WDR3 (WD repeat domain 3)

symbol:
WDR3
locus group:
protein-coding gene
location:
1p12
gene_family:
WD repeat domain containing
alias symbol:
FLJ12796|UTP12|DIP2
alias name:
None
entrez id:
10885
ensembl gene id:
ENSG00000065183
ucsc gene id:
uc010oxe.2
refseq accession:
NM_006784
hgnc_id:
HGNC:12755
approved reserved:
1998-11-30
1p12
基因染色体位置图

WDR3(WD Repeat Domain 3)是一个编码WD重复结构域蛋白的基因,属于WD40重复蛋白家族。WD40家族成员通常含有多个WD40重复序列(约40个氨基酸组成的保守结构域),这些结构域能形成β-螺旋桨样空间结构,介导蛋白质相互作用,参与信号转导、转录调控、细胞周期调控等生物学过程。WDR3在核糖体生物合成中起关键作用,作为UTP-C复合体的组成部分,参与18S rRNA的加工和核糖体小亚基的成熟。其主要作用位点是细胞核仁(核糖体组装场所),通过与RNA聚合酶I转录机器和其他加工因子相互作用,调控rRNA前体的转录后修饰。WDR3突变可能导致核糖体生成缺陷,引发核糖体病(ribosomopathy),表现为细胞增殖异常、发育迟缓或贫血等。研究发现WDR3与5q-骨髓增生异常综合征(5q- MDS)相关,其单倍剂量不足(haploinsufficiency)可能破坏核糖体平衡,促发疾病。过表达WDR3可能干扰核糖体组装质量控制,导致异常核糖体积累;而低表达会减少功能性核糖体数量,影响蛋白质合成效率。该基因家族(WD40)的共性是作为分子支架或平台,协调多蛋白复合物的组装,例如参与染色质重塑(如Gβ样蛋白)、细胞骨架调控或自噬(如ATG16L1)。WDR3的功能依赖于其WD40结构域的完整性,若突变破坏该结构(如错义突变p.Arg366Trp),可能削弱与UTP-C其他组分的结合能力,导致18S rRNA加工障碍。目前对WDR3的研究仍有限,但其在癌症(如肝癌中上调)和神经退行性疾病中的潜在作用逐渐受到关注。

This gene encodes a nuclear protein containing 10 WD repeats. WD repeats are approximately 30- to 40-amino acid domains containing several conserved residues, which usually include a trp-asp at the C-terminal end. Proteins belonging to the WD repeat family are involved in a variety of cellular processes, including cell cycle progression, signal transduction, apoptosis, and gene regulation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码含有10 WD重复的核蛋白。 WD重复序列是含有几个保守残基,其通常包括在C-末端的TRP-asp的约30至40个氨基酸的结构域。属于WD重复家族蛋白参与多种细胞过程,包括细胞周期进程,信号转导,凋亡,基因调控。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

WDR3基因的碱基序列:[NCBI]
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WDR3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1321663       rs1321664       rs1321665       rs3754126       rs3754127       rs3754129       rs6690060       rs6696148       rs12136368       rs17037749       rs17037751       rs41276598       rs61806137       rs74113095       rs74113097       rs76567546       rs77149591      

WDR3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACAAAGCAGCTATCACTACC
59
CAATAATATCTGTGTCCTTGGACC
59
GGTCACAAAGCAGCTATCAC
59
AATATCTGTGTCCTTGGACCC
59
ACAAAGCAGCTATCACTACCT
59
CAATAATATCTGTGTCCTTGGACC
59
      尚未收录相关数据

WDR3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

WDR3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000462
Q9UNX4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q9UNX4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q9UNX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9UNX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9UNX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9UNX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005730
Q9UNX4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006364
Q9UNX4 (UniProtKB)
TAS
GO:0030515
Q9UNX4 (UniProtKB)
IBA
GO:0031965
Q9UNX4 (UniProtKB)
IDA
GO:0032040
Q9UNX4 (UniProtKB)
IBA
GO:0034388
Q9UNX4 (UniProtKB)
IBA
GO:0044822
Q9UNX4 (UniProtKB)
IDA

可能调控 WDR3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Thyroid Neoplasm 0.002367032 1 0 GAD
Carcinoma, Papillary 0.002367032 1 0 GAD
Follicular thyroid carcinoma 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroid carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Differentiated Thyroid Gland Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of thyroid 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of lung (disorder) 0.000271442 1 0 BeFree

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