UPK1A (uroplakin 1A)

symbol:
UPK1A
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.12
gene_family:
Tetraspanins
alias symbol:
TSPAN21
alias name:
None
entrez id:
11045
ensembl gene id:
ENSG00000105668
ucsc gene id:
uc002oaw.5
refseq accession:
NM_001281443
hgnc_id:
HGNC:12577
approved reserved:
1999-08-26
19q13.12
基因染色体位置图

UPK1A(尿路上皮特异性蛋白1A,uroplakin 1A)是尿路上皮特异性蛋白家族(uroplakin family)的成员之一,该家族包括UPK1A、UPK1B、UPK2和UPK3等基因,主要参与形成尿路上皮表面的不对称单位膜(asymmetric unit membrane, AUM),为膀胱等尿路器官提供屏障保护功能。UPK1A编码的蛋白质是一种跨膜蛋白,与其他家族成员(如UPK2和UPK3)形成异源复合物,共同构成尿路上皮表层的特殊结构,防止尿液中的有害物质渗透并维持膀胱的伸缩性。UPK1A主要在膀胱、输尿管等尿路上皮组织中高表达,其功能异常可能导致尿路上皮完整性受损。UPK1A基因突变或表达异常与多种泌尿系统疾病相关,例如膀胱癌中常出现UPK1A表达下调,这可能削弱尿路上皮的屏障功能,促进肿瘤进展;而UPK1A过表达在某些情况下可能增强上皮稳定性,但具体机制尚不完全明确。尿路上皮蛋白家族的共性在于它们均参与形成AUM结构,维持尿路上皮的机械强度和抗渗透能力。若UPK1A表达降低,可能导致尿路上皮易受损伤或增加泌尿系统感染风险;反之,过表达可能影响细胞膜动力学,但相关研究较少。此外,UPK1A还被用作膀胱癌的诊断标志物,因其在正常尿路上皮中高表达而在肿瘤组织中常缺失。专业术语解释:不对称单位膜(AUM)是由尿路上皮蛋白组成的特殊膜结构,赋予膀胱上皮独特的防水和抗拉伸特性;尿路上皮(urothelium)是覆盖泌尿系统的上皮组织,具有多层结构和屏障功能。

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is found in the asymmetrical unit membrane (AUM) where it can complex with other transmembrane 4 superfamily proteins. It may play a role in normal bladder epithelial physiology, possibly in regulating membrane permeability of superficial umbrella cells or in stabilizing the apical membrane through AUM/cytoskeletal interactions. The protein may also play a role in tumor suppression. Alternative splicing results in multiple transcript variants of this gene. [provided by RefSeq, Jul 2013]

由该基因编码的蛋白是跨膜4超家族的成员,也称为四旋家族。大多数这些成员是细胞表面蛋白质的特征在于四个疏水区的存在。蛋白质介导其在细胞发育,活化,生长和运动的调节作用的信号转导事件。该编码的蛋白在不对称的单位膜(AUM)发现,在那里可以与其他跨膜4超家族的蛋白质复合体。它可以在正常的膀胱上皮细胞生理学中发挥作用,可能在调节浅表伞细胞的膜通透性或通过AUM /细胞骨架相互作用稳定顶膜。蛋白质也可起到抑制肿瘤的作用。选择性剪接的结果在该基因的多个转录物变体。 [由RefSeq的,2013年7月提供]

UPK1A基因的碱基序列:[NCBI]
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UPK1A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2267586       rs2267587       rs2284149       rs2311870       rs9973243       rs9973289       rs10401695       rs10413518       rs10424849       rs11880678       rs12104249       rs12977868       rs12984318       rs12984332       rs34302366       rs34952797       rs57670318      

UPK1A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTATTCTGCTGTCAGGCCT
59
CATCAGTGGGTATACACGGT
59
ATTATTCTGCTGTCAGGCCT
59
CATCAGTGGGTATACACGGT
59
TACCTGTTCACCAAGGCTG
60
TGTAATCCCAGCTGCTCTG
60
TACCTGTTCACCAAGGCTG
60
TGTAATCCCAGCTGCTCTG
60
ATTATTCTGCTGTCAGGCCT
59
CATCAGTGGGTATACACGGT
59
TACCTGTTCACCAAGGCTG
60
TGGGAGAATCCCTTGAACC
59
ATTATTCTGCTGTCAGGCC
58
CATCAGTGGGTATACACGG
57
ATTATTCTGCTGTCAGGCC
58
CATCAGTGGGTATACACGG
57
TACCTGTTCACCAAGGCTG
60
TGGGAGAATCCCTTGAACC
59
ATTATTCTGCTGTCAGGCC
58
CATCAGTGGGTATACACGG
57
      尚未收录相关数据

UPK1A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

UPK1A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005783
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0005886
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0005886
O00322 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
O00322 (UniProtKB)
IBA
GO:0007166
O00322 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0016324
O00322 (UniProtKB)
IEA
GO:0030855
O00322 (UniProtKB)
IDA
GO:0042803
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0048029
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0051259
O00322 (UniProtKB)
ISS
GO:0070062
O00322 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O00322 (UniProtKB)
IDA

可能调控 UPK1A基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinoma, Transitional Cell 0.00272435 1 0 LHGDN
Vesico-Ureteral Reflux 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Gastric Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000271442 1 0 BeFree

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