USP28 (ubiquitin specific peptidase 28)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
USP28
locus group:
protein-coding gene
location:
11q23.2
gene_family:
Ubiquitin-specific peptidases
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KIAA1515
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None
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57646
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ENSG00000048028
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uc001poh.4
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NM_001301029
hgnc_id:
HGNC:12625
approved reserved:
2000-05-26

基因染色体位置

基因染色体位置

11q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

USP28（泛素特异性蛋白酶28）属于去泛素化酶（DUBs）家族中的USP亚家族，该家族以含有高度保守的泛素特异性蛋白酶结构域为特征，主要功能是通过切除底物蛋白上的泛素链来逆转泛素化修饰，从而调控蛋白质稳定性、定位及功能。USP28在细胞周期调控、DNA损伤修复及癌症发生中起关键作用，其典型作用位点包括癌蛋白c-Myc和p53等，通过去泛素化稳定这些蛋白，促进细胞增殖或凋亡。突变可能导致USP28酶活性丧失或异常，例如功能缺失突变会削弱对c-Myc的稳定作用，抑制肿瘤生长，而功能获得性突变可能过度激活致癌通路。USP28与多种癌症（如结直肠癌、乳腺癌）密切相关，其过表达通常通过增强c-Myc和Notch等促癌蛋白的稳定性来驱动肿瘤进展，而敲低表达则可能诱导细胞周期停滞或凋亡。该基因还参与调控Wnt/β-catenin等信号通路，过表达会协同激活下游促增殖基因，而表达不足可能抑制通路活性。USP家族共性包括依赖半胱氨酸-组氨酸催化二元体（Cys-His box）水解泛素链，并普遍参与蛋白质稳态、炎症及表观遗传调控。目前“去泛素化酶”中文译名存在争议（原英文Deubiquitinating enzymes），部分文献也使用“去泛素酶”。

The ubiquitin-dependent protein degradation pathway is essential for proteolysis of intracellular proteins and peptides. Enzymes that remove ubiquitin from ubiquitin-conjugated peptides, like USP28, affect the fate and degradation of intracellular proteins and are essential for maintenance of cell-free ubiquitin pools (Valero et al., 2001).[supplied by OMIM, Mar 2008]

泛素依赖性蛋白降解途径是细胞内蛋白质和肽的蛋白水解是至关重要的。从泛素 - 缀合的肽除去泛素，如USP28，影响细胞内蛋白质的命运和退化，并且必需进行维护无细胞泛素池酶（瓦莱罗等人，2001）。[由OMIM，2008年3月提供的]

OMIM数据库中对USP28基因的介绍     Wikipedia数据库中对USP28基因的介绍

基因序列

基因序列

USP28基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

USP28基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs756701       rs1016954       rs1016955       rs1016956       rs1034582       rs1633546       rs1633547       rs1633548       rs1633549       rs1633550       rs1713670       rs1713671       rs2005667       rs2023642       rs2051675       rs2051676       rs2051677      

基因表达

基因表达

USP28基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACTGAGTGAGGCATTCCA
60
GAGGATCACTGTGAGAGGTG
60
CACTGAGTGAGGCATTCCA
60
GAGGATCACTGTGAGAGGTG
60
TCTGGATGCCATTGAGGTC
60
TTTCTGCAATATCTTGCCCA
58
CTAATTCTGAGGTGATGCTGAG
59
TCTCGGTCAAAGGTCTGAC
59
ACTACTCTACATCACAAGAGCC
59
TTACAATCACAGCATGCTCAG
59
GAGGAGAGTTGATGGTTGG
58
GAAGAAGCATCCTGAATAACAG
57
GACAGATACCCTCAGAGCT
58
ATGGAGAAAGGAAGGGTCC
59
CATGTACAGGAGCAAGGAG
58
GCCATATTTCACATACCTTTCC
58
CAAGATGTGAGTGAATTCACAC
58
CTGGGACTGTTAACATTAACAG
57
CAGACATCCAAGGAAAGTACAG
59
CTTGGGTAAAGAATCTTCAGGA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

USP28基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

USP28基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
B4E3L3 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
B4E3L3 (UniProtKB)
IDA
GO:0006511
B4E3L3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016579
B4E3L3 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
B4E3L3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006511
F5GZ74 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
F5GZ74 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
G3V1N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
G3V1N5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006511
G3V1N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016579
G3V1N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
G3V1N5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006511
H0YFX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016579
H0YFX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
H0YFX3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006511
H0YG96 (UniProtKB)
IEA
GO:0016579
H0YG96 (UniProtKB)
IEA
GO:0036459
H0YG96 (UniProtKB)
IEA
GO:0000077
Q96RU2 (UniProtKB)
IMP
GO:0004843
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0004843
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005515
Q96RU2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96RU2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96RU2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96RU2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96RU2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q96RU2 (UniProtKB)
IBA
GO:0006281
Q96RU2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006511
Q96RU2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006974
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0007265
Q96RU2 (UniProtKB)
IMP
GO:0008283
Q96RU2 (UniProtKB)
IMP
GO:0010212
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016579
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016579
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016579
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016579
Q96RU2 (UniProtKB)
IMP
GO:0031647
Q96RU2 (UniProtKB)
IMP
GO:0034644
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0042771
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA
GO:0043234
Q96RU2 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 USP28基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Multiple malignancy 0.000271442 1 0 BeFree
Intestinal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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