VPS28 (VPS28 subunit of ESCRT-I)

基因基本信息

基因基本信息

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VPS28
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protein-coding gene
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8q24.3
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2002-02-13

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

VPS28是液泡蛋白分选（VPS）基因家族的重要成员，属于ESCRT-I（内体分选复合物转运所需）复合体的组成部分。ESCRT家族包括ESCRT-0、I、II、III等多个亚复合物，共同参与细胞内膜运输、多泡体（MVB）形成、病毒出芽及细胞分裂等关键过程。VPS28作为ESCRT-I的核心蛋白之一，与VPS23、VPS37等亚基结合，负责识别泛素化膜蛋白并将其分选至内体腔中形成囊泡，最终通过溶酶体降解。该基因在维持蛋白质稳态、信号转导调控及细胞器完整性中发挥核心作用。若VPS28发生功能缺失突变，会导致ESCRT-I复合体组装异常，引发泛素化蛋白在内体膜上异常积累，影响EGFR等受体酪氨酸激酶的降解，促进肿瘤发生。研究显示VPS28表达下调与乳腺癌、肝癌进展相关，可能通过激活mTOR通路促进细胞增殖。而过表达VPS28可能增强ESCRT-I介导的病毒包膜蛋白（如HIV-1 Gag）的截留，抑制病毒释放。该基因家族成员均含有保守的泛素结合域或螺旋结构域，通过级联反应协同完成膜变形与剪切。VPS28的N端螺旋结构域对ESCRT-I/III复合物的桥接至关重要，其C端与VPS23的相互作用若被破坏会导致内体分选功能丧失。此外，VPS28还参与细胞脱落、神经元突触修剪等特殊膜重塑事件，其表达异常可能影响神经退行性疾病进程。在模式生物研究中，VPS28敲除可导致胚胎致死，证实其对发育的不可或缺性。

This gene encodes a protein subunit of the ESCRT-I complex (endosomal complexes required for transport), which functions in the transport and sorting of proteins into subcellular vesicles. This complex can also be hijacked to facilitate the budding of enveloped viruses from the cell membrane. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基因编码的ESCRT-I复合体（运输所需的内体复合物），其功能在运输的蛋白质亚基和蛋白分选入亚细胞囊泡。这种复杂的也可被劫持，以促进包膜病毒从细胞膜的出芽。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2013年7月提供]

OMIM数据库中对VPS28基因的介绍     Wikipedia数据库中对VPS28基因的介绍

基因序列

基因序列

VPS28基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

VPS28基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3862193       rs4082352       rs4082353       rs4925856       rs6985339       rs6985841       rs7341562       rs7840439       rs13253451       rs13273684       rs17553600       rs34999346       rs35298598       rs57645133       rs112699577       rs113622236       rs114519041      

基因表达

基因表达

VPS28基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGATGTTTCATGGGATCCC
60
CAACTTCACTTCCTCATACAGC
59
GAATTCTGCCGCAAGTTCC
60
GTGATGAAGAGCGAGACCA
60
GAATTCTGCCGCAAGTTCC
60
GTGATGAAGAGCGAGACCA
60
GGGAGAGGGAGAAGTACGA
60
TTGATGTAGGCCTTCTCCAG
59
AGGATGTTTCATGGGATCCC
60
CAACTTCACTTCCTCATACAGC
59
GAATTCTGCCGCAAGTTCC
60
GTGATGAAGAGCGAGACCA
60
CATCAAGGACTGTGTCTCC
58
TTGTATTGGACCAGGAGCC
59
GAGGATGTTTCATGGGATCC
58
AACTTCACTTCCTCATACAGC
58
GATGTTTCATGGGATCCCAG
58
ACTCACCTCATACAGCTCC
59
GAATTCTGCCGCAAGTTCC
60
GTGATGAAGAGCGAGACCA
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

VPS28基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

VPS28基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000813
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0000813
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0000813
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0000813
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0000813
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
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Q9UK41 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
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IPI
GO:0005515
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IPI
GO:0005737
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IDA
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Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0005768
Q9UK41 (UniProtKB)
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Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
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TAS
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0010008
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0016197
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0019058
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0031397
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Q9UK41 (UniProtKB)
IEA
GO:0032403
Q9UK41 (UniProtKB)
IBA
GO:0036258
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0039702
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:0043130
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0043162
Q9UK41 (UniProtKB)
IC
GO:0043162
Q9UK41 (UniProtKB)
IMP
GO:0043328
Q9UK41 (UniProtKB)
IBA
GO:0045732
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IMP
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GO:0070062
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IDA
GO:0070062
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UK41 (UniProtKB)
IDA
GO:0075733
Q9UK41 (UniProtKB)
TAS
GO:2000397
Q9UK41 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 VPS28基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Influenza 0.00272435 1 0 LHGDN
HIV Infections 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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