TRAV39 (T cell receptor alpha variable 39)

symbol:
TRAV39
locus group:
other
location:
14q11.2
gene_family:
T cell receptor alpha locus at 14q11.2
alias symbol:
TCRAV27S1|TCRAV39S1
alias name:
None
entrez id:
28642
ensembl gene id:
ENSG00000211818
ucsc gene id:
uc058zer.1
refseq accession:
NG_001332
hgnc_id:
HGNC:12139
approved reserved:
2000-05-15
14q11.2
基因染色体位置图

TRAV39(T细胞受体α可变区39)属于T细胞受体(TCR)基因家族,是免疫系统中T细胞受体α链的可变区基因之一。TCR基因家族包括TRAV、TRBV、TRDV和TRGV等亚家族,共同编码T细胞受体的可变区,负责识别抗原呈递细胞(APC)表面的抗原肽-MHC复合物(pMHC),从而启动特异性免疫应答。TRAV39在T细胞发育过程中通过V(D)J基因重排(一种DNA片段随机组合机制)与其他可变区、多样性区(D)和连接区(J)基因片段组合,形成高度多样化的TCRα链,赋予T细胞识别不同抗原的能力。其表达产物(TCRα链)与TCRβ链共同构成TCR异二聚体,通过CD3信号传导复合物传递激活信号,触发T细胞增殖、分化或效应功能(如杀伤感染细胞)。TRAV39的突变可能影响TCR的抗原结合特异性或信号传导效率,导致免疫缺陷(如T细胞应答减弱)或自身免疫疾病(如错误识别自身抗原)。目前尚未明确报道TRAV39与特定疾病的直接关联,但TCR基因家族的异常(如某些单核苷酸多态性SNP或表达失调)可能与类风湿关节炎、多发性硬化症等自身免疫病相关。若TRAV39过表达,可能增加特定T细胞克隆的扩增,潜在引发自身反应性或淋巴增殖性疾病;若表达降低,则可能减少相应T细胞库的多样性,削弱抗感染或抗肿瘤免疫。TCR基因家族的共性在于其通过基因重排产生巨大多样性(理论上可达10^15种组合),且所有成员均编码TCR的关键抗原识别区域,依赖CD3分子进行信号转导。专业术语解释:V(D)J重排指B或T细胞发育中可变区(V)、多样性区(D)和连接区(J)基因片段的重组过程;pMHC指主要组织相容性复合体(MHC)与抗原肽结合的复合物;CD3是TCR的辅助信号蛋白。

None

TRAV39基因的碱基序列:[NCBI]
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TRAV39基因的碱基突变:           仅显示部分snp

TRAV39基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACTAGACCGGTTAAGTGGA
58
ACAGTCTGTCTGAAGTGGT
58
ACTAGACCGGTTAAGTGGAG
59
ACAGTCTGTCTGAAGTGGT
58
ACTAGACCGGTTAAGTGGA
57
ACAGTCTGTCTGAAGTGGT
58
      尚未收录相关数据

TRAV39基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRAV39基因的本体(GO)信息:

可能调控 TRAV39基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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