WDR6 (WD repeat domain 6)

symbol:
WDR6
locus group:
protein-coding gene
location:
3p21.31
gene_family:
WD repeat domain containing
alias symbol:
Trm734
alias name:
Trm734 homolog (S. cerevisiae)
entrez id:
11180
ensembl gene id:
ENSG00000178252
ucsc gene id:
uc062jnu.1
refseq accession:
NM_001320546
hgnc_id:
HGNC:12758
approved reserved:
1999-09-07
3p21.31
基因染色体位置图

WDR6(WD Repeat Domain 6)属于WD40重复蛋白家族,该家族成员通常含有多个WD40结构域(一种由约40个氨基酸组成的重复序列,形成β-螺旋结构),介导蛋白质相互作用,参与信号转导、细胞周期调控等过程。WDR6的具体功能尚未完全明确,但研究表明它可能在核糖体生物合成、RNA加工及细胞增殖中发挥作用。其表达产物可能通过与其他蛋白(如UTP4/Cirhin)形成复合物,参与核糖体小亚基的组装,影响蛋白质翻译效率。主要作用位点可能在细胞核或核仁(核内负责核糖体合成的区域)。WDR6突变可能导致核糖体功能异常,与发育迟缓、智力障碍等疾病相关,例如North Carolina型耳聋综合征(与CIRH1A基因突变相关,而WDR6可能通过相互作用影响该疾病表型)。若WDR6过表达,可能干扰核糖体稳态,引发细胞增殖异常(如癌症);表达降低则可能导致核糖体缺陷,影响细胞生长。WD40家族的共性是通过WD40结构域作为分子支架(支架蛋白:支撑其他蛋白相互作用的平台),参与多种细胞过程。目前尚无明确证据表明WDR6直接导致特定疾病,但其功能异常可能通过间接机制(如核糖体病变)影响机体。专业术语解释:核糖体(合成蛋白质的细胞器)、β-螺旋(蛋白质的一种折叠模式)、支架蛋白(协助蛋白复合物组装的蛋白)。若需更精确的疾病关联或分子机制,建议查阅最新文献,因该基因研究仍在进展中。

This gene encodes a member of the WD repeat protein family. WD repeats are minimally conserved regions of approximately 40 amino acids typically bracketed by gly-his and trp-asp (GH-WD), which may facilitate formation of heterotrimeric or multiprotein complexes. The encoded protein interacts with serine/threonine kinase 11, and is implicated in cell growth arrest. [provided by RefSeq, Aug 2008]

该基因编码对WD重复蛋白质家族的一个成员。 WD重复序列微创保守的约40个氨基酸典型地通过甘氨酸 - 他和trp-ASP(GH-WD)括号中,这可有利于形成异或多蛋白复合的区域。所编码的蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶11相互作用,并在细胞生长停滞被牵连。 [由RefSeq的,2008年8月提供]

WDR6基因的碱基序列:[NCBI]
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WDR6基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7100       rs8926       rs14370       rs76160880       rs80079165       rs137858477       rs138712639       rs139247938       rs139425191       rs140081609       rs141662298       rs142301323       rs143273816       rs143362247       rs143367268       rs144134222       rs146232576      

WDR6基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTATACTCCTCCCAGTGACG
58
GGACCCTCACCTGTAATCC
59
GTCTCTGCAGGTACATGTC
58
AAAGAAAGAGCCTTACGGC
58
GATTACAGAGTCTGGCTTTGG
59
AGCCTATGAATGCATCAGGA
59
CTTATACTCCTCCCAGTGACG
60
GAAAGCCAAAGCCAGACTC
59
TATACTCCTCCCAGTGACG
58
CTTTGGAAAGCCAAAGCCA
59
GTCTCTGCAGGTACATGTC
58
AAAGAAAGAGCCTTACGGC
58
GGGATTACAGGTGAGGGTC
59
CTGCACTCGCTTTATCATCC
59
CTAGATGAGTATTGGGACCGG
60
AGCAAGGGACATGTACCTG
59
TCAAGGTCCACTCCTTTACAC
60
GAGATCCCAGAAAGCCAGG
60
CAAGCTGCAGGATTGTGAG
59
GCACTCGCTTTATCATCCG
59
      尚未收录相关数据

WDR6基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

WDR6基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0043234
A0A087X295 (UniProtKB)
IEA
GO:0043560
A0A087X295 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NNW5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NNW5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NNW5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q9NNW5 (UniProtKB)
IDA
GO:0007050
Q9NNW5 (UniProtKB)
IDA
GO:0008285
Q9NNW5 (UniProtKB)
IDA
GO:0010507
Q9NNW5 (UniProtKB)
IMP
GO:0044822
Q9NNW5 (UniProtKB)
IDA
GO:0008180
Q9NNW5 (UniProtKB)
IDA

可能调控 WDR6基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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