VCX2 (variable charge X-linked 2)

symbol:
VCX2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp22.31
gene_family:
Variable charge X/Y family
alias symbol:
VCX-2r|VCX-2R
alias name:
None
entrez id:
51480
ensembl gene id:
ENSG00000177504
ucsc gene id:
uc004csb.3
refseq accession:
NM_016378
hgnc_id:
HGNC:18158
approved reserved:
2004-04-16
Xp22.31
基因染色体位置图

VCX2(可变电荷X连锁2)属于VCX基因家族,该家族位于X染色体短臂(Xp22.2)上,包含多个成员(如VCX、VCX2、VCX3A等),主要与精子发生和神经发育相关。VCX基因家族的共性在于它们编码小的、富含精氨酸的蛋白质,这些蛋白质可能参与RNA结合或染色质重塑,并在男性生殖系统和大脑中高表达。VCX2本身在睾丸中表达较高,推测其可能在精子形成过程中发挥作用,但具体分子机制尚不完全明确。研究表明,VCX2的表达异常可能与智力障碍相关,特别是X连锁智力障碍(XLID),因为该基因所在的染色体区域缺失或突变常伴随认知功能障碍。VCX2的过表达或表达降低对机体的影响研究较少,但动物模型显示VCX家族基因的缺失可能导致精子发生缺陷或神经发育异常。由于VCX2与其他VCX成员(如VCX3A)具有高度序列相似性,可能存在功能冗余。目前尚未发现VCX2的常见致病突变,但该基因的拷贝数变异(如重复或缺失)可能与某些疾病表型相关。需要注意的是,VCX2的研究相对有限,许多结论基于其家族共性或邻近基因的关联分析,需进一步实验验证其具体功能及调控网络。

This gene belongs to the VCX/Y gene family, which has multiple members on both X and Y chromosomes that are expressed exclusively in male germ cells. The VCX gene cluster is polymorphic in terms of copy number; different individuals may have a different number of VCX genes. This gene contains two copies of a 30 nt tandem repeat. Deletion of a nearby member of this family was implicated in mental retardation. [provided by RefSeq, Feb 2015]

该基因属于VCX / Y基因家族,其具有上了在雄性生殖细胞只表达了X和Y染色体的多个成员。该VCX基因簇是在拷贝数多态性方面;不同的个体可具有不同数量的VCX基因。该基因含有30个核苷酸串联重复的两个副本。这个家族的成员附近的缺失智力障碍被牵连。 [由RefSeq的,2015年2月提供]

VCX2基因的碱基序列:[NCBI]
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VCX2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1058237       rs1058238       rs1058239       rs1869586       rs3761599       rs4066716       rs4066725       rs4066726       rs4066728       rs5934399       rs6640002       rs41305169       rs41305171       rs41309545       rs41311789       rs41311791       rs67407985      

VCX2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGAAGACTACCAAGGTGGC
60
TCAGTGGTTCTTCCACCTC
59
AGAAGACTACCAAGGTGGC
59
CTCAGTGGTTCTTCCACCT
59
AGAAGACTACCAAGGTGGC
59
TCAGTGGTTCTTCCACCTC
59
      尚未收录相关数据

VCX2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VCX2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003674
Q9H322 (UniProtKB)
ND
GO:0005575
Q9H322 (UniProtKB)
ND
GO:0005730
Q9H322 (UniProtKB)
IBA
GO:0007420
Q9H322 (UniProtKB)
IBA
GO:0008150
Q9H322 (UniProtKB)
ND

可能调控 VCX2基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Ichthyosis, X-Linked 0.000271442 1 0 BeFree
Placental Steroid Sulfatase Deficiency 0.000271442 1 0 BeFree
Mental Retardation 0.000271442 1 0 BeFree

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