GPATCH11P1 (GPATCH11 pseudogene 1)

symbol:
GPATCH11P1
locus group:
pseudogene
location:
3p13
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
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entrez id:
344709
ensembl gene id:
ENSG00000182921
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NG_022207
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HGNC:42659
approved reserved:
2011-08-12
3p13

GPATCH11P1是一个假基因,属于GPATCH基因家族。假基因通常与功能基因序列相似但不具备编码蛋白质的能力,可能由功能基因复制后发生突变导致。GPATCH基因家族成员通常含有G-patch结构域,该结构域参与RNA结合和加工,与RNA代谢、剪接等过程相关。GPATCH11P1位于人类染色体12q24.31区域,是GPATCH11的假基因版本。由于是假基因,GPATCH11P1不编码功能性蛋白,因此其生物学功能尚不明确,可能不直接参与细胞活动。假基因有时能通过竞争性结合miRNA或转录因子来调控其同源功能基因的表达。GPATCH11P1的突变可能不会对机体产生直接影响,但假基因的变异有时会影响其同源功能基因的调控。目前没有明确证据表明GPATCH11P1与特定疾病相关。GPATCH11P1的过表达或降低表达可能不会显著影响机体,但理论上可能干扰其同源功能基因GPATCH11的调控。GPATCH基因家族的共性在于大多数成员含有G-patch结构域,参与RNA相关过程如剪接、修饰和转运。GPATCH11是该家族的功能基因,在RNA加工中起作用。由于GPATCH11P1是假基因,研究重点通常放在其同源功能基因上。假基因在进化中可能保留调控功能或作为基因组的"化石记录"。对GPATCH11P1的研究有助于理解假基因的进化意义和潜在调控作用。

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GPATCH11P1基因的碱基序列:[NCBI]
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GPATCH11P1基因的碱基突变:           仅显示部分snp

GPATCH11P1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

GPATCH11P1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

GPATCH11P1基因的本体(GO)信息:

可能调控 GPATCH11P1基因的相关microRNA:     

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关联基因 作用方式 资源库来源/分值
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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