TSPAN4 (tetraspanin 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TSPAN4
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.5
gene_family:
Tetraspanins
alias symbol:
NAG-2|TSPAN-4|TETRASPAN
alias name:
None
entrez id:
7106
ensembl gene id:
ENSG00000214063
ucsc gene id:
uc001lsd.2
refseq accession:
NM_001025234
hgnc_id:
HGNC:11859
approved reserved:
1998-06-10

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.5
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TSPAN4（Tetraspanin 4）属于四跨膜蛋白超家族（Tetraspanin family），这是一类广泛存在于细胞膜上的蛋白质，其共同特点是含有四个跨膜结构域（即四次穿过细胞膜的区域），并通过形成“四跨膜蛋白网络”（TEMs）参与细胞间相互作用、信号传导及膜蛋白运输。TSPAN4的生物学功能主要涉及细胞黏附、迁移和增殖调控，其表达产物通过与其他膜蛋白（如整合素、生长因子受体）相互作用，影响肿瘤转移、免疫应答等过程。该基因的作用位点集中在细胞膜，尤其在细胞-细胞接触区域或伪足（细胞移动时的临时突起）中富集。突变可能导致TSPAN4功能异常，例如丧失对细胞运动的抑制能力，与多种癌症（如乳腺癌、肺癌）的侵袭性增强相关；某些突变还可能干扰免疫细胞功能，增加炎症性疾病风险。若TSPAN4过表达，通常促进肿瘤细胞转移，因其增强细胞迁移相关信号通路（如PI3K/AKT）；而低表达可能削弱细胞间黏附，导致组织屏障功能受损。四跨膜蛋白家族的共性包括：依赖胆固醇的膜微区定位、参与膜蛋白复合物组装、调控细胞运动及膜融合事件（如病毒感染或受精过程）。目前针对TSPAN4的研究仍在深入，其翻译名称“四跨膜蛋白4”为直译，部分文献可能保留英文缩写。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein and is similar in sequence to its family member CD53 antigen. It is known to complex with integrins and other transmembrane 4 superfamily proteins. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员，也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育，活化，生长和运动的调节作用的信号转导事件。这个编码的蛋白是一种细胞表面糖蛋白，是在序列上其家族成员CD53抗原类似。已知的是复杂的与整和其它跨膜4超家族蛋白质。编码不同同种型的可变剪接转录物变体也已确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对TSPAN4基因的介绍     Wikipedia数据库中对TSPAN4基因的介绍

基因序列

基因序列

TSPAN4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TSPAN4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs60315269       rs71472138       rs113525891       rs145267976       rs201233808       rs368506182       rs528356066       rs529281583       rs533513438       rs549369006       rs549997394       rs551556549       rs563736556       rs564473902       rs572378768       rs9704020       rs9704919      

基因表达

基因表达

TSPAN4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAGGAGAACAAGTGCCTC
59
ACCTGTCAATCTTGTCCGT
59
CTTCAACCTGCTCTTCTGG
58
GATGATGAGCAAGTTGGCA
59
AGCACCAGGTATCCATGAG
59
TACCTGTCAATCTTGTCCGT
59
TGCTCTTCTGGTTCTTCCTG
60
CGTACCTTGTCCGTGTAGG
60
TGCTCACTTTCTTCCTGCT
59
AGTCAGTGTAGTTGGAGACG
59
CTTCAACCTGCTCTTCTGG
58
ACCTGTCAATCTTGTCCGT
59
CTGCTCACTTTCTTCCTGC
59
TCAGTGTAGTTGGAGACGC
60
CTTCAACCTGCTCTTCTGG
58
GATGATGAGCAAGTTGGCAG
60
CTCTTCTGGTTCTTCCTGCT
60
CGTACCTTGTCCGTGTAGG
60
CCTTCAACCTGCTCTTCTG
58
CCTGTCAATCTTGTCCGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TSPAN4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSPAN4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A8MVV6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PMX4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PN41 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PPX8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PSH3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3KNL1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
J3KQ42 (UniProtKB)
IEA
GO:0003823
O14817 (UniProtKB)
IDA
GO:0005178
O14817 (UniProtKB)
IPI
GO:0005178
O14817 (UniProtKB)
IPI
GO:0005178
O14817 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14817 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
O14817 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
O14817 (UniProtKB)
IBA
GO:0005925
O14817 (UniProtKB)
IDA
GO:0006461
O14817 (UniProtKB)
IDA
GO:0007166
O14817 (UniProtKB)
IBA
GO:0031982
O14817 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TSPAN4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prion Diseases 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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