To detect CENP-A enrichment on Chromosome 1,5 &7 in C. albicans centromere deleted clones

·发布 2012年12月21日 ·更新 2013年1月7日

样本数

实验数

实验描述

ChIP Seq revealed presence of unique CEN-proximal neocentromere peaks in CEN deleted clones. Using 10 million reads generated from ChIP-seq for each sample, chromosome wide maps for CENP-A enrichment were generated . Examination of CENP-A enrichment in Input/IP samples of various CEN deleted C. albicans clones

样本属性

chip antibody

Anti- Myc antibodies (Calbiochem, Cat # OP10L), Anti-Prot A (Sigma, Cat# P2921), none (input), Polyclonal anti-Cse4 antibodies (Sanyal K & Carbon J PNAS 99, 12969 - 12974 (2002))

growth conditions

Log phase grown C. albicans cells

growth media

YPDU, YPSU

Organism

Candida albicans

protein

CENP-A/Cse4, Myc-CENP-C, None, Prot A CENP-A/Cse4

strain or line

J178, J181, J191, J225, J226, J227, RM1000AH

实验信息

登记号

E-GEOD-42907

GEO 编号

SRP017545, GSE42907

实验类型

ChIP-seq

物种

Candida albicans

发布日期

2012年12月21日

更新日期

2013年1月7日

提交者

Kaustuv Sanyal、 Kaustuv Sanyal、 Jitendra Thakur

外部链接

ArrayExpress 原始页 NCBI GEO：SRP017545, GSE42907

分析服务

To detect CENP-A enrichment on Chromosome 1,5 &7 in C. albicans centromere deleted clones

联系地址

微信公众号