TUT1 (terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
TUT1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q12.3
gene_family:
RNA binding motif containing
alias symbol:
FLJ22347|FLJ22267|FLJ21850|PAPD2|TUTase|TENT1
alias name:
RNA uridylyltransferase|U6 TUTase|…
entrez id:
64852
ensembl gene id:
ENSG00000149016
ucsc gene id:
uc001nto.2
refseq accession:
NM_022830
hgnc_id:
HGNC:26184
approved reserved:
2004-04-07

基因染色体位置

基因染色体位置

11q12.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

TUT1（Terminal Uridylyl Transferase 1）是一种RNA末端尿苷酸转移酶，属于TUTase家族（也称为PAPD家族或非经典poly(A)聚合酶家族）。该基因家族成员的主要共性是能够催化RNA分子的3'端添加尿苷酸（U）残基，从而调控RNA的稳定性、翻译效率或降解过程。TUT1在细胞中主要作用于小核RNA（snRNA）和小核仁RNA（snoRNA）的3'端加工，确保这些非编码RNA的正确成熟和功能发挥。TUT1的生物学功能与RNA代谢密切相关，其表达产物通过修饰RNA的3'末端影响RNA的寿命和功能，进而调控基因表达网络。TUT1的突变可能导致RNA加工异常，影响snRNA和snoRNA的成熟，进而干扰剪接体或核糖体的组装，最终可能引发细胞功能障碍。研究表明，TUT1的功能异常可能与某些遗传性疾病或癌症相关，但其具体机制仍需进一步探索。当TUT1过表达时，可能导致某些RNA的过度尿苷酸化，改变其稳定性或功能，进而影响细胞的正常代谢或信号通路；而降低TUT1表达则可能导致snRNA和snoRNA加工缺陷，影响剪接或翻译过程，甚至触发细胞凋亡。TUT1与其他RNA修饰酶（如TUT4和TUT7）功能部分重叠，但各自具有特定的底物偏好性。TUT1在维持RNA稳态和细胞正常功能中扮演关键角色，其调控异常可能对机体产生广泛影响。

This gene encodes a nucleotidyl transferase that functions as both a terminal uridylyltransferase and a nuclear poly(A) polymerase. The encoded enzyme specifically adds and removes nucleotides from the 3' end of small nuclear RNAs and select mRNAs and may function in controlling gene expression and cell proliferation.[provided by RefSeq, Apr 2009]

该基因编码一个核苷酸基转移酶，其作用既是一个终端uridylyltransferase和核聚（A）聚合酶。所编码的酶特异性增加和来自小核RNA的3‘端删除的核苷酸和选择的mRNA，并在控制基因表达和细胞增殖可能起作用。[通过的RefSeq，2009年4月提供]

OMIM数据库中对TUT1基因的介绍     Wikipedia数据库中对TUT1基因的介绍

基因序列

基因序列

TUT1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

TUT1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1056044       rs34169545       rs34320415       rs34783570       rs35639864       rs36004630       rs36080058       rs115926342       rs137974827       rs138487018       rs138638609       rs139345196       rs139921723       rs140385937       rs140765545       rs142880507       rs143375337      

基因表达

基因表达

TUT1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTGAGTCTCTGCTCTGAG
59
GGCGTAGTTACTGAGAAGG
57
TTACTACAGCCAACCGACC
59
GAGCAGAATCCACATCCCT
59
CCTCAAGCAATTCGACATCTC
60
CTAGCAGCTTTATTGCCCT
58
ATGGACAAGGACAAGGGAG
59
CTCTGGAACTCCTTCTGCT
59
ATGGACAAGGACAAGGGAG
59
CTCTGGAACTCCTTCTGCT
59
ATGGACAAGGACAAGGGAG
59
CTCTGGAACTCCTTCTGCT
59
TTACTACAGCCAACCGACC
59
GAGCAGAATCCACATCCCT
59
TTACTACAGCCAACCGACC
59
GAGCAGAATCCACATCCCT
59
ATGGACAAGGACAAGGGAG
59
TCTGGAACTCCTTCTGCTC
59
GATGAAGAAACCATGTTTGGGA
59
TTGCTAGCCAGTGTAACCT
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

TUT1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

TUT1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000166
F5H0R1 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
F5H0R1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
F5H0R1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
F5H0R1 (UniProtKB)
IDA
GO:0045171
F5H0R1 (UniProtKB)
IDA
GO:0000166
F8WA97 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
F8WA97 (UniProtKB)
IEA
GO:0000166
J3KN81 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003730
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0004652
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q9H6E5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H6E5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H6E5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9H6E5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q9H6E5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006378
Q9H6E5 (UniProtKB)
IMP
GO:0006378
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016180
Q9H6E5 (UniProtKB)
IMP
GO:0016607
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0016607
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0019899
Q9H6E5 (UniProtKB)
IPI
GO:0045171
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q9H6E5 (UniProtKB)
IEA
GO:0050265
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0050265
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0098789
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0071044
Q9H6E5 (UniProtKB)
IMP
GO:0005847
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005847
Q9H6E5 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 TUT1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Osteosarcoma of bone 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Osteosarcoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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