TRIOBP (TRIO and F-actin binding protein)

symbol:
TRIOBP
locus group:
protein-coding gene
location:
22q13.1
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
HRIHFB2122|KIAA1662|Tara|TAP68
alias name:
None
entrez id:
11078
ensembl gene id:
ENSG00000100106
ucsc gene id:
uc003atv.4
refseq accession:
NM_001039141
hgnc_id:
HGNC:17009
approved reserved:
2005-10-04
22q13.1
基因染色体位置图

TRIOBP(TRIO and F-actin Binding Protein)是一个编码肌动蛋白结合蛋白的基因,属于TRIO蛋白家族。该基因家族的特点是含有多个功能域,能够与肌动蛋白(F-actin)结合并参与细胞骨架的动态调控,从而影响细胞形态、迁移和信号传导。TRIOBP基因主要在听觉系统中高表达,尤其是内耳毛细胞,其表达产物通过稳定肌动蛋白细胞骨架来维持毛细胞静纤毛(stereocilia)的结构和功能,这对听觉传导至关重要。TRIOBP的突变会导致其功能丧失,破坏静纤毛的排列,从而引发非综合征型耳聋(如DFNB28型耳聋),表现为先天性或早发性听力损失。此外,TRIOBP在中枢神经系统也有表达,可能与神经发育相关,但具体机制尚不明确。若TRIOBP过表达,可能干扰肌动蛋白网络的正常动态平衡,导致细胞形态异常或迁移障碍;而降低表达则会使静纤毛结构紊乱,直接损害听力功能。TRIO蛋白家族的共性包括含有RhoGEF(鸟苷酸交换因子)和SH3(Src同源3)等功能域,能够调控小G蛋白(如RhoA、Rac1)的活性,进而影响细胞骨架重组和细胞运动。目前研究还发现TRIOBP与精神分裂症存在潜在关联,但其具体作用机制仍需进一步探索。专业术语解释:肌动蛋白(F-actin)是细胞骨架的主要成分,参与细胞形态维持和运动;静纤毛(stereocilia)是内耳毛细胞表面的微绒毛结构,负责将声波振动转化为电信号;RhoGEF是一类激活小G蛋白的酶,调控细胞骨架动态。

This gene encodes a protein with an N-terminal pleckstrin homology domain and a C-terminal coiled-coil region. The protein interacts with trio, which is involved with neural tissue development and controlling actin cytoskeleton organization, cell motility and cell growth. The protein also associates with F-actin and stabilizes F-actin structures. Mutations in this gene have been associated with a form of autosomal recessive nonsyndromic deafness. Multiple alternatively spliced transcript variants that would encode different isoforms have been found for this gene, however some transcripts may be subject to nonsense-mediated decay (NMD). [provided by RefSeq, Nov 2008]

该基因编码具有N-末端普列克底物蛋白同源结构域和C端卷曲螺旋区的蛋白质。蛋白质与三重奏,这是参与神经组织发展,控制细胞骨架的组织,细胞运动和细胞生长交互。该蛋白还与关联F-actin和稳定F-肌动蛋白结构。该基因突变与常染色体隐性遗传非综合征耳聋的一种形式有关。多个可变剪接转录物变体,将编码不同同种型已发现这种基因,但是一些转录可能受到无义介导降解(NMD)。 [由RefSeq的,2008年11月提供]

TRIOBP基因的碱基序列:[NCBI]
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TRIOBP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs743833       rs743834       rs762982       rs2015851       rs2097415       rs2413482       rs2413483       rs4239889       rs4396807       rs4634031       rs4820301       rs4820302       rs4820303       rs4821702       rs4821703       rs5756799       rs5756802      

TRIOBP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCATGACGGTATACAGGGAG
60
CTGAAGATCCAGAACCTTCCA
60
GTCTCAAATATTACAGAGACTCCAC
59
GGTCGATCTCACCATCCAG
60
GGATGGTGAGATCGACCTG
60
TAGACAGCATCCTTGGTGTG
60
CTACATCTCACAGCTGGTG
58
CAAGTCACATAACCTCTCAGAG
58
GATGATGCAGAAGGACAAGC
59
CAGACCGTGTCTTGATGTG
59
GTCTATACCTTGTCGGCCA
59
TAGAGTCCGAGAGCTTGGT
60
GTCTATACCTTGTCGGCCA
59
TAGAGTCCGAGAGCTTGGT
60
GTCTATACCTTGTCGGCCA
59
TAGAGTCCGAGAGCTTGGT
60
GATGATGCAGAAGGACAAGC
59
CAGACCGTGTCTTGATGTG
59
AAGATACCAGGAGCTCAGGA
60
TCTCAACAGTGTCCCAGTC
59
      尚未收录相关数据

TRIOBP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TRIOBP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0032956
F6TR96 (UniProtKB)
IEA
GO:0051015
F6TR96 (UniProtKB)
IEA
GO:0032956
F6WMF4 (UniProtKB)
IEA
GO:0051015
F6WMF4 (UniProtKB)
IEA
GO:0032956
F6WYE2 (UniProtKB)
IEA
GO:0051015
F6WYE2 (UniProtKB)
IEA
GO:0032956
H0Y5J9 (UniProtKB)
IEA
GO:0051015
H0Y5J9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9H2D6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9H2D6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005815
Q9H2D6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
Q9H2D6 (UniProtKB)
IDA
GO:0007067
Q9H2D6 (UniProtKB)
IEA
GO:0015629
Q9H2D6 (UniProtKB)
IDA
GO:0015629
Q9H2D6 (UniProtKB)
NAS
GO:0017049
Q9H2D6 (UniProtKB)
NAS
GO:0030047
Q9H2D6 (UniProtKB)
NAS
GO:0030496
Q9H2D6 (UniProtKB)
IEA
GO:0031625
Q9H2D6 (UniProtKB)
IPI
GO:0045159
Q9H2D6 (UniProtKB)
NAS
GO:0051015
Q9H2D6 (UniProtKB)
IDA
GO:0051016
Q9H2D6 (UniProtKB)
NAS
GO:0051301
Q9H2D6 (UniProtKB)
IEA
GO:1900026
Q9H2D6 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TRIOBP基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Deafness, Autosomal Recessive 28 0.36 1 7 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
hearing impairment 0.00272435 1 0 LHGDN
Nonsyndromic Deafness 0.000542884 2 0 BeFree
Congenital deafness 0.000271442 1 0 BeFree
Hearing Loss, Mixed Conductive-Sensorineural 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Muscle Rigidity 0.000271442 1 0 BeFree

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