PMS2P9 (PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 9)

symbol:
PMS2P9
locus group:
pseudogene
location:
7q11.23
gene_family:
alias symbol:
PMSR5
alias name:
None
entrez id:
100132832
ensembl gene id:
ENSG00000233448
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_028058
hgnc_id:
HGNC:9135
approved reserved:
1997-08-15
7q11.23

PMS2P9(PMS2 pseudogene 9)是PMS2基因的一个假基因,属于错配修复(MMR)基因家族的成员。假基因通常不编码功能性蛋白,而是与功能基因具有相似的序列结构。PMS2P9位于人类染色体7号上,与功能基因PMS2高度同源,但因其序列中存在终止密码子或移码突变而失去编码能力。PMS2基因本身在DNA错配修复中起关键作用,负责纠正DNA复制过程中产生的碱基错配,维持基因组稳定性。PMS2P9作为假基因,可能通过转录或转录后调控影响PMS2的表达或功能。目前关于PMS2P9的具体生物学功能研究较少,但假基因通常可能通过竞争性结合miRNA或转录因子来调节其同源功能基因的表达。PMS2基因的突变或功能缺失与林奇综合征(遗传性非息肉病性结直肠癌,HNPCC)密切相关,导致错配修复缺陷和微卫星不稳定性(MSI),增加癌症风险。尽管PMS2P9本身不编码蛋白,但其序列变异或拷贝数变化可能通过干扰PMS2的表达或功能间接影响DNA修复机制。PMS2P9的过表达可能竞争性抑制PMS2的正常功能,从而削弱错配修复能力,增加突变积累和癌症风险;而降低表达则可能减轻这种干扰,但具体机制尚不明确。PMS2基因属于MMR基因家族,该家族还包括MLH1、MSH2、MSH6等成员,共同参与识别和修复DNA复制错误。MMR基因的共性是通过形成复合物(如MutSα、MutLα)识别错配碱基,启动修复过程,维持基因组稳定性。若PMS2P9的调控异常影响PMS2功能,可能间接导致MMR系统缺陷,与肿瘤发生发展相关。未来研究需进一步探索PMS2P9在表观遗传调控或癌症中的潜在作用。

Nucleotide sequence of PMS2P9:[NCBI]
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SNP variants of PMS2P9:           Showing partial SNPs
rs2903897       rs3960437       rs3972514       rs3972515       rs3972517       rs3972519       rs3972521       rs3972797       rs4092151       rs4332067       rs5009264       rs6963186       rs7786205       rs7792256       rs7796770       rs7805627       rs9649187      

Tissue expression of PMS2P9:    [UniProt]

Gene expression across tissues
Forward Primer
Forward Tm
Reverse Primer
Reverse Tm
Score
GTGGTACTGAGTCTAAGCAC
58
AGCTTTAGATCACATTAGTGGC
59
ACTTTGTGCACAGTGATGTC
59
CATCGTGATCAAACACCAGTC
60
CTTTGTGCACAGTGATGTC
57
CCATCGTGATCAAACACCA
58

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