TSPAN9 (tetraspanin 9)

symbol:
TSPAN9
locus group:
protein-coding gene
location:
12p13.33-p13.32
gene_family:
Tetraspanins
alias symbol:
NET-5
alias name:
None
entrez id:
10867
ensembl gene id:
ENSG00000011105
ucsc gene id:
uc021qtd.1
refseq accession:
NM_006675
hgnc_id:
HGNC:21640
approved reserved:
2005-03-21
12p13.33-p13.32
基因染色体位置图

TSPAN9(Tetraspanin 9)属于四跨膜蛋白超家族(Tetraspanin家族),该家族成员均为细胞膜蛋白,具有四个跨膜结构域,并在细胞膜上形成动态网络参与细胞间相互作用、信号传导及膜蛋白运输。TSPAN9在多种组织中表达,尤其在神经系统、免疫系统和某些肿瘤中发挥重要作用。其生物学功能包括调节细胞迁移、黏附、增殖和分化,并参与肿瘤发生、转移及免疫调节。TSPAN9通过与其他膜蛋白(如整合素、生长因子受体)相互作用形成功能复合物,影响细胞信号通路(如PI3K/AKT、MAPK)。突变或表达异常可能导致功能紊乱,例如TSPAN9低表达与某些癌症(如肝癌、胃癌)的进展和不良预后相关,可能因其失去对肿瘤抑制通路的调控。过表达TSPAN9可能增强细胞黏附能力,抑制转移,但具体效应因组织环境而异。在神经系统中,TSPAN9可能参与神经元发育,其异常表达或突变可能与神经退行性疾病相关。四跨膜蛋白家族的共性包括:依赖保守结构域(如CCG motif、大胞外环)介导蛋白互作,调控膜动态及细胞行为,广泛参与生理病理过程。研究TSPAN9有助于理解肿瘤机制和开发靶向疗法。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. Alternatively spliced transcripts encoding the same protein have been identified. [provided by RefSeq, Nov 2009]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员,也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育,活化,生长和运动的调节作用的信号转导事件。编码相同蛋白质可变剪接转录物已经确定。 [由RefSeq的,2009年11月提供]

TSPAN9基因的碱基序列:[NCBI]
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TSPAN9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1003559       rs1468567       rs2010581       rs2159422       rs3782805       rs3782807       rs3782808       rs3782809       rs3782810       rs3782811       rs3782812       rs3782813       rs4765722       rs4766077       rs6489446       rs6489447       rs7139181      

TSPAN9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTGATATTCTGGGATCCTCCAG
60
CAGATGACCTCCCGATTCC
60
CATGGACAAGGTGAACGAG
59
AGCCTGGATGATGTTCCAG
60
CATGGACAAGGTGAACGAG
59
AGCCTGGATGATGTTCCAG
60
CATCCTCATCATGCAGATCC
58
TCGTACTTCTTACCAGTCCG
59
CATCCTCATCATGCAGATCC
58
TCGTACTTCTTACCAGTCCG
59
CTACACAGACTGGTACCCAG
59
TTCATAGCAGCCCGTTCTC
60
GGCCATTGGCAAATCTCTG
60
GAGAAGGTGGCAAAGTTGC
60
GCGGAATATCCTGGAACCT
59
CTCTGAACTTCCTGGAAACAC
59
GCGGAATATCCTGGAACCT
59
TCTGAACTTCCTGGAAACAC
58
CCATTGGCAAATCTCTGTGG
60
GAGAAGGTGGCAAAGTTGC
60
      尚未收录相关数据

TSPAN9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TSPAN9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
B5MD23 (UniProtKB)
IEA
GO:0003674
O75954 (UniProtKB)
ND
GO:0005886
O75954 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
O75954 (UniProtKB)
IBA
GO:0005925
O75954 (UniProtKB)
IDA
GO:0007166
O75954 (UniProtKB)
IBA
GO:0008150
O75954 (UniProtKB)
ND
GO:0097197
O75954 (UniProtKB)
IDA

可能调控 TSPAN9基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Subarachnoid Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Cerebrovascular accident 0.002367032 1 0 GAD
Cerebral Hemorrhage 0.002367032 1 0 GAD
Intracranial Hemorrhages 0.002367032 1 0 GAD
Alzheimer's Disease 0.002367032 1 0 GAD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002367032 1 0 GAD
Chikungunya Fever 0.000271442 1 0 BeFree

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