VNN2 (vanin 2)

symbol:
VNN2
locus group:
protein-coding gene
location:
6q23.2
gene_family:
Vanins
alias symbol:
FOAP-4|GPI-80
alias name:
pantetheinase
entrez id:
8875
ensembl gene id:
ENSG00000112303
ucsc gene id:
uc003qdt.4
refseq accession:
NM_001242350
hgnc_id:
HGNC:12706
approved reserved:
1998-11-13
6q23.2
基因染色体位置图

VNN2(Vanin-2)是一种编码膜结合糖蛋白的基因,属于vanin基因家族(vanin gene family),该家族成员(如VNN1、VNN2、VNN3)的共同特点是编码具有泛酸酶(pantetheinase)活性的蛋白质,能够催化泛酰巯基乙胺(pantetheine)分解为半胱胺(cysteamine)和泛酸(pantothenic acid,维生素B5的前体)。VNN2主要在免疫细胞(如中性粒细胞、巨噬细胞)和上皮细胞中表达,其表达产物通过调控氧化应激反应和炎症反应参与免疫调节。VNN2蛋白通过其酶活性产生的半胱胺可影响谷胱甘肽(glutathione,一种重要的抗氧化剂)代谢,从而调节细胞的氧化还原状态。此外,VNN2在细胞黏附和迁移中也发挥作用,可能通过整合素(integrin)介导的信号通路影响免疫细胞的募集。VNN2的突变或表达异常与多种疾病相关,例如炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)、类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis)和某些癌症(如结肠癌)。VNN2过表达可能加剧炎症反应或促进肿瘤进展,而降低表达则可能削弱抗氧化能力或影响免疫细胞功能。在基因家族层面,vanin家族成员均具有保守的泛酸酶活性,但组织分布和功能侧重略有差异,例如VNN1更多参与肝脏代谢,而VNN2更偏向免疫调控。VNN2的表达受炎症信号(如TNF-α、IL-6)诱导,其功能异常可能通过扰乱氧化应激平衡或免疫细胞迁移,间接影响其他基因(如NF-κB通路相关基因)的活性。

This gene product is a member of the Vanin family of proteins that share extensive sequence similarity with each other, and also with biotinidase. The family includes secreted and membrane-associated proteins, a few of which have been reported to participate in hematopoietic cell trafficking. No biotinidase activity has been demonstrated for any of the vanin proteins, however, they possess pantetheinase activity, which may play a role in oxidative-stress response. The encoded protein is a GPI-anchored cell surface molecule that plays a role in transendothelial migration of neutrophils. This gene lies in close proximity to, and in same transcriptional orientation as two other vanin genes on chromosome 6q23-q24. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, May 2011]

该基因产物是瓦宁家族彼此共享广泛的序列相似性的蛋白质的成员,并且也与生物素酶。该家族包括分泌和膜相关的蛋白质,其中的一些已报道参与造血细胞的运输。无生物素活性已被证实为任何的瓦宁蛋白质,但是,它们具有pantetheinase活性,这可能在氧化应激反应的作用。所编码的蛋白质是一个GPI锚定的细胞表面分子,其起着嗜中性粒细胞的跨内皮迁移的作用。该基因位于靠近,并在染色体6q23-Q24在同一转录方向为两个其它瓦宁基因。编码不同同种型的可变剪接转录物变体已被用于这个基因说明。 [由RefSeq的,2011年5月提供]

VNN2基因的碱基序列:[NCBI]
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VNN2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs761126       rs1063993       rs1883613       rs1883617       rs2179535       rs2267952       rs2294760       rs2300078       rs2300079       rs3756971       rs3756972       rs3756973       rs3778176       rs3817926       rs3817927       rs3901670       rs4895944      

VNN2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCCACATGTCCTCCTAATGG
59
CTCTTGCCCACCTTATGGT
59
ACATGTCCTCCTAATGGCT
58
ATACCACTTCCTTATGGTAACG
58
ATGGATGGAAATTTACCAGGG
58
GTGTGACCAAATCTGTGGG
59
CATTCAGCTTGGGCAATGG
60
GGTGCATAAATACCACTTCCTG
60
TGGATGGAAATTTACCAGGGA
59
GTGTGACCAAATCTGTGGG
58
TCCACATGTCCTCCTAATGG
59
CTCTTGCCCACCTTATGGT
59
TGCCTTGAATCTCATGAACG
59
CAATGATTCGAGCACCCTG
59
CCTGTACTCTGAGCCTCAG
59
TACCACTTCCTTCCAAATGC
58
ATGGATGGAAATTTACCAGGG
58
GTGTGACCAAATCTGTGGG
59
CACATGTCCTCCTAATGGCT
60
CTGTAAGGTTTCCTTATGGTAACG
60
      尚未收录相关数据

VNN2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VNN2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006807
B4DQB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
B4DQB2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
E9PK31 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
E9PK31 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
E9PL76 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
E9PL76 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
E9PLK5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
E9PLK5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
E9PQ75 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
E9PQ75 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
E9PRD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
E9PRD9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
J3KQ55 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
J3KQ55 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
J3KQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
J3KQQ7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006807
J3QT03 (UniProtKB)
IEA
GO:0016811
J3QT03 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O95498 (UniProtKB)
IEA
GO:0006768
O95498 (UniProtKB)
IBA
GO:0006928
O95498 (UniProtKB)
TAS
GO:0007417
O95498 (UniProtKB)
IBA
GO:0015939
O95498 (UniProtKB)
IDA
GO:0017159
O95498 (UniProtKB)
IDA
GO:0031225
O95498 (UniProtKB)
IEA

可能调控 VNN2基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Psoriasis 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Dermatitis, Atopic 0.12 1 0 CTD_human
Malignant neoplasm of breast 0.002367032 1 0 GAD
Malaria 0.000271442 1 0 BeFree
Thymoma 0.000271442 1 0 BeFree
Fanconi Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Nephropathic cystinosis 0.000271442 1 0 BeFree

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