YBX2 (Y-box binding protein 2)

symbol:
YBX2
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.1
gene_family:
Y box binding proteins
alias symbol:
MSY2|CSDA3|Contrin
alias name:
None
entrez id:
51087
ensembl gene id:
ENSG00000006047
ucsc gene id:
uc002gfq.3
refseq accession:
NM_015982
hgnc_id:
HGNC:17948
approved reserved:
2005-08-11
17p13.1
基因染色体位置图

YBX2(Y-box binding protein 2)属于Y-box蛋白家族,该家族成员均含有高度保守的冷休克结构域(CSD),能够结合DNA或RNA以调控基因表达。YBX2主要在生殖系统中高表达,尤其在睾丸和卵巢中发挥关键作用,参与精子发生和卵母细胞成熟过程。其生物学功能包括调控mRNA的稳定性、翻译及转录过程,尤其在生殖细胞发育中通过结合特定mRNA(如精子发生相关基因的mRNA)来维持其稳定性并控制翻译时机。YBX2的作用位点集中在生殖细胞的细胞质和细胞核内,通过与靶标核酸相互作用影响生殖细胞的分化与减数分裂。突变或功能缺失可能导致男性不育(如精子发生阻滞)或女性生殖障碍(如卵母细胞成熟异常),因其对配子发育的关键基因(如PRM1、TP2等)调控失常。YBX2过表达可能扰乱生殖细胞mRNA的时空表达模式,导致减数分裂错误或凋亡增加;而表达降低则可能使靶mRNA降解加速,影响精子形态或卵子质量。该基因与无精症、卵巢早衰等疾病相关,其异常表达还可能与某些肿瘤(如生殖细胞肿瘤)发生有关。Y-box蛋白家族的共性包括:依赖CSD结构域实现核酸结合功能,参与应激反应、细胞增殖及发育调控,且多数成员(如YBX1、YBX3)在癌症中异常表达。YBX2的独特之处在于其生殖系统特异性,与其他家族成员(如广泛表达的YBX1)形成功能互补。

This gene encodes a nucleic acid binding protein which is highly expressed in germ cells. The encoded protein binds to a Y-box element in the promoters of certain genes but also binds to mRNA transcribed from these genes. Pseudogenes for this gene are located on chromosome 10 and 15. [provided by RefSeq, Feb 2012]

这个基因编码其在生殖细胞中高表达的核酸结合蛋白。所编码的蛋白质结合到某些基因的启动子的Y框元件,而且还结合从这些基因转录的mRNA。这个假基因都位于[由RefSeq的,2012年2月提供] 10号染色体和15

YBX2基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
YBX2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs138258204       rs201992080       rs373162837       rs374452888       rs533867720       rs537893470       rs539634320       rs541870137       rs554014991       rs556341177       rs560541826       rs561543714       rs568410699       rs568998424       rs576209304       rs577147220       rs222838      

YBX2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAATGTATTATAGGGTTCTCTGTGC
60
GGAAATCAGTTGAGGATTCCA
58
TCATCAACAGGAATGACACCA
60
CAAAGGCCTTCAAAGACGG
60
TTCATCAACAGGAATGACACC
59
CAAGGACCTTCTCCCTCTG
59
CCACCCTTCTTCTACCGAC
60
TGTCAGTGCCCTCTATAGG
58
CATCAACAGGAATGACACCA
58
CATCAAATTCCACAGTCTCCC
59
GGCAGAATGTATTATAGGGTTCTC
59
ATCAGTTGAGGATTCCAGC
57
CCACCCTTCTTCTACCGAC
60
GTCAGTGCCCTCTATAGGC
59
AGCTGCCATCTGGTATCTG
59
GATGTCATGAATTATGGGAAAGGG
60
TCATCAACAGGAATGACACCA
60
CAAGGACCTTCTCCCTCTG
59
TCATCAACAGGAATGACACC
58
TCAAATTCCACAGTCTCCC
57
      尚未收录相关数据

YBX2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

YBX2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0003723
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9Y2T7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005730
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006366
Q9Y2T7 (UniProtKB)
TAS
GO:0007283
Q9Y2T7 (UniProtKB)
TAS
GO:0009386
Q9Y2T7 (UniProtKB)
TAS
GO:0048599
Q9Y2T7 (UniProtKB)
IEA

可能调控 YBX2基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Male infertility 0.005005506 2 0 BeFree_GAD
Dysgerminoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Seminoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Azoospermia 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Oligospermia 0.002367032 1 0 GAD
Abnormal spermatogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。