XACT (X active specific transcript)

symbol:
XACT
locus group:
non-coding RNA
location:
Xq23
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
X active coating transcript
entrez id:
105463123
ensembl gene id:
ENSG00000241743
ucsc gene id:
uc065atz.1
refseq accession:
NR_131204
hgnc_id:
HGNC:45056
approved reserved:
2013-02-04
Xq23
基因染色体位置图

XACT(X-active coating transcript)是一种长链非编码RNA(lncRNA),位于X染色体上,主要在人类和小鼠的早期胚胎发育中表达。它的主要功能是通过表观遗传调控参与X染色体失活(XCI)过程,这是雌性哺乳动物平衡X染色体基因剂量的关键机制。XACT在人类中特异性地包裹活性X染色体,形成一种“涂层”,可能保护该染色体免受失活的影响。与小鼠不同,人类的XACT表达与XIST(X失活特异性转录本)存在重叠,表明其在XCI调控中可能具有更复杂的作用。XACT的突变或异常表达可能干扰X染色体失活的精确性,导致发育异常或疾病,如某些X染色体相关的智力障碍或癌症。过表达XACT可能阻碍正常的XCI过程,导致X连锁基因的剂量失衡,而降低表达可能使X染色体过早失活,影响胚胎发育。XACT属于lncRNA家族,这类RNA通常不编码蛋白质,但通过调控染色质结构、转录或翻译参与基因表达调控。XACT所在的基因家族可能还包括其他参与X染色体调控的lncRNA,如XIST和TSIX,它们共同协调X染色体的激活与失活。目前对XACT的研究仍在深入,尤其在人类早期发育和疾病中的作用尚未完全阐明,但它在表观遗传学和性别特异性基因调控中的独特功能备受关注。

This gene produces a spliced long non-coding RNA that is thought to play a role in the control of X-chromosome inactivation (XCI). This transcript has been shown to specifically coat the active X chromosome in human pluripotent cells. [provided by RefSeq, Mar 2015]

该基因产生一个拼接长非编码被认为在X染色体失活(XCI)的控制作用的RNA。此转录物已显示特别涂层在人多能干细胞中的活性X染色体。 [由RefSeq的,2015年3月提供]

XACT基因的碱基序列:[NCBI]
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XACT基因的碱基突变:           仅显示部分snp

XACT基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTAAACCTGATCACTTGTCTC
59
AATGGCTGCTGAATCTTCAG
59
TCCTAAACCTGATCACTTGTC
58
ATGGCTGCTGAATCTTCAG
58
CCTAAACCTGATCACTTGTCTC
59
ATGGCTGCTGAATCTTCAG
58
      尚未收录相关数据

XACT基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

XACT基因的本体(GO)信息:

可能调控 XACT基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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