TMEM59 (transmembrane protein 59)

symbol:
TMEM59
locus group:
protein-coding gene
location:
1p32.3
gene_family:
alias symbol:
HSPC001
alias name:
None
entrez id:
9528
ensembl gene id:
ENSG00000116209
ucsc gene id:
uc001cwp.4
refseq accession:
NM_004872
hgnc_id:
HGNC:1239
approved reserved:
1999-07-22
1p32.3
基因染色体位置图

TMEM59(跨膜蛋白59,Transmembrane Protein 59)是一种功能尚未完全明确的跨膜蛋白,可能参与细胞内蛋白质运输、膜泡运输或细胞信号传导等过程。其表达产物主要定位于高尔基体或内体等膜性细胞器,可能在膜蛋白分选或囊泡形成中发挥作用。目前研究表明,TMEM59可能与神经退行性疾病如阿尔茨海默病(AD)相关,其过表达可促进淀粉样前体蛋白(APP)的加工,增加β-淀粉样蛋白(Aβ)的生成,而Aβ的异常积累是AD的重要病理特征。TMEM59的缺失或突变可能影响其正常功能,导致细胞内蛋白质运输紊乱,进而影响神经元功能。TMEM59属于TMEM(跨膜蛋白)基因家族,该家族成员均含有跨膜结构域,参与多种膜相关生物学过程,但具体功能多样且部分尚未明确。TMEM59的过表达可能通过干扰APP代谢途径加剧神经毒性,而表达降低则可能影响膜蛋白的正常分选和运输,导致细胞功能障碍。目前关于TMEM59的研究仍有限,其精确机制和更多疾病关联需进一步探索。

This gene encodes a protein shown to regulate autophagy in response to bacterial infection. This protein may also regulate the retention of amyloid precursor protein (APP) in the Golgi apparatus through its control of APP glycosylation. Overexpression of this protein has been found to promote apoptosis in a glioma cell line. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2015]

该基因编码显示在应对细菌感染,调节自体吞噬的蛋白质。这种蛋白也可能通过APP的糖基化其控制调节高尔基体淀粉样前体蛋白(APP)的保留。这种蛋白的过表达已经发现,以促进神经胶质瘤细胞系的细胞凋亡。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2015年2月提供]

TMEM59基因的碱基序列:[NCBI]
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TMEM59基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2236512       rs6662697       rs11206279       rs17101261       rs17540497       rs41294776       rs41294778       rs41294780       rs45481592       rs61753360       rs74085143       rs111706051       rs111734031       rs112868756       rs113288810       rs113648202       rs115011183      

TMEM59基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATGTTCCCTCTGAGAAGCT
58
AGAAGCTGGATATCTGTTTAGC
58
AGCTTCATAACCTCTTCATGG
58
GATTTCTGGCTTAGACTGGA
57
TGAATCTGCATGTACAGAAGC
59
GTCTCAGTTCAGCGAATGG
59
TATGTTCCCTCTGAGAAGCT
58
AGAAGCTGGATATCTGTTTAGC
58
GCATTTGACTCGGTCTTGG
59
AACTGGCAGACACCTTAGG
59
ACCTACCCTAAGGAAGAGG
57
TCCATCATCCACAAACTGAC
58
TATGTTCCCTCTGAGAAGCT
58
AGAAGCTGGATATCTGTTTAGC
58
ACCTACCCTAAGGAAGAGG
57
TCCATCATCCACAAACTGAC
58
AGCTTCATAACCTCTTCATGG
58
GATTTCTGGCTTAGACTGGA
57
AGCTTCATAACCTCTTCATGG
58
GATTTCTGGCTTAGACTGGA
57
      尚未收录相关数据

TMEM59基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TMEM59基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
Q5T6Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5T704 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5T706 (UniProtKB)
IEA
GO:0000137
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0000138
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0000139
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0004175
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9BXS4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9BXS4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005764
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005770
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005797
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0006914
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0010508
Q9BXS4 (UniProtKB)
IMP
GO:0010955
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031902
Q9BXS4 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0090005
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA
GO:0090285
Q9BXS4 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TMEM59基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Staphylococcus aureus infection 0.000271442 1 0 BeFree

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