ZBED1 (zinc finger BED-type containing 1)

symbol:
ZBED1
locus group:
protein-coding gene
location:
Xp22.33 and Yp11
gene_family:
Zinc fingers, BED-type|Pseudoautosomal region 1
alias symbol:
TRAMP|KIAA0785|DREF|hDREF
alias name:
None
entrez id:
9189
ensembl gene id:
ENSG00000214717
ucsc gene id:
uc022ciu.2
refseq accession:
NM_004729
hgnc_id:
HGNC:447
approved reserved:
2000-05-11
Xp22.33 and Yp11
基因染色体位置图

ZBED1(锌指BED型结构域蛋白1)是一种编码含有BED型锌指结构域的蛋白质的基因,属于ZBED基因家族。ZBED家族成员通常具有保守的BED型锌指结构域,这种结构域能够结合DNA并参与基因表达的调控。ZBED1在多种组织中表达,尤其在睾丸中表达较高,提示其可能在生殖系统发育或功能中发挥作用。ZBED1的生物学功能尚未完全阐明,但研究表明它可能参与转录调控、染色质重塑和细胞增殖等过程。ZBED1的表达产物可能通过与其他蛋白质相互作用来调节靶基因的表达,从而影响细胞的分化和生长。主要作用位点可能包括细胞核,因为其结构域暗示了DNA结合能力。突变对ZBED1功能的影响尚不明确,但锌指结构域的突变可能破坏其DNA结合能力,进而影响其调控功能。目前尚未发现ZBED1与特定疾病的直接关联,但鉴于其在睾丸中的高表达,未来研究可能揭示其与生殖系统疾病或癌症的潜在联系。如果ZBED1过表达,可能会干扰正常的转录调控网络,导致细胞增殖异常或其他功能紊乱;而降低表达则可能影响其靶基因的调控,进而影响相关生物学过程。ZBED基因家族的共性包括含有BED型锌指结构域,这种结构域由约50-60个氨基酸组成,包含一个保守的锌结合位点和一个螺旋-环-螺旋结构,能够介导蛋白质与DNA或蛋白质间的相互作用。家族成员在进化上较为保守,可能在发育和细胞分化中发挥重要作用。ZBED1作为该家族的一员,可能与其他成员共享部分功能或调控机制,但具体功能仍需进一步研究。

This gene is located in the pseudoautosomal region 1 (PAR1) of X and Y chromosomes. It was earlier identified as a gene with similarity to Ac transposable elements, however, was found not to have transposase activity. Later studies show that this gene product is localized in the nucleus and functions as a transcription factor. It binds to DNA elements found in the promoter regions of several genes related to cell proliferation, such as histone H1, hence may have a role in regulating genes related to cell proliferation. Alternatively spliced transcript variants with different 5' untranslated region have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2010]

该基??因位于X和Y染色体的假常染色体区域1(PAR1)。据早前认定为具有相似交流转座子基因,然而,没有发现有转座活性。后来的研究表明,该基因产物是在细胞核和功能作为转录因子本地化。它结合到与细胞增殖的几个基因,例如组蛋白H1的启动子区域中发现的DNA元件,因此可以在调节与细胞增殖的基因的作用。用不同的5‘非翻译区可变剪接转录物变体已经发现这种基因。 [由RefSeq的,2010年1月提供]

ZBED1基因的碱基序列:[NCBI]
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ZBED1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs9577       rs1044300       rs1044307       rs1062804       rs1317287       rs1612462       rs2141814       rs3203783       rs3752331       rs3813162       rs4892841       rs4892842       rs4892843       rs4892847       rs4892848       rs4892931       rs4892932      

ZBED1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

ZBED1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZBED1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
C9JXP4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
C9JXP4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
C9JXP4 (UniProtKB)
IDA
GO:0015629
C9JXP4 (UniProtKB)
IDA
GO:0000228
O96006 (UniProtKB)
TAS
GO:0000977
O96006 (UniProtKB)
IBA
GO:0003700
O96006 (UniProtKB)
IBA
GO:0004803
O96006 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O96006 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
O96006 (UniProtKB)
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GO:0005737
O96006 (UniProtKB)
IDA
GO:0006357
O96006 (UniProtKB)
IBA
GO:0015629
O96006 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
O96006 (UniProtKB)
IEA
GO:0046983
O96006 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ZBED1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.122171535 9 0 BeFree_CTD_human
Malignant neoplasm of prostate 0.00868614 32 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.008414698 31 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.001085767 4 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Poorly differentiated carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Vesicular Stomatitis 0.000271442 1 0 BeFree
Sudden infant death syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Status Epilepticus 0.000271442 1 0 BeFree

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