ZNF598 (zinc finger protein 598, E3 ubiquitin ligase)

symbol:
ZNF598
locus group:
protein-coding gene
location:
16p13.3
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type
alias symbol:
FLJ00086|HEL2
alias name:
None
entrez id:
90850
ensembl gene id:
ENSG00000167962
ucsc gene id:
uc002cof.3
refseq accession:
NM_178167
hgnc_id:
HGNC:28079
approved reserved:
2004-03-01
16p13.3
基因染色体位置图

ZNF598(锌指蛋白598)是一种属于C2H2型锌指蛋白家族的基因,该家族以含有保守的C2H2锌指结构域为特征,这类蛋白通常作为转录因子参与基因表达的调控。ZNF598在泛素-蛋白酶体系统中扮演重要角色,尤其与核糖体质量控制(RQC)相关,它通过识别停滞的核糖体并介导泛素化修饰,促进异常翻译产物的降解,从而维持蛋白质稳态。ZNF598的功能位点集中在它的锌指结构域和泛素连接酶活性区域,这些区域使其能够特异性结合RNA或蛋白质底物。突变可能破坏其泛素化功能,导致错误折叠蛋白积累,与神经退行性疾病(如肌萎缩侧索硬化症)和癌症发生相关。若ZNF598过表达,可能过度降解正常蛋白或干扰核糖体功能,影响细胞生长;而表达降低则会导致异常蛋白清除障碍,诱发细胞应激反应。该基因与家族成员(如ZNF597、ZNF600)共享锌指介导的核酸结合特性,但各自靶向不同通路。研究还发现ZNF598与病毒感染(如寨卡病毒)中宿主翻译调控有关,提示其在抗病毒防御中的潜在作用。

Zinc-finger proteins bind nucleic acids and play important roles in various cellular functions, including cell proliferation, differentiation, and apoptosis. This protein and Grb10-interacting GYF protein 2 have been identified as a components of the mammalian 4EHP (m4EHP) complex. The complex is thought to function as a translation repressor in embryonic development. [provided by RefSeq, Oct 2012]

锌指蛋白结合的核酸和各种细胞功能,包括细胞增殖,分化和凋亡中起重要作用。这种蛋白质和Grb10相互作用GYF蛋白2已被确定为哺乳动物4EHP(m4EHP)复合物的组成部分。该复合物被认为能够用作在胚胎发育翻译阻遏。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

ZNF598基因的碱基序列:[NCBI]
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ZNF598基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3889       rs9081       rs740582       rs757601       rs968417       rs968418       rs1058474       rs1058502       rs2240691       rs2286468       rs2286469       rs3042605       rs3743846       rs3743847       rs7190034       rs8044194       rs8044386      

ZNF598基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATGATGAGCTGCTTAAGCA
58
GCATAGTCGCTGTAGTAGTC
58
AGTTCAAGAGCCACTCAGG
59
CTCTTGTAATACTGGGCTGC
59
AAAGGGAAGAAGAGGACCG
59
TCCTCCTGATCCTCACTCC
59
AATGATGAGCTGCTTAAGCA
58
GCATAGTCGCTGTAGTAGTC
58
AATGATGAGCTGCTTAAGCA
58
GCATAGTCGCTGTAGTAGTC
58
GTTAATGGACACATGGAGGG
58
GAGCTGAAGGTTCCTCTCC
60
AAGAAGCCTTCTCGGTGAC
60
GAAGTCTTCGTCCTTGAGC
58
AAGCTGGAGGGAAGAAGAG
59
TTCCTCCTGATCCTCACTC
58
ACCTCCAGATCTTCACATATGAG
60
CTCGTCACAGAACTTGCAG
59
CGAAGACTACGAGGAGGTG
59
GTCCTCTTCTTCCCTCCAG
59
      尚未收录相关数据

ZNF598基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ZNF598基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0046872
H3BQQ2 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
Q86UK7 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
Q86UK7 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q86UK7 (UniProtKB)
IDA

可能调控 ZNF598基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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