WFDC21P (WAP four-disulfide core domain 21, pseudogene)

symbol:
WFDC21P
locus group:
pseudogene
location:
17q23.1
gene_family:
alias symbol:
LOC645638|lnc-DC|LNCDC
alias name:
long non-coding RNA, dendritic cel…
entrez id:
645638
ensembl gene id:
ENSG00000261040
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_030732
hgnc_id:
HGNC:50357
approved reserved:
2014-06-16
17q23.1
基因染色体位置图

WFDC21P(WAP Four-Disulfide Core Domain 21, Pseudogene)是一个假基因,属于WFDC基因家族。WFDC基因家族编码含有WAP(Whey Acidic Protein)四二硫键核心结构域的蛋白质,这类蛋白质通常具有蛋白酶抑制、免疫调节或抗菌功能。WFDC21P由于缺乏功能性开放阅读框或存在终止密码子等突变,无法编码功能性蛋白,因此归类为假基因。假基因通常由功能基因通过复制或逆转录转座产生,随后因积累突变而失去功能。WFDC21P可能源自WFDC家族功能基因的复制事件,但具体来源尚不明确。WFDC家族成员如SLPI(分泌性白细胞蛋白酶抑制剂)和WFDC2(HE4)在炎症、免疫防御和癌症中发挥重要作用,但WFDC21P因失去功能而不参与这些过程。假基因的突变通常不会对机体产生直接影响,但某些假基因可能通过调控功能基因的表达或作为非编码RNA发挥作用。WFDC21P的过表达或降低表达可能对机体影响有限,但假基因有时会通过竞争性结合miRNA或转录因子间接影响功能基因的表达网络。目前WFDC21P与疾病的直接关联尚未明确,但WFDC家族功能基因的异常表达与癌症、炎症性疾病等相关。WFDC21P作为假基因,其研究价值可能在于理解基因家族进化、假基因功能化或调控机制。

None

WFDC21P基因的碱基序列:[NCBI]
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WFDC21P基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1106900       rs7210612       rs7211063       rs7217280       rs10401026       rs16944016       rs16944017       rs16944022       rs16944030       rs56179229       rs58881293       rs59516968       rs72840354       rs72840355       rs73994296       rs74958828       rs77896537      

WFDC21P基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGTTGTTCAGTCTAGATGAAGAG
59
TGGAAGATAGGAACTCCAGGA
60
AGGGTAAGGACAGATGAAGAG
59
TTGGAAGATAGGAACTCCAGG
59
GGGTAAGGACAGATGAAGAG
57
CTTGGAAGATAGGAACTCCAG
58
AGGGTAAGGACAGATGAAGAG
59
TTGGAAGATAGGAACTCCAGG
59
AGGGTAAGGACAGATGAAGAG
59
TTGGAAGATAGGAACTCCAGG
59
AGGGTAAGGACAGATGAAGAG
58
TTGGAAGATAGGAACTCCAGG
59
CGTTGTTCAGTCTAGATGAAGAG
59
TGGAAGATAGGAACTCCAGGA
60
AGGGTAAGGACAGATGAAGAG
59
TTGGAAGATAGGAACTCCAGG
59
TGTGTTGCAGGATGAAGAG
58
ATCTTGGAAGATAGGAACTCCA
59
TGACTGAAGTTGACAATGGAG
58
CGCAGGTACCTGATTATGTC
58
      尚未收录相关数据

WFDC21P基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

WFDC21P基因的本体(GO)信息:

可能调控 WFDC21P基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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