TSPAN13 (tetraspanin 13)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TSPAN13
locus group:
protein-coding gene
location:
7p21.1
gene_family:
Tetraspanins
alias symbol:
NET-6
alias name:
None
entrez id:
27075
ensembl gene id:
ENSG00000106537
ucsc gene id:
uc003stq.4
refseq accession:
NM_014399
hgnc_id:
HGNC:21643
approved reserved:
2003-07-21

基因染色体位置

基因染色体位置

7p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TSPAN13（Tetraspanin 13）属于四跨膜蛋白超家族（Tetraspanin家族），该家族成员均为细胞膜蛋白，具有四个跨膜结构域，并在细胞间相互作用、信号传导及膜组织等过程中发挥重要作用。TSPAN13编码的蛋白质参与细胞黏附、迁移和增殖调控，尤其在免疫细胞和肿瘤微环境中具有关键功能。其主要作用位点为细胞膜，通过与整合素、生长因子受体等其他膜蛋白形成复合物（称为“四跨膜蛋白网络”）来调节细胞行为。TSPAN13的突变可能导致其功能异常，例如影响细胞迁移能力，与某些癌症（如乳腺癌、结直肠癌）的侵袭性增强相关。研究发现，TSPAN13表达降低可能削弱细胞间通讯，促进肿瘤转移；而过表达则可能抑制某些癌细胞的增殖，具体效应因组织类型而异。在免疫系统中，TSPAN13参与T细胞活化，其表达异常可能与自身免疫疾病有关。该基因家族（Tetraspanin）的共性包括：保守的四次跨膜结构、形成富含胆固醇的膜微区、调控膜蛋白运输及细胞信号通路。家族其他成员如CD81、CD9在病毒感染（如HCV入侵）和精子-卵子融合中起重要作用。TSPAN13与家族成员共享这些特性，但具有独特的相互作用伙伴和组织分布模式。目前研究显示，TSPAN13可能通过调节Wnt/β-catenin等通路影响发育过程，其表达水平变化还可能与神经退行性疾病相关，但具体机制仍需进一步探索。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员，也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育，活化，生长和运动的调节作用的信号转导事件。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TSPAN13基因的介绍     Wikipedia数据库中对TSPAN13基因的介绍

基因序列

基因序列

TSPAN13基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TSPAN13基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs6616       rs7728       rs11491       rs697528       rs706054       rs706055       rs706056       rs706057       rs706058       rs706059       rs706060       rs706061       rs706062       rs706063       rs706064       rs706065       rs706066      

基因表达

基因表达

TSPAN13基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGCTTTACACCTTGGTTAGTC
58
CTCGGAGACTGGAAATCAG
57
GTGCTCGAAATGACATCCAG
59
AACACAGCTAGCCAGACAG
60
GTGCTCGAAATGACATCCAG
59
AACACAGCTAGCCAGACAG
59
GCTCGAAATGACATCCAGAG
59
TAACACAGCTAGCCAGACAG
60
GCTCGAAATGACATCCAGAG
58
TAACACAGCTAGCCAGACAG
59
AGGAGAATATGCTGGAGAGG
58
CAAACACCCAGGATCTCTG
58
GCTCGAAATGACATCCAGAG
58
AACACAGCTAGCCAGACAG
59
CTGCTTTACACCTTGGTTAGTC
59
TCGGAGACTGGAAATCAGC
60
GCTCGAAATGACATCCAGAG
59
AACACAGCTAGCCAGACAG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TSPAN13基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSPAN13基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005246
O95857 (UniProtKB)
IBA
GO:0005887
O95857 (UniProtKB)
TAS
GO:0007166
O95857 (UniProtKB)
IBA
GO:0016020
O95857 (UniProtKB)
TAS
GO:1903169
O95857 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TSPAN13基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Low Grade Prostatic Intraepithelial Neoplasia 0.000271442 1 0 BeFree
Severe Combined Immunodeficiency 0.000271442 1 0 BeFree
Prostatic Intraepithelial Neoplasias 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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