WDR11 (WD repeat domain 11)

symbol:
WDR11
locus group:
protein-coding gene
location:
10q26.12
gene_family:
WD repeat domain containing
alias symbol:
KIAA1351|FLJ10506|WDR15|HH14|DR11|SRI1
alias name:
sensitization to ricin complex sub…
entrez id:
55717
ensembl gene id:
ENSG00000120008
ucsc gene id:
uc021pzt.2
refseq accession:
NM_018117
hgnc_id:
HGNC:13831
approved reserved:
2000-11-20
10q26.12
基因染色体位置图

WDR11(WD重复结构域蛋白11)是一种含有WD40重复结构域的蛋白质,属于WD40重复蛋白家族。WD40结构域是一种保守的蛋白质相互作用模块,通常由约40个氨基酸组成并以“WD”(色氨酸-天冬氨酸)二肽结尾,这类蛋白家族成员多参与信号转导、转录调控、细胞周期调控等生物学过程。WDR11的功能尚未完全明确,但研究表明它可能在纤毛发生、下丘脑-垂体-性腺轴调控及神经发育中发挥作用。其表达产物通过与其他蛋白质(如EMX1、OTUD5等)相互作用,参与基因表达调控和蛋白质稳定性维持。主要作用位点包括细胞质和纤毛基部,在神经元和下丘脑组织中高表达。WDR11突变可能导致纤毛功能障碍,与卡尔曼综合征(Kallmann syndrome,一种伴有嗅觉缺失的低促性腺激素性性腺功能减退症)和某些智力障碍相关。此外,该基因异常还与垂体发育缺陷、生殖系统异常及部分癌症(如胶质瘤)的发生有关。若WDR11过表达,可能干扰其相互作用蛋白的网络平衡,影响下游信号通路(如Hedgehog信号通路);而表达降低则可能导致纤毛结构异常或激素分泌紊乱。WD40基因家族的共性是通过WD40重复结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用,参与多种细胞过程。目前研究提示WDR11可能通过调控转录因子活性或纤毛相关蛋白的定位来发挥作用,但其具体机制仍需进一步探索。需要注意的是,部分文献中“WD repeat”仍保留英文表述,因中文译名“WD重复”尚未完全统一。

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD), which may facilitate formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. Members of this family are involved in a variety of cellular processes, including cell cycle progression, signal transduction, apoptosis, and gene regulation. This gene is located in the chromosome 10q25-26 region, which is frequently deleted in gliomas and tumors of other tissues, and is disrupted by the t(10;19) translocation rearrangement in glioblastoma cells. The gene location suggests that it is a candidate gene for the tumor suppressor locus. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码对WD重复蛋白质家族的一个成员。 WD重复序列微创保守的约40个氨基酸典型地通过甘氨酸 - 他和trp-ASP(GH-WD)括号中,这可有利于形成异或多蛋白复合的区域。这个家庭的成员参与多种细胞过程,包括细胞周期进程,信号转导,细胞凋亡和基因调控。该基因位于染色体10q25-26区域,这是在神经胶质瘤和其它组织的肿瘤频繁删除,并且由将n破坏(10; 19)在成胶质细胞瘤细胞易位重排。的基因的位置表明,它是为肿瘤抑制基因的候选基因。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

WDR11基因的碱基序列:[NCBI]
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WDR11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs10871       rs1045154       rs1045170       rs1045179       rs1530116       rs1652726       rs1652727       rs1866516       rs1866517       rs2420894       rs3740306       rs3740307       rs4752474       rs7077126       rs7096780       rs7099459       rs7906170      

WDR11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACGGAACAGTAGTTCTGG
60
ATTCTGTAGCACTCCTACAGG
59
CAGACATCTTCTGTGTCCG
58
GGTGACCACTCATCATGAC
58
GATGGCCAAGTGTATCATCTC
59
ACCCATACTTCCATCTGGT
58
CTCATGTGAAGTCAAGGGT
57
CCCATATTGTTTGGTGTTGAG
58
CTCATGTGAAGTCAAGGGT
57
CCCATATTGTTTGGTGTTGAG
58
TCACGGAACAGTAGTTCTGG
60
ATTCTGTAGCACTCCTACAGG
59
TGTTGTAAAGGTTAAATGGGCC
60
ATCAGCAGAAGCTAACCGT
59
TCAAGAGAAACCTAGTGCTG
57
GAGCAACAACATGTGATTCC
58
CGGTCAACTTATGATCATACAAGG
60
AACGCCTGACATACTTGAC
58
CCTTGAGGTGAATCAGACG
58
TGAAAGCAGGGTATTACCTG
57
      尚未收录相关数据

WDR11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

WDR11基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9BZH6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9BZH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9BZH6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9BZH6 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
Q9BZH6 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
Q9BZH6 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q9BZH6 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q9BZH6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
S4R3Z0 (UniProtKB)
IDA
GO:0015630
S4R3Z0 (UniProtKB)
IDA

可能调控 WDR11基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HYPOGONADOTROPIC HYPOGONADISM 14 WITH OR WITHOUT ANOSMIA 0.24 1 5 CLINVAR_UNIPROT
Glioma 0.120814326 3 0 BeFree_CTD_human
Kallmann Syndrome 0.120542884 2 0 BeFree_ORPHANET
Substance-Related Disorders 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.12 1 0 CTD_human
Asthma 0.002367032 1 1 GAD
Systemic Scleroderma 0.001085767 4 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Rheumatoid Arthritis 0.000542884 2 0 BeFree
Rheumatic Heart Disease 0.000542884 2 0 BeFree

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