GPATCH11 (G-patch domain containing 11)

symbol:
GPATCH11
locus group:
protein-coding gene
location:
2p22.2
gene_family:
G patch domain containing
alias symbol:
FLJ38348|CENPY|CENP-Y
alias name:
centromere protein Y
entrez id:
253635
ensembl gene id:
ENSG00000152133
ucsc gene id:
uc010ezz.4
refseq accession:
NM_174931
hgnc_id:
HGNC:26768
approved reserved:
2006-02-14
2p22.2

GPATCH11(G-patch domain containing 11)是一个编码含有G-patch结构域的蛋白质的基因,其功能尚未完全明确,但G-patch结构域通常与RNA结合或RNA代谢相关,可能参与RNA剪接、加工或翻译调控等过程。GPATCH11的表达产物可能在细胞核内发挥作用,影响基因表达的调控网络。目前关于该基因的具体作用位点研究较少,但推测其可能与其他RNA结合蛋白或剪接体组分相互作用。突变对GPATCH11功能的影响尚不明确,但若其功能受损,可能干扰RNA代谢过程,进而影响细胞正常功能。目前尚未发现GPATCH11与特定疾病的直接关联,但RNA代谢相关基因的异常常与神经退行性疾病或癌症有关。若GPATCH11过表达,可能扰乱RNA加工平衡,导致基因表达异常;若表达降低,则可能影响RNA代谢效率,进而干扰细胞功能。GPATCH11属于G-patch基因家族,该家族成员均含有保守的G-patch结构域,通常参与RNA相关过程,如剪接、编辑或降解。家族成员的共性包括与RNA结合能力及其在转录后调控中的潜在作用。目前针对GPATCH11的研究较少,需进一步探索其具体机制及生物学意义。

中文English

GPATCH11基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
蛋白质序列
1MRSARSTALN RGEQRAVRYY SHMKLNMAEE EDYMSDSFIN
41VQEDIRPGLP MLRQIREARR KEEKQQEANL KNRQKSLKEE
81 EQERRDIGL KNALGCENKG FALLQKMGYK SGQALGKSGG
121GIVEPIPLNI KTGKSGIGHE ASLKRKAEEK LESYRKKIHM
161K NQAEEKAA EQFRMRLKNK QDEMKLEGDL RRSQRACQQL
201DVQKNIQVPR EAWYWLRLEE ETEEDEEEKE QDEDEYKSED
241LS VLEKLQI LTSYLREEHL YCIWCGTAYE DKEDLSSNCP
281GPTSADHD
结构预测来自 AlphaFold DB(UniProt: Q8N954),颜色表示 pLDDT 置信度(深蓝高、黄橙低)。
GPATCH11基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs12871       rs1044559       rs1060957       rs3856498       rs3856499       rs4670653       rs4670654       rs4670655       rs6718647       rs6720519       rs6726403       rs6732075       rs6734153       rs6734269       rs6738282       rs7568925       rs7571576      

GPATCH11基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACAGTTTCGAATGCGAC
57
ACATCCAGTTGTTGACAGG
57
AGAACAGTTTCGAATGCGAC
59
CATCCAGTTGTTGACAGGC
59
AGAACAGTTTCGAATGCGAC
59
ATCCAGTTGTTGACAGGCT
59
      尚未收录相关数据

GPATCH11基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPATCH11基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
A0A0A0MSF9 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
Q8N954 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q8N954 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q8N954 (UniProtKB)
IPI

可能调控 GPATCH11基因的相关microRNA:     

String
BioGrid
IntAct
mentha
MINT
加载中…
关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
GPATCH11 ortholog Sap34 regulates pre-mRNA splicing by interacting with early spliceosomal complexes in Schizosaccharomyces pombe.
Cipakova I, Karika LO, Hronska L, Selicky T, Iaparov B, Karhanek M, Kohutova L, Barath P, Cipak L Sci Rep IF: 4.9 2026-06-08

评论加载中...

登录后即可发表评论 登录 注册

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: product@genelibs.com