFree_LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Nonsyndromic Deafness 0.002171535 8 1 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Congenital deafness 0.000542884 2 0 BeFree
Nasopharyngeal carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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