TNR (tenascin R)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TNR
locus group:
protein-coding gene
location:
1q25.1
gene_family:
Fibrinogen C domain containing|Fibronectin type III domain containing
alias symbol:
None
alias name:
restrictin|janusin
entrez id:
7143
ensembl gene id:
ENSG00000116147
ucsc gene id:
uc009wwu.2
refseq accession:
NM_003285
hgnc_id:
HGNC:11953
approved reserved:
1995-10-24

基因染色体位置

基因染色体位置

1q25.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TNR（Tenascin-R）是一种细胞外基质糖蛋白，属于tenascin基因家族（Tenascin family），该家族成员包括TNC（Tenascin-C）、TNW（Tenascin-W）等，共同特点是含有多个EGF样重复结构域和纤维连接蛋白III型重复域，参与细胞黏附、迁移及组织发育调控。TNR主要在中枢神经系统（CNS）表达，尤其在神经元轴突周围和突触间隙富集，其生物学功能包括调节神经元间相互作用、突触可塑性（指突触强度随神经活动调整的能力）及髓鞘形成。TNR通过与细胞表面受体（如接触蛋白Contactin-1）和细胞外基质分子（如硫酸软骨素蛋白聚糖）相互作用，维持神经网络的稳定性。 若TNR发生突变，可能导致其与配体结合能力下降或功能异常，进而引发神经系统疾病。例如，小鼠模型中TNR缺失会导致学习记忆障碍、运动协调性下降及突触传递异常，人类研究中TNR异常与精神分裂症、自闭症谱系障碍（ASD）等神经发育疾病相关。TNR过表达可能破坏神经元迁移的精准性，或通过过度激活下游信号通路（如EGFR/ERK）干扰神经环路形成；而表达降低则可能减少突触稳定性，影响认知功能。 在基因家族层面，tenascin成员均参与组织重塑（组织修复或结构改变的过程）和细胞信号转导，但各有组织特异性：TNC多见于胚胎发育和肿瘤微环境，TNR则集中于神经系统。TNR的调控异常可能间接影响其他基因，如下调神经生长因子（BDNF）或突触相关蛋白（PSD95）的表达，进一步加剧神经功能障碍。目前针对TNR的研究多聚焦于其作为神经系统疾病生物标志物或治疗靶点的潜力，但临床转化仍需深入探索。

This gene encodes a member of the tenascin family of extracellular matrix glycoproteins. The encoded protein is restricted to the central nervous system. The protein may play a role in neurite outgrowth, neural cell adhesion and modulation of sodium channel function. It is a constituent of perineuronal nets. [provided by RefSeq, Aug 2013]

该基因编码的腱生蛋白家族的细胞外基质糖蛋白中的一员。所编码的蛋白质被限制于中枢神经系统。蛋白质可以在神经突长出，神经细胞粘附和钠通道功能的调节中发挥作用。它是perineuronal网的组成部分。 [由RefSeq的，2013年8月提供]

OMIM数据库中对TNR基因的介绍     Wikipedia数据库中对TNR基因的介绍

基因序列

基因序列

TNR基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TNR基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs760649       rs760650       rs2179159       rs2205832       rs2205833       rs2205834       rs2205835       rs4592227       rs4612591       rs4652097       rs6676681       rs6676780       rs6687884       rs6693340       rs6693370       rs6698833       rs7411667      

基因表达

基因表达

TNR基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTAGCAACATCCTCAGCCT
59
TTGTAGCCCTTGAGGAGTG
59
CATTCCAAAGAACAATGAAGGG
58
CAGGCTTTAGTCCTGTCTG
58
CATTCCAAAGAACAATGAAGGG
58
AGGCTTTAGTCCTGTCTGG
59
ATTAGCAACATCCTCAGCC
58
TTGTAGCCCTTGAGGAGTG
59
CATTCCAAAGAACAATGAAGGG
58
GGCTTTAGTCCTGTCTGGT
59
TTAGCAACATCCTCAGCCT
59
TTGTAGCCCTTGAGGAGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TNR基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TNR基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005578
H0Y668 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
H0Y668 (UniProtKB)
IEA
GO:0050767
H0Y668 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q92752 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
Q92752 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q92752 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q92752 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q92752 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
Q92752 (UniProtKB)
NAS
GO:0007158
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0007411
Q92752 (UniProtKB)
NAS
GO:0008306
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0009986
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0022029
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0022408
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
Q92752 (UniProtKB)
TAS
GO:0035641
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0045121
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0048692
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0050805
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0050808
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0050885
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0051968
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0051971
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0060291
Q92752 (UniProtKB)
IEA
GO:0072534
Q92752 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TNR基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Gliosis 0.12 1 0 CTD_human
Spontaneous abortion 0.12 1 0 CTD_human
Premature Obstetric Labor 0.002367032 1 0 GAD
Chorioamnionitis 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Fetal Membranes, Premature Rupture 0.002367032 1 0 GAD
Pre-Eclampsia 0.002367032 1 0 GAD
Premature Birth 0.002367032 1 0 GAD
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD
Infection of amniotic sac and membranes, unspecified, unspecified trimester, not applicable or unspecified 0.002367032 1 0 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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