PMS2P4 (PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 4)

symbol:
PMS2P4
locus group:
pseudogene
location:
7q11.21
gene_family:
alias symbol:
PMS6
alias name:
PMS2 pseudogene
entrez id:
5382
ensembl gene id:
ENSG00000067601
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_022007
hgnc_id:
HGNC:9129
approved reserved:
1997-08-15
7q11.21

PMS2P4(PMS2伪基因4)是一个伪基因,属于PMS2基因家族的一部分。PMS2基因家族主要与DNA错配修复(MMR)系统相关,其成员在维持基因组稳定性中起关键作用,通过纠正DNA复制过程中产生的错误配对碱基来防止突变积累。PMS2P4是PMS2的伪基因之一,伪基因通常是由功能基因复制或逆转录转座产生的非功能性拷贝,缺乏完整的编码能力或调控序列,因此不表达功能性蛋白。PMS2P4位于人类染色体7上,与功能基因PMS2具有高度序列相似性,但由于积累突变(如插入、缺失或终止密码子提前出现),它失去了正常功能。伪基因可能通过竞争性结合miRNA或转录因子来调控其同源功能基因的表达,但目前对PMS2P4的具体调控机制研究较少。PMS2功能基因的突变与林奇综合征(遗传性非息肉病性结直肠癌,HNPCC)密切相关,该综合征患者因DNA错配修复缺陷导致癌症易感性显著增加。尽管PMS2P4本身不直接参与疾病发生,但其序列变异可能通过影响PMS2的表达或功能间接发挥作用。目前尚未明确报道PMS2P4过表达或低表达对机体的直接影响,但伪基因的异常表达可能干扰正常基因调控网络。PMS2基因家族的共性在于参与DNA修复和基因组稳定性维护,其功能成员(如PMS2、MLH1、MSH2等)形成复合物识别并修复错配碱基。伪基因如PMS2P4可能作为进化残留物或潜在调控元件存在,但其生物学意义仍需进一步研究。

Nucleotide sequence of PMS2P4:[NCBI]
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SNP variants of PMS2P4:           Showing partial SNPs
rs559935       rs1136533       rs2421299       rs2421300       rs2421302       rs3206481       rs3873638       rs3873639       rs3962080       rs3962092       rs3962093       rs3980818       rs3980819       rs3980878       rs3980880       rs3980894       rs3980896      

Tissue expression of PMS2P4:    [UniProt]

Gene expression across tissues
Forward Primer
Forward Tm
Reverse Primer
Reverse Tm
Score
TGGTACTGAGTCTAAGCACTG
59
GCTTTAGATCTAGAATATTGGTGGC
60
TTGAAGGCTTAACGATGTCAC
59
CCATCGTGATCAAACACCA
58
TTTGAAGGCTTAACGATGTCAC
60
CATCGTGATCAAACACCAGTC
60
TACTGAGTCTAAGCACTGCG
60
GCTTTAGATCTAGAATATTGGTGGC
60
GAGTGGATCTCATTGAAGTTTCAG
60
TGTGATGTTTCAGACTTAAGCC
59
CTTTGAAGGCTTAACGATGTC
58
ATCGTGATCAAACACCAGTC
58

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